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J-GLOBAL ID：202102217506373589   整理番号：21A1357601

ナノ秒パルス電場に曝露したJurkat細胞に関与する細胞過程【JST・京大機械翻訳】

Cellular Processes Involved in Jurkat Cells Exposed to Nanosecond Pulsed Electric Field

著者 (7件)： Li Huijuan (School of Electronics and Information, Northwestern Polytechnical University, Xi’an 710072, China) ,  Liu Shibin (School of Electronics and Information, Northwestern Polytechnical University, Xi’an 710072, China) ,  Yang Xue (School of Electronics and Information, Northwestern Polytechnical University, Xi’an 710072, China) ,  Du Yongqian (School of Electronics and Information, Northwestern Polytechnical University, Xi’an 710072, China) ,  Luo Jiezhang (School of Electronics and Information, Northwestern Polytechnical University, Xi’an 710072, China) ,  Tan Jie (School of Electronics and Information, Northwestern Polytechnical University, Xi’an 710072, China) ,  Sun Yulong (Key Laboratory for Space Biosciences & Biotechnology, School of Life Sciences, Northwestern Polytechnical University, Xi’an 710072, China)
資料名： International Journal of Molecular Sciences (Web)  (International Journal of Molecular Sciences (Web))
巻： 20  号： 23  ページ： 5847  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7038A  ISSN： 1422-0067  CODEN： IJMCFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 最近,ナノ秒パルス電場(nsPEF)は腫瘍治療の新しいツールであると考えられているが,その機能の分子機構は完全には解明されていない。ここでは,ナノ秒パルス電場に曝露したJurkat細胞の細胞過程を検討した。差次的発現遺伝子(DEG)をGEO2Rから取得し,続いて一連のバイオインフォマティクスツールで分析した。その後,ハブ遺伝子の3D蛋白質モデルをModeller9.21とRosetta3.9によってモデル化した。次に,各ハブ蛋白質に対する100ns分子動力学シミュレーションをGROMACS 2018.2で実施した。最後に,3種類のnsPEF電圧(0.01,0.05および0.5mV/mm)を用いて,100nsのハブ蛋白質の分子動力学をシミュレーションした。合計1769のDEGと8つのハブ遺伝子を得た。二乗平均平方根偏差(RMSD),根平均二乗変動(RMSF),およびRgを含む分子動力学シミュレーションは,ハブ蛋白質の3D構造を構築し,異なるnsPEFsの下のハブ蛋白質の構造特性を得たことを示した。結論として,著者らは,急性T細胞白血病Jurkat細胞に対するnsPEFの複雑な効果の理解に役立つであろう分子情報学の観点から,Jurkat細胞情報伝達経路に対するnsPEFの影響を調べた。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 電圧 ,  *電場 ,  情報科学 ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  実効値 ,  三次元 ,  分子動力学 ,  *Jurkat細胞
準シソーラス用語： *パルス電場 ,  バイオインフォマティクス ,  分子機構 ,  分子動力学シミュレーション ,  蛋白質構造 ,  GROMACS , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： ナノ秒パルス電場(nsPEF) ,  Jurkat ,  マイクロアレイ ,  バイオインフォマティクス解析 ,  分子動力学シミュレーション

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (57件)：

• Hijiya, N.; Suttorp, M. How I treat chronic myeloid leukemia in children and adolescents. Blood 2019, 133, 2374-2384.
• Siegel, R.L.; Miller, K.D.; Jemal, A. Cancer statistics, 2019. CA Cancer J. Clin. 2019, 69, 7-34.
• Yin, S.; Chen, X.; Hu, C.; Zhang, X.; Hu, Z.; Yu, J.; Feng, X.; Jiang, K.; Ye, S.; Shen, K.; et al. Nanosecond pulsed electric field (nsPEF) treatment for hepatocellular carcinoma: A novel locoregional ablation decreasing lung metastasis. Cancer Lett. 2014, 346, 285-291.
• Ferret, E.; Evrard, C.; Foucal, A.; Gervais, P. Volume changes of isolated human K562 leukemia cells induced by electric field pulses. Biotechnol. Bioeng. 2000, 67, 520-528.
• Kennedy, S.M.; Aiken, E.J.; Beres, K.A.; Hahn, A.R.; Kamin, S.J.; Hagness, S.C.; Booske, J.H.; Murphy, W.L. Cationic peptide exposure enhances pulsed-electric-field-mediated membrane disruption. PLoS ONE 2014, 9, e92528.

タイトルに関連する用語 (6件)： ナノ秒 ,  パルス電場 ,  曝露 ,  Jurkat細胞 ,  細胞 ,  過程