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J-GLOBAL ID：202102212300192687   整理番号：21A0038931

単量体レベルにおけるヌクレオシドの水和への2→δ-ヒドロキシルの固有の寄与【JST・京大機械翻訳】

Intrinsic Contributions of 2′-Hydroxyl to the Hydration of Nucleosides at the Monomeric Level

著者 (9件)： Wang Zheng (State Key Laboratory of Oral Diseases, National Clinical, Research Center for Oral Diseases, Chinese Academy of Medical Sciences, Research Unit of Oral Carcinogenesis and Management, West China, Hospital of Stomatology, Sichuan University, 610041, Chengdu, P.R. China) ,  Liu Jiang (State Key Laboratory of Oral Diseases, National Clinical, Research Center for Oral Diseases, Chinese Academy of Medical Sciences, Research Unit of Oral Carcinogenesis and Management, West China, Hospital of Stomatology, Sichuan University, 610041, Chengdu, P.R. China) ,  Zhang Yanan (State Key Laboratory of Oral Diseases, National Clinical, Research Center for Oral Diseases, Chinese Academy of Medical Sciences, Research Unit of Oral Carcinogenesis and Management, West China, Hospital of Stomatology, Sichuan University, 610041, Chengdu, P.R. China) ,  Qi Jiajia (State Key Laboratory of Oral Diseases, National Clinical, Research Center for Oral Diseases, Chinese Academy of Medical Sciences, Research Unit of Oral Carcinogenesis and Management, West China, Hospital of Stomatology, Sichuan University, 610041, Chengdu, P.R. China) ,  Han Xianglong (State Key Laboratory of Oral Diseases, National Clinical, Research Center for Oral Diseases, Chinese Academy of Medical Sciences, Research Unit of Oral Carcinogenesis and Management, West China, Hospital of Stomatology, Sichuan University, 610041, Chengdu, P.R. China) ,  Zhao Xuefeng (State Key Laboratory of Oral Diseases, National Clinical, Research Center for Oral Diseases, Chinese Academy of Medical Sciences, Research Unit of Oral Carcinogenesis and Management, West China, Hospital of Stomatology, Sichuan University, 610041, Chengdu, P.R. China) ,  Bai Ding (State Key Laboratory of Oral Diseases, National Clinical, Research Center for Oral Diseases, Chinese Academy of Medical Sciences, Research Unit of Oral Carcinogenesis and Management, West China, Hospital of Stomatology, Sichuan University, 610041, Chengdu, P.R. China) ,  Zhao Hang (State Key Laboratory of Oral Diseases, National Clinical, Research Center for Oral Diseases, Chinese Academy of Medical Sciences, Research Unit of Oral Carcinogenesis and Management, West China, Hospital of Stomatology, Sichuan University, 610041, Chengdu, P.R. China) ,  Chen Qianming (State Key Laboratory of Oral Diseases, National Clinical, Research Center for Oral Diseases, Chinese Academy of Medical Sciences, Research Unit of Oral Carcinogenesis and Management, West China, Hospital of Stomatology, Sichuan University, 610041, Chengdu, P.R. China)
資料名： Chemistry - European Journal  (Chemistry - European Journal)
巻： 26  号： 71  ページ： 17046-17055  発行年： 2020年 
JST資料番号： W0744A  ISSN： 0947-6539  CODEN： CEUJED  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： ドイツ (DEU)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多くの報告は高分子レベルでのDNAとRNAの間の構造的差異を明らかにしたが,2′-デオキシリボヌクレオシドとの比較研究はなく,同じ条件下で単量体レベルでの2′-OH基の役割を調べた。これに触発されて,ここで,ヌクレオシド中の2′-OH基の固有の寄与を,水中の2′-デオキシ-2-アミノアデノシン(1),2-アミノアデノシン(2),および2-アミノアラビノフラノシルアデニン(3)の単結晶構造を直接解くことにより系統的に研究した。2′-OH基は単一ヌクレオシド分子の立体配座と塩基対パターンに影響しただけでなく,超分子構造全体にも基本的役割を果たした。興味深いことに,2′-OH基を含まない化合物1は強い水和を示し,一方,2および3(反対の方向における2′-OH基をもつ)は水和を示さず,それは核酸で観察されたものと完全に異なった。一方,化合物1は水分子を捕捉し,独特のトリヒドロール部分を形成し,さらに,最も単純な二重鎖DNA様構造を構築するための骨格として役立った。この目的のために,これらのユニークな構造に及ぼす生物学的環境の影響を検討するために,溶媒を水からリン酸緩衝食塩水(PBS)へ変化させた。驚くべきことに,このような微妙な調整は,水における2Dラメラ構造とPBS中の3D多孔質構造から成る全く異なる超構造をもたらした。これらの大きな形態の違いは,可変温度X線解析,SEM,および分子間相互作用エネルギー計算によっても確認された,微妙なイオン水和に起因した。要約すると,本研究では,単量体レベルでのヌクレオシドの水和に対する2′-ヒドロキシルの固有寄与を包括的に調べた。これはDNA/RNAの違いと周囲の環境の影響をさらに理解するのに役立つ。Copyright 2021 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 単結晶 ,  分子間相互作用 ,  立体配座 ,  リン酸 ,  *水和 ,  DNA【核酸】 ,  RNA【核酸】 ,  デオキシリボヌクレオシド ,  *ヌクレオシド ,  *単量体 ,  二次元 ,  三次元 ,  水分子
準シソーラス用語： 超構造 ,  二本鎖DNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 結晶成長 ,  水和 ,  水素結合 ,  ヌクレオシド ,  水化学

分類 (2件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  ヌクレオシド,ヌクレオチド  (CF10060K)

タイトルに関連する用語 (4件)： 単量体 ,  ヌクレオシド ,  水和 ,  固有