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J-GLOBAL ID：202102214420576758   整理番号：21A2060756

バイオインフォマティクス解析による食道扁平上皮癌進行に対するスルフォラフェンのp65依存性効果の同定【JST・京大機械翻訳】

Identifying the p65-Dependent Effect of Sulforaphene on Esophageal Squamous Cell Carcinoma Progression via Bioinformatics Analysis

著者 (4件)： Han Sichong ,  Wang Zhe ,  Liu Jining ,  Yuan Qipeng
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 22  号： 1  ページ： 60  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： スルホラフェン(SFE)が食道扁平上皮癌(ESCC)に影響する機構を理解することは,化学療法剤としてこのイソチオシアナートの応用に寄与する。したがって,ESCC特性のSFE調節をより深く調べることを試みた。SFE処理ESCC細胞のマイクロアレイデータで遺伝子セット濃縮分析(GSEA)を行い,異なる発現遺伝子がTNF_Signaling_via_the_NFB_Pathwayに富んでいることを見出した。GSE20347とGSE75241データセットからの発現プロファイルデータと結合して,著者らは8つの遺伝子にセットを狭めて,そのうちの4つ(C-X-Cモチーフケモカインリガンド10(CXCL10),TNFα誘導蛋白質3(TNFAIP3),インヒビンサブユニットベータA(INHBA),およびプラスミノーゲン活性化因子,ウロキナーゼ(PLAU))をSFEの標的として検証した。癌ゲノムアトラス(TCGA)からの182ESCCサンプルのRNA配列(RNA-seq)データを,CXCL10,TNFAIP3,INHBA,およびPLAUの発現に従って,GSEAの2つの表現型に分類した。濃縮結果は,それらが全てNFB経路に関与することを証明した。シストロームデータベースから得たChIP-seq分析は,NFB-p65がCXCL10,TNFAIP3,INHBA,およびPLAUの転写を制御し,TNFAIP3とPLAUが,最も有意に異なる発現遺伝子であり,クロマチン免疫沈降-ポリメラーゼ連鎖反応(ChIP-PCR)を用いて,それらの発現に対するp65の調節を検証した。結果は,SFEがp65依存的にTNFAIP3とPLAU発現のダウンレギュレーションによりESCC進行を抑制することを示した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  ローム ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  表現型 ,  イソチオシアン酸塩 ,  ダウンレギュレーション ,  PCR法 ,  TNFα ,  DNAマイクロアレイ
準シソーラス用語： クロマチン免疫沈降反応 ,  *食道扁平上皮癌 ,  *バイオインフォマティクス ,  シスト ,  *p65 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： スルフォラフェン ,  食道扁平上皮癌 ,  NFκB ,  TNFAIP3 ,  PLAU

分類 (2件)： 免疫反応一般  (ED03010T) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

引用文献 (35件)：

• Prabhu, A.; Obi, K.O.; Rubenstein, J.H. The synergistic effects of alcohol and tobacco consumption on the risk of esophageal squamous cell carcinoma: A meta-analysis. Am. J. Gastroenterol. 2014, 109, 822-827.
• Freedman, N.D.; Park, Y.; Subar, A.F.; Hollenbeck, A.R.; Leitzmann, M.F.; Schatzkin, A.; Abnet, C.C. Fruit and vegetable intake and esophageal cancer in a large prospective cohort study. Int. J. Cancer 2007, 121, 2753-2760.
• Cools-Lartigue, J.; Spicer, J.; Ferri, L.E. Current status of management of malignant disease: Current management of esophageal cancer. J. Gastrointest. Surg. 2015, 19, 964-972.
• Kuang, P.Q.; Song, D.; Yuan, Q.P.; Lv, X.H.; Zhao, D.; Liang, H. Preparative separation and purification of sulforaphene from radish seeds by high-speed countercurrent chromatography. Food Chem. 2013, 136, 309-315.
• Kuang, P.Q.; Song, D.; Yuan, Q.P.; Yi, R.; Lv, X.H.; Liang, H. Separation and purification of sulforaphene from radish seeds using macroporous resin and preparative high-performance liquid chromatography. Food Chem. 2013, 136, 342-347.

タイトルに関連する用語 (5件)： バイオインフォマティクス解析 ,  食道扁平上皮癌 ,  p65 ,  依存性 ,  同定