CRISPRlnc

保有機関：

Xishuangbanna Tropical Botanical Garden, Chinese Academy of Sciences

資源分類：データ・データベース

タグ【対象】 (2件)：ゲノム/遺伝子 , RNA

タグ【データの種類】 (3件)：手法 , 配列 , 書誌/ドキュメント

生物種 (8件)： Homo sapiens (NCBI Taxonomy ID: 9606) , Mus musculus (NCBI Taxonomy ID: 10090) , Rattus norvegicus (NCBI Taxonomy ID: 10116) , Sus scrofa (NCBI Taxonomy ID: 9823) , Oryctolagus cuniculus (NCBI Taxonomy ID: 9986) , Danio rerio (NCBI Taxonomy ID: 7955) , Drosophila melanogaster (NCBI Taxonomy ID: 7227) , Solanum lycopersicum (NCBI Taxonomy ID: 4081)

概要：

CRISPR/Cas9システムにおける長鎖ノンコーディングRNA(lncRNA)用のガイドRNA(sgRNA)のデータベースです。lncRNAのID、ゲノム上の位置、配列や機能とともに、ペアとなるsgRNAの配列、protoacceptor-motif (PAM)、CRISPRのタイプおよび妥当性についての情報を格納しています。遺伝子名や生物種などでlncRNAやsgRNAを検索できる他、BLAST検索やGBrowseでの表示機能も備えています。データの一括ダウンロードも可能です。

作成機関： NBDC

レコード管理者： Integbio Database Catalog

本レコードの利用条件： Creative Commons CC0 license

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