結腸直腸癌の差次的発現および予後関連遺伝子解析【JST・京大機械翻訳】

Wang Siyu; Liu Shan; Liu Yanyan; Guo Mengling; Zhang Siyu; An Qian; Jiang Yongxin

文献

J-GLOBAL ID：202102215631772163 整理番号：21A2543351

結腸直腸癌の差次的発現および予後関連遺伝子解析【JST・京大機械翻訳】

Differentially Expressed and Prognostic Genes in Colorectal Cancer

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資料名：
巻： 34 号： 6 ページ： 509-519 発行年： 2021年
JST資料番号： C3547A ISSN： 1674-0904 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：中国語 (ZH)

目的:結腸直腸癌は発病率と死亡率が高い消化器悪性腫瘍であるが、結腸直腸癌の発症の分子機構はまだ不明である。本研究では、バイオインフォマティクス分析に基づき、結腸直腸癌のキー遺伝子、シグナル伝達経路及び予後関連遺伝子を同定し、結腸直腸癌の分子機構をよりよく理解し、結腸直腸癌の診断、予後評価及び治療に価値ある分子マーカーを提供する。方法;GEOデータベースから結腸直腸癌遺伝子チップデータセットをダウンロードし、差次的発現遺伝子(differentiallyexpressedgene,DEGs)を選別し、GOとKEGG濃縮分析を通じてDEGsに対して機能注釈と通路分析を行った。蛋白質相互作用ネットワークを構築し,結腸直腸癌の鍵となるハブ遺伝子をスクリーニングした。結腸直腸癌のキーハブ遺伝子に対して生存予後分析を行い、予後関連遺伝子を発見し、予後関連遺伝子の発現を検証し、同時に予後関連遺伝子のプロモーターメチル化レベルを測定した。結果:合計256個のDEGsを選別し、そのうち73個の発現はアップレギュレーションし、183個の発現はダウンレギュレーションした。DEGsは主に細胞外基質分解、分子粘着などの生物学的過程、コラーゲン類細胞外基質、基底細胞膜などの細胞成分、受容体リガンド相互作用、ケモカイン活動などの分子機能、PPARシグナル経路、窒素代謝などのシグナル伝達経路を蓄積する。PPIネットワークから1つの最も緊密なコアモジュールを選別し、13のキーハブ遺伝子を含み、さらに生存予後分析結果により、CXCL2とGNG4の発現は結腸直腸癌患者の総生存期間と著しい相関を示した。結腸直腸癌におけるCXCL2とGNG4の発現は,GEOデータセットにおける発現と一致していた。正常群と比較して,結腸直腸癌組織におけるCXCL2とGNG4プロモーターのメチル化レベルは有意に減少した。結論:CXCL2とGNG4は結腸直腸癌の中核遺伝子であり、結腸直腸癌の予後と著しい相関があり、その発現はおそらくプロモーターのメチル化により調節され、潜在的分子マーカーとして結腸直腸癌の診断、予後評価と治療に用いられ、後続の研究に新たな方向を提供する。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

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消化器の腫よう

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