資源
J-GLOBAL ID:202010020804838122
研究資源コード:NBDC02291
更新日:2020年07月09日
Omics Discovery Index: OmicsDI
Omics Discovery Index: OmicsDI
保有機関:
-
European Molecular Biology Laboratory (EMBL)
-
National Center for Protein Sciences
資源分類:
データ・データベース
タグ【対象】 (5件):
ゲノム/遺伝子
, タンパク質
, 代謝物
, 化学物質
, 健康/疾患
タグ【データの種類】 (3件):
発現
, 分布
, ポータル
生物種 (1件):
All (NCBI Taxonomy ID: 1)
概要:
複数のレポジトリからのオミックスデータ(トランスクリプトミクス、ゲノミクス、プロテオミクス、メタボロミクス)を統合し、検索を可能にしたリソースです。ArrayExpress、PRIDE、MassIVE、EGAなどからのメタデータと生物実体のデータをOmicsDI XML形式に変換し、PubMed、ChEBI、UniProtなどを用いてアノテーションと索引付けをすることで統合されたデータを検索することが可能です。類似のデータセットを計算して表示する機能もあります。また、APIが用意されており、プログラムからの利用も可能です。
作成機関:
FAIRsharing
レコード管理者:
See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件:
Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license
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