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J-GLOBAL ID：202102210891331545   整理番号：21A0099487

DNAメチル化のゲノムワイド解析は糖尿病性網膜症のない慢性(≧30年)2型糖尿病の個人におけるエピジェネティックバイオマーカーとしてのS100A13を同定する【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide analysis of DNA methylation identifies S100A13 as an epigenetic biomarker in individuals with chronic (≧ 30 years) type 2 diabetes without diabetic retinopathy

著者 (16件)： Li Tao (Shanghai Eye Diseases Prevention & Treatment Center/Shanghai Eye Hospital, Shanghai, China) ,  Li Tao (Department of Ophthalmology, Shanghai General Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Xu Yi (Shanghai Eye Diseases Prevention & Treatment Center/Shanghai Eye Hospital, Shanghai, China) ,  Xu Yi (Department of Ophthalmology, Shanghai General Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Shi Yongyong (Bio-X Institutes, Key Laboratory for the Genetics of Developmental and Neuropsychiatric Disorders (Ministry of Education), the Collaborative Innovation Center for Brain Science, Shanghai Jiaotong University, Shanghai, China) ,  Chen Jianhua (Shanghai Key Laboratory of Psychotic Disorders, Shanghai Mental Health Center, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Lin Senlin (Shanghai Eye Diseases Prevention & Treatment Center/Shanghai Eye Hospital, Shanghai, China) ,  Lin Senlin (Department of Ophthalmology, Shanghai General Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Zhu Jianfeng (Shanghai Eye Diseases Prevention & Treatment Center/Shanghai Eye Hospital, Shanghai, China) ,  Zhu Jianfeng (Department of Ophthalmology, Shanghai General Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Xu Xian (Shanghai Eye Diseases Prevention & Treatment Center/Shanghai Eye Hospital, Shanghai, China) ,  Xu Xian (Department of Ophthalmology, Shanghai General Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Lu Lina (Shanghai Eye Diseases Prevention & Treatment Center/Shanghai Eye Hospital, Shanghai, China) ,  Lu Lina (Department of Ophthalmology, Shanghai General Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Zou Haidong (Shanghai Eye Diseases Prevention & Treatment Center/Shanghai Eye Hospital, Shanghai, China) ,  Zou Haidong (Department of Ophthalmology, Shanghai General Hospital, Shanghai Jiaotong University School of Medicine, Shanghai, China)
資料名： Clinical Epigenetics (Web)  (Clinical Epigenetics (Web))
巻： 12  号： 1  ページ： 1-10  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7316A  ISSN： 1868-7083  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,2型糖尿病(T2DM)の被験者における糖尿病性網膜症(DR)のエピジェネティックバイオマーカーを決定することを目的とした。この後向き研究は,上海Xinjing地域予防と慢性疾患の治療管理システムに基づいている。対象は,このシステムで長期追跡評価を受けたT2DM患者であった。2つの連続研究を行った。発見コホートにおいて,DMと診断された19人の被験者のうち,DMと診断された後のDR>30歳でDRを罹患した19人の被験者の間で,Infiniumヒトメチル化850Beadchipを用いて,異なるメチル化領域(DMRs)と差次的メチル化部位(DMS)を同定した。遺伝子の機能を,KEGG濃縮分析,遺伝子オントロジー(GO)分析,および経路ネットワーク分析を通して評価した。複製コホートにおいて,短いDM期間を有する87名のDR患者およびDM期間>20年にわたるDRのない89名の患者を,ピロシークエンシングにおけるDMSとDRの間の関連を評価するために比較した。合計34のDMRsを同定した。DRと非DR参加者の間の最高5つの最も高いベータ値差を有するDMSを含む遺伝子は,染色体1に位置し,S100A13遺伝子に存在し,それは71のGO用語と関連していた。2つのS100A13遺伝子部位,すなわちcg02873163とcg11343894は,ピロシークエンシングに関してDRと良い相関を示した。S100A13遺伝子のDMSはDRの潜在的バイオマーカーである可能性がある。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 管理システム ,  *メチル化 ,  遺伝子 ,  ヒト ,  β値 ,  母集団 ,  *糖尿病性網膜症 ,  *2型糖尿病 ,  *バイオマーカー ,  *エピジェネティクス
準シソーラス用語： 慢性疾患 ,  後向き研究 ,  *DNAメチル化 ,  ピロシークエンス法 ,  遺伝子オントロジー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 糖尿病性網膜症 ,  T2DM ,  バイオマーカー ,  DNAメチル化 ,  S100A13

分類 (1件)： 代謝異常・栄養性疾患一般  (GD05010J)

引用文献 (35件)：

• Philos Trans R Soc Lond Ser B Biol Sci; What obesity research tells us about epigenetic mechanisms; NA Youngson, MJ Morris; 1; 5; 2013; 368; citation_id=CR1
• Cell.; Epigenetics: a landscape takes shape; AD Goldberg, CD Allis, E Bernstein; 128; 4; 2007; 635-638; 10.1016/j.cell.2007.02.006; citation_id=CR2
• Invest Ophthalmol Vis Sci; The role of DNA methylation in the metabolic memory phenomenon associated with the continued progression of diabetic retinopathy; M Mishra, RA Kowluru; 57; 13; 2016; 5748-5757; 10.1167/iovs.16-19759; citation_id=CR3
• Lab Investig; Dynamic DNA methylation of matrix metalloproteinase-9 in the development of diabetic retinopathy; RA Kowluru, Y Shan, M Mishra; 96; 10; 2016; 1040-1049; 10.1038/labinvest.2016.78; citation_id=CR4
• BMC Med; Genome-wide analysis of DNA methylation in subjects with type 1 diabetes identifies epigenetic modifications associated with proliferative diabetic retinopathy; E Agardh, A Lundstig, A Perfilyev, P Volkov, T Freiburghaus, E Lindholm, T Ronn, CD Agardh, C Ling; 6; 13; 2015; 182; 10.1186/s12916-015-0421-5; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (8件)： DNAメチル化 ,  ゲノム ,  解析 ,  糖尿病性網膜症 ,  慢性 ,  2型糖尿病 ,  個人 ,  同定