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J-GLOBAL ID：202102215494146878   整理番号：21A0098453

ネットワーク薬理学解析と分子ドッキングによるCOVID-19に対するコールドダンプペスト処方の潜在的なメカニズム予測【JST・京大機械翻訳】

Potential mechanism prediction of Cold-Damp Plague Formula against COVID-19 via network pharmacology analysis and molecular docking

著者 (9件)： Han Lin (Guang’anmen Hospital, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing, China) ,  Wei Xiu-Xiu (Beijing University of Chinese Medicine, Beijing, China) ,  Zheng Yu-Jiao (Beijing University of Chinese Medicine, Beijing, China) ,  Zhang Li-Li (Guang’anmen Hospital, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing, China) ,  Wang Xin-Miao (Guang’anmen Hospital, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing, China) ,  Yang Hao-Yu (Beijing University of Chinese Medicine, Beijing, China) ,  Ma Xu (Gansu University of Chinese Medicine, Lanzhou, China) ,  Zhao Lin-Hua (Guang’anmen Hospital, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing, China) ,  Tong Xiao-Lin (Guang’anmen Hospital, China Academy of Chinese Medical Sciences, Beijing, China)
資料名： Chinese Medicine (Web)  (Chinese Medicine (Web))
巻： 15  号： 1  ページ： 1-16  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7464A  ISSN： 1749-8546  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： コロナウイルス病2019(COVID-19)は,新しい世界的な公衆衛生救急である。「COVID-19のための診断と治療プロトコル」の「肺における冷たいダンプス停滞」を治療するために使用されたCOVID-19に対するコールド-ダンプ・プラング製剤(CDPF)の治療上の利点が実証されているが,有効成分とそれらの作用機序は不明のままである。本研究では,薬物様評価,経口バイオアベイラビリティ予測,蛋白質-蛋白質相互作用(PPI)ネットワーク構築および分析,遺伝子オントロジー(GO)用語,および遺伝子およびゲノム(KEGG)経路アノテーション,および仮想ドッキングを含むネットワーク薬理学アプローチを採用し,COVID-19処理に対するCDPFの生物活性成分,潜在的標的および分子機構を予測した。CDPFにおけるハーブの活性化合物とそれらの候補ターゲットをデータベースマイニングを通して得て,そして,ハーブ指向目標ネットワークを構築した。続いて,活性化合物の候補標的をCOVID-19に関連するそれらと比較し,COVID-19処理に対するCDPFの潜在的標的を同定した。その後,PPIネットワークを構築し,クラスタ分析とハブ遺伝子スクリーニングのための基礎を提供した。最も重要なモジュールにおける種子標的を,更なる機能的アノテーションのために選択した。GO濃縮分析は4つの主な領域を同定した。(1)外部刺激に対する細胞応答,(2)血液産生と循環の調節,(3)フリーラジカル調節,(4)免疫調節と抗炎症効果。KEGG経路分析はまた,CDPFが,主に抗ウイルス,免疫調節および抗炎症経路を含む,分子レベルでの「多成分-多標的-多経路」を介し,COVID-19に対し薬理学的役割をすることを明らかにした。その結果,”CDPF-herbsredents-system-cirects-COVID-19”ネットワークを構築した。ハブ標的分析において,トップハブ標的IL6とACE2,SARS-CoV-2が典型的に宿主細胞に入る受容体,を分子ドッキング分析のために選択し,良好な結合活性を明らかにした。本研究は,CDPF処理がCOVID-19に対して有効な活性成分および潜在的分子機構を明らかにし,COVID-19に対する戦いにおけるCDPFのより広い応用およびさらなる機構的研究に対する基準基礎を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *ネットワーク ,  *ドッキング ,  遺伝子 ,  消炎作用 ,  受容体 ,  公衆衛生 ,  クラスタ分析 ,  *薬理学 ,  インターロイキン6 ,  ハーブ ,  アノテーション ,  分子機構 ,  遺伝子オントロジー ,  生命システム情報統合データベース
準シソーラス用語： KEGG , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： COVID-19 ,  コールドダンプペスト式(CDPF) ,  ネットワーク薬理学 ,  分子機構 ,  分子ドッキング

分類 (3件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  生薬の薬理の基礎研究  (GX06020J) ,  植物の生化学  (EH01050J)

引用文献 (85件)：

• Indian J Pediatr; A review of coronavirus disease-2019 (COVID-19); T Singhal; 87; 4; 2020; 281-286; citation_id=CR1
• Endocr J; Beneficial effect of berberine on hepatic insulin resistance in diabetic hamsters possibly involves in SREBPs, LXRα and PPARα transcriptional programs; X Liu, G Li, H Zhu, L Huang, Y Liu, C Ma, C Qin; 57; 10; 2010; 881-893; citation_id=CR2
• Diabetes; Berberine, a natural plant product, activates AMP-activated protein kinase with beneficial metabolic effects in diabetic and insulin-resistant states; YS Lee, WS Kim, KH Kim, MJ Yoon, HJ Cho, Y Shen, JM Ye, CH Lee, WK Oh, CT Kim, C Hohnen-Behrens, A Gosby, EW Kraegen, DE James, JB Kim; 55; 8; 2006; 2256-2264; citation_id=CR3
• The Journal of biological chemistry.; Stimulation of glucose transport by AMP-activated protein kinase via activation of p38 mitogen-activated protein kinase; X Xi, J Han, JZ Zhang; 276; 44; 2001; 41029-41034; citation_id=CR4
• APMIS.; Prevention and treatment of infectious diseases by traditional Chinese medicine: a commentary; Y Ma, M Chen, Y Guo, J Liu, W Chen, M Guan, Y Wang, X Zhao, X Wang, H Li, L Meng, Y Wen, Y Wang; 127; 5; 2019; 372-384; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (6件)： ネットワーク薬理学 ,  解析 ,  分子ドッキング ,  処方 ,  メカニズム ,  予測