文献

J-GLOBAL ID：202102210384272042   整理番号：21A0077444

トマト(Solanum lycopersicum L.)における病原性関連蛋白質-1(PR-1)遺伝子:乾燥ストレスに応答したバイオインフォマティクス解析および発現プロファイル【JST・京大機械翻訳】

Pathogenesis related protein-1 (PR-1) genes in tomato (Solanum lycopersicum L.): Bioinformatics analyses and expression profiles in response to drought stress

著者 (3件)： Akbudak M. Aydin (Akdeniz University, Department of Agricultural Biotechnology, Antalya, Turkey) ,  Yildiz Sukran (Akdeniz University, Department of Agricultural Biotechnology, Antalya, Turkey) ,  Filiz Ertugrul (Duzce University, Department of Crop and Animal Production, Cilimli Vocational School, 81750 Cilimli, Duzce, Turkey)
資料名： Genomics  (Genomics)
巻： 112  号： 6  ページ： 4089-4099  発行年： 2020年 
JST資料番号： T0422A  ISSN： 0888-7543  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 病原性関連蛋白質1(PR-1)遺伝子ファミリーは,生物的および非生物的ストレスに応答して植物代謝において重要な役割を果たす。本研究はトマト(Solanum lycopersicum L.)におけるPR-1遺伝子のゲノムワイド同定とバイオインフォマティクス分析を目的とした。分析は,CAPスーパーファミリー(PF00188)に属する蛋白質を産生する,それぞれ13の新規SlPR-1遺伝子の同定をもたらした。KEGGアノテーション分析は,SlPR-1蛋白質が環境情報処理(09130)で機能することを明らかにした。干ばつストレス下でのFusarium oxysporum感受性および耐性トマト品種において,PR-1遺伝子の発現パターンおよびいくつかのストレス関連生理学的パラメータを調べた。干ばつストレスは,すべてのSlPR-1遺伝子の上方制御を誘導し,最大50倍に達した。結果は,SlPR-1遺伝子が干ばつに応答して活発な役割を果たすことを示した。これは,トマトにおける非生物的ストレス,干ばつ下のSlPR-1遺伝子の発現プロファイルを示す最初の研究である。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  *タンパク質 ,  *トマト ,  干ばつ ,  品種 ,  Fusarium oxysporum ,  遺伝子発現 ,  アップレギュレーション ,  アノテーション
準シソーラス用語： *バイオインフォマティクス ,  *乾燥ストレス ,  非生物的ストレス ,  遺伝子ファミリー ,  遺伝子発現パターン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 遺伝子発現 ,  非生物的ストレス ,  RT-qPCR ,  MDA ,  H_2O_2

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  野菜  (FC03043X)

タイトルに関連する用語 (9件)： トマト ,  Solanum ,  病原性関連蛋白質 ,  Pr ,  遺伝子 ,  乾燥ストレス ,  応答 ,  バイオインフォマティクス解析 ,  発現プロファイル