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J-GLOBAL ID：202102211215767120   整理番号：21A1432476

赤ハクサイのトランスクリプトーム解析は赤色紫色を調節する構造遺伝子と多重転写因子を明らかにする【JST・京大機械翻訳】

Red Chinese Cabbage Transcriptome Analysis Reveals Structural Genes and Multiple Transcription Factors Regulating Reddish Purple Color

著者 (15件)： Rameneni Jana Jeevan (Molecular Genetics and Genomics Laboratory, Department of Horticulture, College of Agriculture and Life Science, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea) ,  Choi Su Ryun (Molecular Genetics and Genomics Laboratory, Department of Horticulture, College of Agriculture and Life Science, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea) ,  Chhapekar Sushil Satish (Molecular Genetics and Genomics Laboratory, Department of Horticulture, College of Agriculture and Life Science, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea) ,  Kim Man-Sun (Molecular Genetics and Genomics Laboratory, Department of Horticulture, College of Agriculture and Life Science, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea) ,  Singh Sonam (Molecular Genetics and Genomics Laboratory, Department of Horticulture, College of Agriculture and Life Science, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea) ,  Yi So Young (Molecular Genetics and Genomics Laboratory, Department of Horticulture, College of Agriculture and Life Science, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea) ,  Oh Sang Heon (Molecular Genetics and Genomics Laboratory, Department of Horticulture, College of Agriculture and Life Science, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea) ,  Kim Hyuna (Molecular Genetics and Genomics Laboratory, Department of Horticulture, College of Agriculture and Life Science, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea) ,  Lee Chang Yeol (Molecular Genetics and Genomics Laboratory, Department of Horticulture, College of Agriculture and Life Science, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea) ,  Oh Man-Ho (Department of Biological Sciences, College of Biological Sciences and Biotechnology, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea) ,  Lee Jhongchul (Kwonnong Seed Co., 186 Pungnyeon-ro, Heungdeok-gu, Cheongju 28394, Korea) ,  Kwon Oh Ha (Kwonnong Seed Co., 186 Pungnyeon-ro, Heungdeok-gu, Cheongju 28394, Korea) ,  Park Sang Un (Department of Crop Science, College of Agriculture and Life Science, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea) ,  Kim Sun-Ju (Department of Bio-Environmental Chemistry, College of Agriculture and Life Science, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea) ,  Lim Yong Pyo (Molecular Genetics and Genomics Laboratory, Department of Horticulture, College of Agriculture and Life Science, Chungnam National University, Daejeon 34134, Korea)
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 21  号： 8  ページ： 2901  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 紅色紫ハクサイ(RPCC)は,Brassica rapa(AA=20)の一般的な品種である。それはアントシアニンに富み,多くの健康利益を有する。RPCC中のシアニジン3-(フェルロイル)ジグルコシド-5-(マロノイル)グルコシドとペラルゴニジン3-(カフェオイル)ジグルコシド-5-(マロノイル)グルコシドを含む新規アントシアニンを検出した。トランスクリプトームデータの解析は,3週齢のRPCCと緑色ハクサイ(GCC)の間の3345の差次的発現遺伝子(DEG)を含む32,395の遺伝子を明らかにした。DEGは,218の転写因子(TF)遺伝子といくつかの機能的に特性化されていない遺伝子を含んだ。トランスクリプトームデータから同定された60のDEGを,RT-qPCRによって3,6および9週齢の実生において分析し,それらの35はGCCよりRPCCにおいてより高い転写レベルを有した。アントシアニン生合成遺伝子プロモーターにおけるMYB,bHLH,WRKY,bZIPおよびAP2/ERF TFのシス調節モチーフを検出した。ネットワーク分析は,MYB75,MYB90およびMYBL2がアントシアニン生合成遺伝子と強く相互作用することを明らかにした。結果は,後期生合成遺伝子BrDFR,BrLDOX,BrUF3GT,BrUGT75c1-1,Br5MAT,BrAT-1,BrAT-2,BrTT19-1,BrTT19-2,および調節MYB遺伝子BrMYB90,BrMYB75,およびBrMYBL2-1がRPCCで高度に発現し,アントシアニン生合成,修飾,および蓄積におけるこれらの重要な役割を示す。最後に,ユニークなアントシアニン色素とRPCCに特異的な遺伝子を含むモデルアントシアニン生合成経路を提案した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  生合成 ,  *遺伝子 ,  *ハクサイ ,  品種 ,  プロモーター領域 ,  アントシアニン ,  実生 ,  *転写因子 ,  *トランスクリプトーム ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： *トランスクリプトーム解析 ,  生合成経路 ,  差次的遺伝子発現 ,  生合成遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (9件)： アントシアニン ,  アントシアニン生合成遺伝子 ,  シス調節モチーフ ,  DEG ,  ネットワーク解析 ,  qRT-PCR ,  赤紫色ハクサイ ,  トランスクリプトーム ,  転写因子

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  植物生理学一般  (EH02010Y)

引用文献 (84件)：

• Katche, E.; Quezada-Martinez, D.; Katche, E.I.; Vasquez-Teuber, P.; Mason, A.S. Interspecific hybridization for Brassica crop improvement Crop Breeding. Genet. Genom. 2019, 1, e190007.
• Wang, G.-X.; Lv, J.; Zhang, J.; Han, S.; Zong, M.; Guo, N.; Zeng, X.-Y.; Zhang, Y.-Y.; Wang, Y.-P.; Liu, F. Genetic and epigenetic alterations of Brassica nigra introgression lines from somatic hybridization: A resource for cauliflower improvement. Front. Plant Sci. 2016, 7, 1258.
• Xie, L.; Li, F.; Zhang, S.; Zhang, H.; Qian, W.; Li, P.; Zhang, S.; Sun, R. Mining for candidate genes in an introgression line by using RNA sequencing: The anthocyanin over accumulation phenotype in Brassica. Front. Plant Sci. 2016, 7, 1245.
• Lee, H.; Oh, I.-N.; Kim, J.; Jung, D.; Cuong, N.P.; Kim, Y.; Lee, J.C.; Kwon, O.; Park, S.U.; Lim, Y.P.; et al. Phenolic compound profiles and their seasonal variations in new red-phenotype head-forming Chinese cabbages. Lwt-Food Sci. Tech. 2018, 90, 433-439.
• Vogt, T. Phenylpropanoid biosynthesis. Mol. Plant 2010, 3, 2-20.

タイトルに関連する用語 (9件)： 赤 ,  ハクサイ ,  トランスクリプトーム解析 ,  赤色 ,  紫色 ,  調節 ,  構造遺伝子 ,  多重 ,  転写因子