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J-GLOBAL ID：202102211370456833   整理番号：21A0017760

母性効果はMegalobrama amblycephala Culter alburnusの相反交雑雑種における親対立遺伝子の代替スプライシングを形作る【JST・京大機械翻訳】

Maternal effects shape the alternative splicing of parental alleles in reciprocal cross hybrids of Megalobrama amblycephala × Culter alburnus

著者 (15件)： Ren Li (State Key Laboratory of Developmental Biology of Freshwater Fish, Hunan Normal University, Changsha, P.R. China) ,  Ren Li (College of Life Sciences, Hunan Normal University, Changsha, P.R. China) ,  Yan Xiaojing (State Key Laboratory of Developmental Biology of Freshwater Fish, Hunan Normal University, Changsha, P.R. China) ,  Yan Xiaojing (College of Life Sciences, Hunan Normal University, Changsha, P.R. China) ,  Gao Xin (State Key Laboratory of Developmental Biology of Freshwater Fish, Hunan Normal University, Changsha, P.R. China) ,  Gao Xin (College of Life Sciences, Hunan Normal University, Changsha, P.R. China) ,  Cui Jialin (State Key Laboratory of Developmental Biology of Freshwater Fish, Hunan Normal University, Changsha, P.R. China) ,  Cui Jialin (College of Life Sciences, Hunan Normal University, Changsha, P.R. China) ,  Yan Pengcheng (Tang Tang Biomedical Technology (BeiJing) Co., Ltd., Beijing, P.R. China) ,  Wu Chang (State Key Laboratory of Developmental Biology of Freshwater Fish, Hunan Normal University, Changsha, P.R. China) ,  Wu Chang (College of Life Sciences, Hunan Normal University, Changsha, P.R. China) ,  Li Wuhui (State Key Laboratory of Developmental Biology of Freshwater Fish, Hunan Normal University, Changsha, P.R. China) ,  Li Wuhui (College of Life Sciences, Hunan Normal University, Changsha, P.R. China) ,  Liu Shaojun (State Key Laboratory of Developmental Biology of Freshwater Fish, Hunan Normal University, Changsha, P.R. China) ,  Liu Shaojun (College of Life Sciences, Hunan Normal University, Changsha, P.R. China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 21  号： 1  ページ： 1-12  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 母性効果は多くの形質の様々な表現型を形成するための適応的意義に寄与する。母性効果の潜在的意味は発現多様性の原因であるが,mRNA発現および選択的スプライシング(AS)に対するこれらの効果は雑種動物において完全には解明されていない。Megalobrama amblycephala(blunt snout bet,BSB)とCulter alburnus(トコガエル,TC)のハイブリダイゼーションに続く2つの相互交雑雑種を,母性効果を調べるためのモデルとして使用した。2つの相互交雑雑種間のBSB-およびTC-相同遺伝子の発現を比較することによって,著者らは49-348の差次的に発現したBSB-相同遺伝子および54-354の差次的発現TC-相同遺伝子を同定した。2つの相互交雑雑種間の2402,2959および3418のAS事象を,それぞれ筋肉,肝臓および生殖腺のIlluminaデータで検出した。さらに,21,577(TC-ホモログ)と30,007(BSB-ホモエログ)AS事象が,PacBioデータに基づくTBF3の20,131の相同遺伝子対で見出され,一方,30,561(TC-ホモエログ)と30,305(BSB-ホモエログ)AS事象がBTF3で見つかった。これらの結果は,ホモエログレベルでAS予測をさらに改善する。骨形成蛋白質ファミリーに属するbmpr2aにおける種々のASパターンをASモデルとして選択し,発現多様性とその体形形質に対する潜在的影響を調べた。BSB-およびTC-サブゲノムにおける差次的発現遺伝子およびASの分布は,2つの逆交雑雑種間で様々な変化を示し,母性効果が発現多様性の原因であることを示唆した。これらの知見は,低脊椎動物における母性効果下でのmRNA発現変化およびASへの新規洞察を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 動物 ,  *遺伝子 ,  脊椎動物 ,  表現型 ,  *交雑 ,  生殖腺 ,  *対立遺伝子 ,  体格 ,  *母性効果 ,  *選択的スプライシング ,  骨形成因子
準シソーラス用語： ホモログ ,  相同遺伝子 ,  mRNA発現 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 母性効果 ,  選択的スプライシング ,  相互交雑ハイブリダイゼーション ,  差次的発現 ,  同祖表現

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (49件)：

• Philosophical Transact Royal Soc B: Biol Sci; What are maternal effects (and what are they not)?; JB Wolf, MJ Wade; 364; 1520; 2009; 1107-1115; citation_id=CR1
• Adv Mar Biol; Maternal effects in fish populations; BS Green; 54; 2008; 1-105; citation_id=CR2
• Ecology; Maternal age as a determinant of larval growth and survival in a marine fish, Sebastes melanops; SA Berkeley, C Chapman, SM Sogard; 85; 5; 2004; 1258-1264; citation_id=CR3
• Cell.; Genomic imprinting disrupted by a maternal effect mutation in the Dnmt1 gene; CY Howell, TH Bestor, F Ding, KE Latham, C Mertineit, JM Trasler; 104; 6; 2001; 829-838; citation_id=CR4
• Science.; Dnmt3L and the establishment of maternal genomic imprints; D Bourc'his, G-L Xu, C-S Lin, B Bollman, TH Bestor; 294; 5551; 2001; 2536-2539; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (5件)： 母性効果 ,  交雑 ,  雑種 ,  対立遺伝子 ,  代替スプライシング