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J-GLOBAL ID：202102215240743872   整理番号：21A2704785

脳組織発現を伴う遺伝的変異の統合的研究は多発性硬化症のウイルス病因と潜在的薬物標的を同定する【JST・京大機械翻訳】

An integrative study of genetic variants with brain tissue expression identifies viral etiology and potential drug targets of multiple sclerosis

著者 (7件)： Manuel Astrid M. (Center for Precision Health, School of Biomedical Informatics, The University of Texas Health Science Center at Houston, Houston, TX 77030, USA) ,  Dai Yulin (Center for Precision Health, School of Biomedical Informatics, The University of Texas Health Science Center at Houston, Houston, TX 77030, USA) ,  Freeman Leorah A. (Department of Neurology, Dell Medical School, The University of Texas at Austin, Austin, TX 78712, USA) ,  Jia Peilin (Center for Precision Health, School of Biomedical Informatics, The University of Texas Health Science Center at Houston, Houston, TX 77030, USA) ,  Zhao Zhongming (Center for Precision Health, School of Biomedical Informatics, The University of Texas Health Science Center at Houston, Houston, TX 77030, USA) ,  Zhao Zhongming (Human Genetics Center, School of Public Health, The University of Texas Health Science Center at Houston, Houston, TX 77030, USA) ,  Zhao Zhongming (Department of Biomedical Informatics, Vanderbilt University Medical Center, Nashville, TN 37203, USA)
資料名： Molecular and Cellular Neuroscience  (Molecular and Cellular Neuroscience)
巻： 115  ページ： Null  発行年： 2021年 
JST資料番号： W0279A  ISSN： 1044-7431  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 多発性硬化症(MS)は慢性障害につながる神経炎症性疾患である。MSにおける脳病変は,正常出現白質(NAWM)において通常発生する。ゲノムワイド関連研究(GWAS)はMSに関連する遺伝的変異を同定した。NAWMの症例対照研究においてトランスクリプトーム変化が観察された。ネットワークベースツール,Edge-Weighted Wood Modewor of GWAS(EW_dmGWAS)に対するクロスデータセット評価(CDE)機能を開発した。著者らは,CDEを適用して,参照ネットワークとしてヒト蛋白質インタラクトームを用いて,合計38のNAWM発現サンプルを有する41,505症例および対照の公的に利用可能なMS GWAS要約統計を統合し,MS病因の生物学的基礎を検討した。MS関連組織:14脳組織および4免疫関連組織に対するGTEx Consortium発現データを用い,GWASおよび発現量的形質遺伝子座(eQTL)シグナルの共局在化により,得られたモジュールを検証した。他のネットワーク評価は,薬物標的クエリと機能的遺伝子セット濃縮分析を含んだ。CDEは55のユニークな遺伝子を含むMS NAWMネットワークを優先した。遺伝子リストは,GWAS-eQTL共局在化遺伝子:CDK4,IFITM3,MAPK1,MAPK3,METTL12BおよびPIK3R2による濃縮(p値=2.34×10-7)であった。得られたネットワークもFDA承認薬の薬物シグネチャを含んでいた。遺伝子セット濃縮分析は,他のウイルス経路の中で,トップ機能項「ウイルスの細胞内輸送」を明らかにした。得られたネットワーク:CDK4,IFITM3,MAPK1,MAPK3,METTL12BおよびPIK3R2から重要な遺伝子を優先した。豊富な薬物シグネチャは,MSのための潜在的薬物標的と薬物再配置戦略を示唆する。最後に,優先遺伝子セットと機能的濃縮分析に基づいて,潜在的MSウイルス開始の機構を提案した。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  ヒト ,  白質 ,  *多発性硬化症 ,  細胞内輸送 ,  *病因 ,  症例対照研究 ,  トランスクリプトーム ,  ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： *遺伝的変異 ,  *脳組織 ,  インタラクトーム ,  炎症性疾患 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 多発性硬化症(MS) ,  ゲノムワイド関連研究(GWAS) ,  正常に出現する白質(NAWM) ,  GWAS(EW dmGWAS)の高密度モジュール探索 ,  発現量的形質遺伝子座(eQTL)

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  免疫性疾患・アレルギー性疾患一般  (GD04010C)

タイトルに関連する用語 (10件)： 脳組織 ,  発現 ,  遺伝的変異 ,  統合 ,  研究 ,  多発性硬化症 ,  ウイルス ,  病因 ,  薬物標的 ,  同定