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J-GLOBAL ID：202102215196561215   整理番号：21A2844858

デンマークの廃水環境における培養可能な大腸菌ファージの顕著な多様性の調査【JST・京大機械翻訳】

Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment

著者 (5件)： Olsen Nikoline S. (Department of Environmental Science, Aarhus University, Frederiksborgvej 399, 4000 Roskilde, Denmark) ,  Olsen Nikoline S. (Department of Plant and Environmental Sciences, University of Copenhagen, Thorvaldsensvej 40, 1871 Frederiksberg C, Denmark) ,  Forero-Junco Laura (Department of Plant and Environmental Sciences, University of Copenhagen, Thorvaldsensvej 40, 1871 Frederiksberg C, Denmark) ,  Kot Witold (Department of Plant and Environmental Sciences, University of Copenhagen, Thorvaldsensvej 40, 1871 Frederiksberg C, Denmark) ,  Hansen Lars H. (Department of Plant and Environmental Sciences, University of Copenhagen, Thorvaldsensvej 40, 1871 Frederiksberg C, Denmark)
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 12  号： 9  ページ： 986  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ファージは細菌多様性を駆動し,微生物群落を微生物群から地球生物地球化学的循環の駆動者へ大きく影響する。Escherichia coli(MG1655,K-12)ファージの理解を広げることを目的として,188のデンマークの廃水サンプルをスクリーニングし,136のファージを分離した。これらのうちの92は既知のファージと95%未満の類似性を持つゲノム配列を持ち,一方,既存の属に対するほとんどのマップは新しい系統を代表する。分離したファージは高度に多様であり,デンマークの廃水における培養可能な毒性dsDNA Escherichiaファージの真の多様性の約1/3を占めると推定されているが,ほとんど半分(40%)はメタゲノムデータベースで代表されず,多様性を明らかにするためにファージを単離することの重要性を強調する。7つのウイルス科,Myoviridae,Siphoviridae,Podoviridae,Drexlerviridae,Chaseviridae,Autographidae,およびMicroviridaeをデータセットで表現した。それらのゲノムは5.3kbから170.8kbの長さで劇的に変化し,グアニンとシトシン(GC)含量は35.3%から60.0%の範囲であった。したがって,モデル宿主細菌に対してさえ,実質的な多様性は解明されていない。これらの結果は,大腸菌ファージ多様性の範囲を拡大,強調し,ファージ多様性と生態学を完全に解読する方法を示した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *廃水 ,  地球 ,  細菌 ,  *大腸菌 ,  *バクテリオファージ ,  ゲノム ,  Escherichia ,  ミクロフローラ ,  生態学
準シソーラス用語： *大腸菌ファージ ,  二本鎖DNA ,  ゲノム配列 ,  メタゲノム ,  細菌多様性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： バクテリオファージ ,  廃水 ,  大腸菌 ,  多様性 ,  ゲノミクス ,  分類学 ,  コリファージ

分類 (1件)： 下水,廃水の生物学的処理  (SC03060H)

引用文献 (80件)：

• Weinbauer, M.G.; Rassoulzadegan, F. Are viruses driving microbial diversification and diversity? Environ. Microbiol. 2003, 6, 1-11.
• Weitz, J.S.; Wilhelm, S.W. Ocean viruses and their effects on microbial communities and biogeochemical cycles. F1000 Biol. Rep. 2012, 4, 17.
• Crummett, L.T.; Puxty, R.J.; Weihe, C.; Marston, M.F.; Martiny, J.B. The genomic content and context of auxiliary metabolic genes in marine cyanomyoviruses. Virology 2016, 499, 219-229.
• Boyd, E.F. Bacteriophage-Encoded Bacterial Virulence Factors and Phage-Pathogenicity Island Interactions. Adv. Virus Res. 2012, 82, 91-118.
• Fortier, L.-C.; Sekulovic, O. Importance of prophages to evolution and virulence of bacterial pathogens. Virulence 2013, 4, 354-365.

タイトルに関連する用語 (7件)： デンマーク ,  廃水 ,  環境 ,  培養 ,  大腸菌ファージ ,  多様性 ,  調査