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J-GLOBAL ID:202102211357586905   整理番号:21A0021898

マイクロRNA-9は変形性関節症患者の新規保護因子である【JST・京大機械翻訳】

microRNA-9 might be a novel protective factor for osteoarthritis patients
著者 (3件):
資料名:
巻: 157  号:ページ: 1-9  発行年: 2020年 
JST資料番号: U7386A  ISSN: 1601-5223  資料種別: 逐次刊行物 (A)
記事区分: 原著論文  発行国: イギリス (GBR)  言語: 英語 (EN)
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この研究は,変形性関節症(OA)患者に対するマイクロアレイ発現プロファイルデータセットを用い,標的化遺伝子とmiRNAを同定することを目的にした。OAと対照試料間の差次的発現遺伝子(DEG)を,limmaパッケージのBayes法を用いて同定した。その後,蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワークを構築した。PPIネットワークにおけるDEGに基づくmiRNAと転写因子(TFs)を,それぞれWebゲストaltとENCODEを用いて同定した。最後に,MCODE,遺伝子オントロジー(GO)機能,および遺伝子およびゲノム(KEGG)の京都エンシクロペディアを実施した。OAラットにおけるいくつかのDEGと予測miRNAの発現をRT-PCRによって検出した。合計594のDEGを同定した。PPIネットワークにおいて,313の上方制御されたDEGと22の下方制御されたDEGがあった。さらに,調節関係は,PPIネットワークにおけるmiRNAとDEGの間の467の上方制御された相互作用と85の下方制御された相互作用(miR-124A→QKIとMAP1B)を含んだ。下方制御されたDEG-TFs-miRNAネットワークからのモジュールは,主に低密度リポ蛋白質粒子クリアランス,リノール酸への応答,および小分子代謝プロセスBP項に富んでいた。さらに,QKI,MAP1B mRNAおよびmiR-9発現はOAラットで有意に減少した。miR-9は軟骨前駆細胞の増殖と分化の阻害を介してOA患者の保護因子である可能性がある。miR-124AはQKIとMAP1Bの標的化を通してOAの進行に重要な役割を果たす可能性がある。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】
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分類 (1件):
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遺伝子発現 
物質索引 (1件):
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引用文献 (31件):
  • Lancet; Osteoarthritis; S Glynjones, AJ Palmer, R Agricola, AJ Price, TL Vincent, H Weinans; 386; 9991; 2015; 376-387; 10.1016/S0140-6736(14)60802-3; citation_id=CR1
  • Lancet.; Global, regional, and national incidence, prevalence, and years lived with disability for 310 diseases and injuries, 1990-2015: a systematic analysis for the global burden of disease study 2015; IP Collaborators; 388; 10053; 2016; 1545-1602; 10.1016/S0140-6736(16)31678-6; citation_id=CR2
  • J Athl Train; Tibiofemoral osteoarthritis after surgical or nonsurgical treatment of anterior cruciate ligament rupture: a systematic review; KP Harris, JB Driban, MR Sitler, NM Cattano, E Balasubramanian, JM Hootman; 52; 6; 2017; 507-517; 10.4085/1062-6050-49.3.89; citation_id=CR3
  • Nat Rev Rheumatol; Macro view of microRNA function in osteoarthritis; S Miyaki, H Asahara; 8; 9; 2012; 543-552; 10.1038/nrrheum.2012.128; citation_id=CR4
  • Arthritis Res Ther; Plasma and synovial fluid microRNAs as potential biomarkers of rheumatoid arthritis and osteoarthritis; K Murata, H Yoshitomi, S Tanida, M Ishikawa, K Nishitani, H Ito; 12; 3; 2010; R86; 10.1186/ar3013; citation_id=CR5
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