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J-GLOBAL ID：202102217758666493   整理番号：21A2837069

胃癌研究のための細胞モデル使用時に注意すべき注意【JST・京大機械翻訳】

Cautions should be taken when using cell models for gastric cancer research

著者 (8件)： Cai Siqi (Center for Innovation Marine Drug Screening & Evaluation of Pilot National Laboratory for Marine Science and Technology (Qingdao), School of Medicine and Pharmacy, Ocean University of China, Qingdao 266071, China) ,  Yao Dan (Center for Innovation Marine Drug Screening & Evaluation of Pilot National Laboratory for Marine Science and Technology (Qingdao), School of Medicine and Pharmacy, Ocean University of China, Qingdao 266071, China) ,  Zhang Yuqi (Center for Innovation Marine Drug Screening & Evaluation of Pilot National Laboratory for Marine Science and Technology (Qingdao), School of Medicine and Pharmacy, Ocean University of China, Qingdao 266071, China) ,  Li Zhaohe (Center for Innovation Marine Drug Screening & Evaluation of Pilot National Laboratory for Marine Science and Technology (Qingdao), School of Medicine and Pharmacy, Ocean University of China, Qingdao 266071, China) ,  Li Xiaoyu (Department of Gastroenterology, The Affiliated Hospital of Qingdao University, Qingdao 266000, China) ,  Li Xiaoyu (Marine Biomedical Research Institute of Qingdao, Qingdao 266071, China) ,  Li Li (Center for Innovation Marine Drug Screening & Evaluation of Pilot National Laboratory for Marine Science and Technology (Qingdao), School of Medicine and Pharmacy, Ocean University of China, Qingdao 266071, China) ,  Li Li (Marine Biomedical Research Institute of Qingdao, Qingdao 266071, China)
資料名： Gene  (Gene)
巻： 806  ページ： Null  発行年： 2022年 
JST資料番号： E0701B  ISSN： 0378-1119  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 胃癌(GC)由来細胞株は,通常,基本的癌研究および薬物スクリーニングにおいて使用された。しかし,それは,腫瘍学者による培養細胞と原発腫瘍の違いについて常に関係する。この疑問に取り組むため,in vitroおよびin silicoの両方で,原発性癌,健康な組織および細胞株における差次的発現遺伝子(DEG)を比較した。DNAメチル化によるGCs発現低下の7つの報告遺伝子を,著者らのコホート研究と実験的に検証した。TCGA(Cancer Genome Atlas),CCLE(Broad Institute Cell Encycledia)およびGTEx(遺伝子型-Tissue発現プロジェクト)からの選択データセットを用いて,in silico分析におけるGC,GC由来細胞株および健康な組織をそれぞれ表現した。6つの細胞株と共に30の胃組織を,検証のために使用した。予想外に,著者らは,報告された癌関連下方制御遺伝子が,生検ではなく,癌細胞系でのみ見出されたことを実験的に見出した。一次GCにおける不変遺伝子発現は,癌性(TCGA)および健康組織(GETx)からの情報を用いて,著者らのコホート研究と一般的に一致した。また,癌組織(TGCA)/健康組織(GTEx)対と細胞株(CCLE)/健康組織(GTEx)ペアのDEGの間に有意差が認められ,原発性癌と癌細胞系の間の有意差を確認した。さらに,YWHAQ(14-3δ)およびTHBS1の発現上昇はGC生検において観察され,胃癌患者における生存率不良と関連するYWHAQおよびTHBS1の増加を考慮すると,GC診断のための潜在的バイオマーカーである可能性がある。まとめると,細胞株と組織の間に大きな差異を示す遺伝子を研究するために,GC細胞株を用いるとき注意が必要であることが示唆された。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  遺伝子型 ,  腫瘍細胞 ,  生存率 ,  培養細胞 ,  生検 ,  遺伝子発現 ,  *胃腫瘍 ,  in vitro実験 ,  バイオマーカー
準シソーラス用語： 細胞株 ,  DNAメチル化 ,  in silico ,  腫瘍組織 ,  差次的遺伝子発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 胃癌 ,  差次的発現遺伝子(DEG) ,  原発性腫瘍組織 ,  YWHAQ ,  THBS1

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (4件)： 胃癌 ,  研究 ,  細胞モデル ,  注意