- 2018 - 2022 脊索形質獲得の分子基盤:脊索動物の誕生・起源・進化
- 2015 - 2018 脊索動物誕生の進化発生学的基盤:脊索形質獲得進化とオタマジャクシ型幼生の出現
- 2013 - 2016 イソギンチャク-褐虫藻共生実験系の確立:サンゴ共生のモデル化を目指して
- 2012 - 2015 脊索動物門誕生の基盤研究:脊索形質獲得の進化発生学的解析
- 2008 - 2010 脊索-神経相互作用による脊索動物体制進化の分子基盤
- 2005 - 2007 脊索動物誕生の分子基盤-進化発生生物学的アプローチ-
- 2002 - 2004 脊索形成の分子機構に関する進化発生生物学的研究
- 1998 - 1998 ホヤ胚の脊索形成にかかわる遺伝子カスケードの解析
- 1997 - 1997 ホヤ胚の脊索形成に関わる遺伝子カスケードの解析
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