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J-GLOBAL ID：202102214758329001   整理番号：21A0014232

非動脈性前部虚血性視神経症の末梢血におけるcircRNAのトランスクリプトーム解析【JST・京大機械翻訳】

Transcriptomic Analysis of circRNAs in the Peripheral Blood of Nonarteritic Anterior Ischemic Optic Neuropathy

著者 (9件)： Suo Jinshan (Department of Ophthalmology, The Fourth Affiliated Hospital of China Medical University, Key Laboratory of Lens Research of Liaoning Province, Eye Hospital of China Medical University, Shenyang, 110005 Liaoning Province, China) ,  Xu Xinling (Department of Ophthalmology, The Fourth Affiliated Hospital of China Medical University, Key Laboratory of Lens Research of Liaoning Province, Eye Hospital of China Medical University, Shenyang, 110005 Liaoning Province, China) ,  Xu Haoyan (Department of Ophthalmology, The Fourth Affiliated Hospital of China Medical University, Key Laboratory of Lens Research of Liaoning Province, Eye Hospital of China Medical University, Shenyang, 110005 Liaoning Province, China) ,  Hou Naifang (Department of Ophthalmology, The Fourth Affiliated Hospital of China Medical University, Key Laboratory of Lens Research of Liaoning Province, Eye Hospital of China Medical University, Shenyang, 110005 Liaoning Province, China) ,  Zhang Jiaming (Department of Ophthalmology, The Fourth Affiliated Hospital of China Medical University, Key Laboratory of Lens Research of Liaoning Province, Eye Hospital of China Medical University, Shenyang, 110005 Liaoning Province, China) ,  Han XIao (Department of Ophthalmology, The Fourth Affiliated Hospital of China Medical University, Key Laboratory of Lens Research of Liaoning Province, Eye Hospital of China Medical University, Shenyang, 110005 Liaoning Province, China) ,  Zheng Yanwen (Department of Ophthalmology, The Fourth Affiliated Hospital of China Medical University, Key Laboratory of Lens Research of Liaoning Province, Eye Hospital of China Medical University, Shenyang, 110005 Liaoning Province, China) ,  Wang Xinling (Department of Ophthalmology, The Fourth Affiliated Hospital of China Medical University, Key Laboratory of Lens Research of Liaoning Province, Eye Hospital of China Medical University, Shenyang, 110005 Liaoning Province, China) ,  Han Xiao (Department of Ophthalmology, The Fourth Affiliated Hospital of China Medical University, Key Laboratory of Lens Research of Liaoning Province, Eye Hospital of China Medical University, Shenyang, 110005 Liaoning Province, China)
資料名： BioMed Research International (Web)  (BioMed Research International (Web))
巻： 2020  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7008A  ISSN： 2314-6133  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究の目的は,非動脈性前虚血性視神経障害(NAION)を有する被験者の末梢血における円形RNA(circRNAs)の発現プロファイル変化を調査し,NAIONなしで,差次的発現結果を分析し,疾患発生におけるcirRNAsの役割を予測し,治療および診断のための新規アイデアおよび方法を提供することである。6名のNAION患者と5名の健常対照者の末梢血におけるRNAの発現プロファイルを探索するハイスループット配列決定を適用した。品質制御は,元のデータからの高度なデータを得て,不統一データを tickらした。次に,クラスタ分析,火山プロット,共発現ネットワーク,および蛋白質-蛋白質相互作用ネットワーク(PPI)を実施した。遺伝子オントロジー(GO)分析と遺伝子およびゲノム(KEGG)経路の京都エンシクロペディアを用いて,全発現遺伝子を分析した。最後に,定量的リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応(qRT-PCR)を用いて,それらの有意に差次的に発現したサーコRNAsを検証し,いくつかのバイオインフォマティクス解析と12人のNAION患者と12人の対照における予測を行った。NAION患者の末梢血における49の循環RNAの発現には有意差があり,その中で24の上方制御と25の下方制御(変動[数式:原文を参照]と[数式:原文を参照])があり,hsa_circ_0005583,hsa_circ_0003922,hsa_circ_0002021,およびhsa_circ_0000462は,有意に下方制御された(変動[数式:原文を参照]と[数式:原文を参照]),特に,最も有意に変化した1つ([数式:原文を参照]),および神経変性,酸化ストレス,免疫,および代謝などの過程に関係することが確認された。NAION患者の末梢血における循環RNAの発現プロファイルは有意に変化し,疾患の理解を深める。Copyright 2020 Jinshan Suo et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 品質管理 ,  ネットワーク ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *動脈 ,  クラスタ分析 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  *末梢血 ,  酸化ストレス
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  *トランスクリプトーム解析 ,  ハイスループット ,  共発現 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (4件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (46件)：

• N. R. Miller, A. C. Arnold, "Current concepts in the diagnosis, pathogenesis and management of nonarteritic anterior ischaemic optic neuropathy," Eye, vol. 29, no. 1, pp. 65-79, 2015.
• A. C. Arnold, "The 14th Hoyt lecture," Journal of Neuro-Ophthalmology, vol. 37, no. 2, pp. 220, 2017.
• S. Berry, W. V. Lin, A. Sadaka, A. G. Lee, "Nonarteritic anterior ischemic optic neuropathy: cause, effect, and management," Eye Brain, vol. 9, pp. 23-28, 2017.
• M. S. Lee, D. Grossman, A. C. Arnold, F. A. Sloan, "Incidence of nonarteritic anterior ischemic optic neuropathy: increased risk among diabetic patients," Ophthalmology, vol. 118, no. 5, pp. 959-963, 2011.
• D. Reddy, P. K. Rani, S. Jalali, H. L. Rao, "A study of prevalence and risk factors of diabetic retinopathy in patients with non-arteritic anterior ischemic optic neuropathy (NA-AION)," Seminars in Ophthalmology, vol. 30, no. 2, pp. 101-104, 2015.

タイトルに関連する用語 (5件)： 動脈 ,  前部虚血性視神経症 ,  末梢血 ,  circRNA ,  トランスクリプトーム解析