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J-GLOBAL ID：202102217453237863   整理番号：21A0181621

三成分Cu[7]II錯体における補助配位子は少数溝DNAに対する結合選択性を導く【JST・京大機械翻訳】

Ancillary Ligand in Ternary Cu^II Complexes Guides Binding Selectivity toward Minor-Groove DNA

著者 (6件)： Galindo-Murillo Rodrigo (Department of Medicinal Chemistry, College of Pharmacy, University of Utah, Utah, United States) ,  Winkler Lauren (Department of Medicinal Chemistry, College of Pharmacy, University of Utah, Utah, United States) ,  Garcia-Ramos Juan Carlos (Escuela de Ciencias de la Salud, Universidad Autonoma de Baja California, Baja California, Mexico) ,  Ruiz-Azuara Lena (Departamento de Quimica Inorganica y Nuclear. Facultad de Quimica. Universidad Nacional Autonoma de Mexico. Avenida Universidad 3000, Ciudad Universitaria, Mexico) ,  Cortes-Guzman Fernando (Departamento de Fisicoquimica. Instituto de Quimica. Universidad Nacional Autonoma de Mexico. Avenida Universidad 3000, Ciudad Universitaria, Mexico) ,  Cheatham Thomas E. III (Department of Medicinal Chemistry, College of Pharmacy, University of Utah, Utah, United States)
資料名： Journal of Physical Chemistry B  (Journal of Physical Chemistry B)
巻： 124  号： 51  ページ： 11648-11658  発行年： 2020年 
JST資料番号： W0921A  ISSN： 1520-6106  CODEN： JPCBFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Casiopeinaとして知られる銅含有化合物は,いくつかの癌タイプに対して有望な抗腫瘍作用を示す生物活性分子である。Casiopeinaの作用様式に関する2つの可能な仮説は,実験的証拠から現れた:活性酸素種の生成または核酸と結合および相互作用する化合物の能力。ロバストな分子動力学シミュレーションを用いて,4つの異なるCasiopeinaとDNA二本鎖d(GCACGAACGAACGAACGC)との相互作用を調べた。研究した銅錯体は,第一配位子として4-7-または5-6-置換ジメチルフェナントロリン,第二配位子としてグリシナートまたはアセチルアセトナートのいずれかを含む。統計的意義とシミュレーションにおけるバイアスを低減するために,各銅化合物の4つの分子をDNAから10Å離れた距離で手動で配置し,20の独立した分子動力学シミュレーションを行い,それぞれ少なくとも30μsに達した。この時間スケールは,予想されるDNA末端塩基対frayingを再現し,またDNAと相互作用する化合物によって生成されるインターカレーション/塩基対反転事象を観測することを可能にした。結果は,2次配位子が,グリシンがマイナー溝結合を優先し,アセチルアセトナートが塩基対反転とインターカレーションを生じる,銅錯体とDNAの間の結合様式に対するガイドであることを明らかにした。グリシナートを含むCuII複合体は,アミノ酸部分のアミノ基の間に形成される水素結合によって主に安定化されたDNAマイナー溝内で相互作用し,一方,アセチルアセトナートを有する化合物は水素結合の安定なネットワークを示さず,配位子相互作用は塩基対の反転をもたらすDNA呼吸動力学を増強する。Copyright 2021 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 水素結合 ,  相互作用 ,  計算機シミュレーション ,  ネットワーク ,  *銅 ,  銅錯体 ,  アミノ酸 ,  *DNA【核酸】 ,  抗腫瘍作用 ,  アミノ基 ,  塩基対 ,  複合体 ,  ロバスト性 ,  インターカレーション ,  脂肪族アミン ,  脂肪族カルボン酸
準シソーラス用語： 分子動力学シミュレーション , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

物質索引 (1件)： グリシン

タイトルに関連する用語 (5件)： Cu ,  錯体 ,  補助配位子 ,  DNA ,  選択性