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J-GLOBAL ID：202102214759757985   整理番号：21A2111510

天然および自然にヒントを得た製品の院内ライブラリーからの推定SARS-CoV-2 Mpro阻害剤:仮想スクリーニングおよび分子ドッキング研究【JST・京大機械翻訳】

Putative SARS-CoV-2 Mpro Inhibitors from an In-House Library of Natural and Nature-Inspired Products: A Virtual Screening and Molecular Docking Study

著者 (4件)： Mazzini Stefania (Department of Food, Environmental and Nutritional Sciences, Universita degli Studi di Milano, via Celoria 2, I-20133 Milano, Italy) ,  Musso Loana (Department of Food, Environmental and Nutritional Sciences, Universita degli Studi di Milano, via Celoria 2, I-20133 Milano, Italy) ,  Dallavalle Sabrina (Department of Food, Environmental and Nutritional Sciences, Universita degli Studi di Milano, via Celoria 2, I-20133 Milano, Italy) ,  Artali Roberto (Scientia Advice di Roberto Artali, 20832 Desio, MB, Italy)
資料名： Molecules (Web)  (Molecules (Web))
巻： 25  号： 16  ページ： 3745  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7014A  ISSN： 1420-3049  CODEN： MOLEFW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 新たなコロナウイルス(重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2,SARS-CoV-2)は最近の世界的流行の原因となっている。この生命を脅かすウイルスの高度に伝染する性質は,その拡散を打ち消す治療を見出すことを不可避にする。SARS-CoV-2の主なプロテアーゼ(Mpro)は,宿主内のウイルス複製における不可欠な役割により有望な薬物標的である。仮想スクリーニングと分子ドッキング技術の組み合わせ2段階アプローチを用いて,主に天然と自然由来化合物から成る小分子のインハウス収集をスクリーニングした。分子は,酵素ポケットに広範囲の化学空間をカバーするために,高い構造多様性で選択した。仮想スクリーニング実験をAutoDock Vinaソフトウェアのブラインドドッキングモードを用いて行った。仮想スクリーニングにより,SARS-CoV-2 Mproの酵素部位と効果的に相互作用できる構造的に不均一な化合物の選択が可能になった。蛋白質との最良の相互作用を示す化合物は,AutoDockで実行される分子ドッキングによって再スコア化されたが,錯体の安定性は分子動力学によって試験された。最も有望な候補は,蛋白質結合ポケットに適合し,触媒ダイアドに達する良好な能力を明らかにした。選択した足場の少なくとも1つが更なる研究のために有望であるという高い確率がある。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *ドッキング ,  酵素 ,  タンパク質 ,  ペプチド結合ヒドロラーゼ ,  タンパク質結合 ,  ソフトウェア ,  ウイルス複製 ,  小分子 ,  分子動力学
準シソーラス用語： コロナウイルス ,  スコア化 ,  *分子ドッキング ,  *バーチャルスクリーニング ,  AutoDock , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： COVID-19 ,  コロナウイルス ,  感染症 ,  天然物ライブラリ ,  分子ドッキング ,  分子モデリング

分類 (1件)： 抗ウイルス薬の基礎研究  (GW17040O)

引用文献 (60件)：

• Hui, D.S.; Azhar, E.I.; Madani, T.A.; Ntoumi, F.; Kock, R.; Dar, O.; Ippolito, G.; McHugh, T.D.; Memish, Z.A.; Drosten, C.; et al. The continuing 2019-nCoV epidemic threat of novel coronaviruses to global health-The latest 2019 novel coronavirus outbreak in Wuhan, China. Int. J. Infect. Dis. 2020, 91, 264-266.
• Wu, F.; Zhao, S.; Yu, B.; Chen, Y.M.; Wang, W.; Song, Z.G.; Hu, Y.; Tao, Z.W.; Tian, J.H.; Pei, Y.Y.; et al. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature 2020, 579, 265-269.
• WHO Director-General’s Opening Remarks at the Media Briefing on COVID-19-11th March 2020. Available online: https://www.who.int/dg/speeches/detail/who-director-general-s-opening-remarks-at-the-media-briefing-on-covid-19 (accessed on 15 March 2020).
• Maier, H.; Bickerton, E.; Britton, P. Coronaviruses. Methods and Protocols. Methods in Molecular Biology; Springer: Berlin, Germany, 2015; p. 1282.
• Cui, J.; Li, F.; Shi, Z.L. Origin and evolution of pathogenic coronaviruses. Nat. Rev. Microbiol. 2019, 17, 181-192.

タイトルに関連する用語 (8件)： ヒント ,  ライブラリー ,  推定 ,  SARS-CoV-2 ,  阻害剤 ,  仮想スクリーニング ,  分子ドッキング ,  研究