資源
J-GLOBAL ID:202010020804838122   研究資源コード:NBDC02291 更新日:2020年07月09日

Omics Discovery Index: OmicsDI

Omics Discovery Index: OmicsDI
保有機関:
  • European Molecular Biology Laboratory (EMBL)
  • National Center for Protein Sciences
資源分類: データ・データベース
タグ【対象】 (5件): ゲノム/遺伝子 ,  タンパク質 ,  代謝物 ,  化学物質 ,  健康/疾患
タグ【データの種類】 (3件): 発現 ,  分布 ,  ポータル
生物種 (1件): All (NCBI Taxonomy ID: 1)
概要:
複数のレポジトリからのオミックスデータ(トランスクリプトミクス、ゲノミクス、プロテオミクス、メタボロミクス)を統合し、検索を可能にしたリソースです。ArrayExpress、PRIDE、MassIVE、EGAなどからのメタデータと生物実体のデータをOmicsDI XML形式に変換し、PubMed、ChEBI、UniProtなどを用いてアノテーションと索引付けをすることで統合されたデータを検索することが可能です。類似のデータセットを計算して表示する機能もあります。また、APIが用意されており、プログラムからの利用も可能です。
作成機関: FAIRsharing
レコード管理者: See the corresponding part in the FAIRsharing record
本レコードの利用条件: Creative Commons Attribution and Share-alike (CC-BY-SA) International 4.0 license

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