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J-GLOBAL ID：202102215925196337   整理番号：21A0146854

環境DNAメタバーコーディングによって検出された函館湾周辺の中小河川における魚類の出現傾向

Tendencies of fish fauna in small- and medium-sized rivers around Hakodate Bay, Hokkaido, Japan detected using environmental DNA metabarcoding

著者 (3件)： 北川哲郎 (土木研) ,  村岡敬子 (土木研) ,  中村圭吾 (土木研)
資料名： 日本生物地理学会会報  (Bulletin of the Biogeographical Society of Japan)
巻： 75  ページ： 9-17  発行年： 2020年12月20日 
JST資料番号： L1695A  ISSN： 0067-8716  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 環境DNAメタバーコーディング解析(以下,MB解析)の河川環...

シソーラス用語： DNA【核酸】 ,...
準シソーラス用語： *メタバーコーディング法 ,...

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分類 (2件)： 個体群生態学  (EE03030S) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

引用文献 (30件)：

• 赤松良久・都築隆禎・横山良太・舟橋弥生・太田宗宏・畔上雅樹・内藤太輔・乾 隆帝,2018.河川水辺の国勢調査による魚類相調査と環境DNAメタバーコーディング解析の比較検討.土木学会論文集,74:415-420.
• Bolyen, E., J. R. Rideout, M. R. Dillon, N. A. Bokulich, C. C. Abnet, G. A. Al-Ghalith, H. Alexander, E. J. Alm, M. Arumugam, F. Asnicar, Y. Bai, J. E. Bisanz, K. Bittinger, A. Brejnrod, C. J. Brislawn, C. T. Brown, B. J. Callahan, A. M. Caraballo-Rodríguez, J. Chase, E. K. Cope, R. Da Silva, C. Diener, P. C. Dorrestein, G. M. Douglas, D. M. Durall, C. Duvallet, C. F. Edwardson, M. Ernst, M. Estaki, J. Fouquier, J. M. Gauglitz, S. M. Gibbons, D. L. Gibson, A. Gonzalez, K. Gorlick, J. Guo, B. Hillmann, S. Holmes, H. Holste, C. Huttenhower, G. A. Huttley, S. Janssen, A. K. Jarmusch, L. Jiang, B. D. Kaehler, K. B. Kang, C. R. Keefe, P. Keim, S. T. Kelley, D. Knights, L. Koester, T. Kosciolek, J. Kreps, M. G. I. Langille, J. Lee, R. Ley, Y. X. Liu, E. Loftfield, C. Lozupone, M. Maher, C. Marotz, B. D. Martin, D. McDonald, L. J. McIver, A. V. Melnik, J. L. Metcalf, S. C. Morgan, J. T. Morton, A. T. Naimey, J. A. Navas-Molina, L. F. Nothias, S. B. Orchanian, T. Pearson, S. L. Peoples, D. Petras, M. L. Preuss, E. Pruesse, L. B. Rasmussen, A. Rivers, M. S. Robeson 2nd, P. Rosenthal, N. Segata, M. Shaffer, A. Shiffer, R. Sinha, S. J. Song, J. R. Spear, A. D. Swafford, L. R. Thompson, P. J. Torres, P. Trinh, A. Tripathi, P. J. Turnbaugh, S. Ul-Hasan, J. J. J. van der Hooft, F. Vargas, Y. Vázquez-Baeza, E. Vogtmann, M. von Hippel, W. Walters, Y. Wan, M. Wang, J. Warren, K. C. Weber, C. H. D. Williamson, A. D. Willis, Z. Z. Xu, J. R. Zaneveld, Y. Zhang, Q. Zhu, R. Knight & J. G. Caporaso, 2019. Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2. Nat. Biotechnol., 8: 852-857.
• Bylemans, J., D.M. Gleeson, C.M. Hardy & E. Furlan, 2018. Toward an ecoregion scale evaluation of eDNA metabarcoding primers: A case study for the freshwater fish biodiversity of the Murray-Darling Basin (Australia). Ecol. & Evol., 8: 8697-8712.
• 土居秀幸・岡村 寛,2011.生物群集解析のための類似度とその応用:Rを使った類似度の算出,グラフ化,検定.日本生態学会誌,61:3-20.
• 後藤 晃・中西照幸・宇藤 均・濱田啓吉,1978.北海道南部の河川の魚類相についての予察的研究.北海道大學水産學部研究彙報,29:118-130.

タイトルに関連する用語 (7件)： 環境DNA ,  メタバーコーディング ,  函館湾 ,  周辺 ,  中小河川 ,  魚類 ,  傾向