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J-GLOBAL ID：202102218538766773   整理番号：21A0077485

インゲンマメ(Phaseolus vulgaris L.)の種子におけるCaとMnのゲノムワイド関連研究【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide association studies of Ca and Mn in the seeds of the common bean (Phaseolus vulgaris L.)

著者 (10件)： Erdogmus Semih (Ege University, Department of Bioengineering, Bornova-Izmir 35100, Turkey) ,  Ates Duygu (Ege University, Department of Bioengineering, Bornova-Izmir 35100, Turkey) ,  Nemli Seda (Ege University, Faculty of Fisheries, Bornova-Izmir 35100, Turkey) ,  Yagmur Bulent (Ege University, Department of Soil Science and Plant Nutrition, Bornova-Izmir 35100, Turkey) ,  Asciogul Tansel Kaygisiz (Ege University, Department of Horticulture, Bornova-Izmir, 35040, Turkey) ,  Ozkuru Esin (Ege University, Department of Bioengineering, Bornova-Izmir 35100, Turkey) ,  Karaca Nur (Ege University, Department of Bioengineering, Bornova-Izmir 35100, Turkey) ,  Yilmaz Hasan (Ege University, Department of Bioengineering, Bornova-Izmir 35100, Turkey) ,  Esiyok Dursun (Ege University, Department of Horticulture, Bornova-Izmir, 35040, Turkey) ,  Tanyolac Muhammed Bahattin (Ege University, Department of Bioengineering, Bornova-Izmir 35100, Turkey)
資料名： Genomics  (Genomics)
巻： 112  号： 6  ページ： 4536-4546  発行年： 2020年 
JST資料番号： T0422A  ISSN： 0888-7543  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： CaとMn取込を制御する遺伝子にリンクしたSNPマーカーを,DArTベースの会合マッピング(AM)を用いてインゲンマメ種子において同定した。種子中のCa濃度は475と3,100mg kg-1の間で変化し,平均1,280.9mg kg-1で,Mn濃度は4.87から27.54mg kg-1の範囲であり,平均は11.76mg kg-1であった。合計19,204のSNPマーカーは,インゲンマメの半数体ゲノム数に対応する11の染色体にわたって分布していた。ΔKの最高値はK=2として測定され,173のインゲンマメ遺伝子型はPOP1(Mesoamerian)とPOP2(アンデス)として2つの主なサブクラスタに分割された。UPGMA系統樹とPCAの結果は,STRUCTURE分析のそれらを確認した。Q+Kモデルに基づくMLMは多数のマーカー-形質関連を同定した。19,204のSNPのうち,5つ(Pv2,3,8,10および11)および4つ(Pv2,3,8および11)のSNPは,それぞれ2015年にBornvaおよびMenemenで生育した豆のCa含量と有意に関連していた。2016年に,6つのSNP(Pv1-4,8および10)が,MenemenからBornovaおよび6つのSNP(Pv1-4,8および10)から得られた種子のCa含有量と有意に関連していると同定された。8(Pv3,5および11)および4(Pv2,5および11)SNPは,それぞれ2015および2016年にBornovaにおけるMn含有量と有意に相関した。Menemenでは,8(Pv3,5,8および11)および11(Pv1,2,5,10および11)SNPは,それぞれ2015および2016年にMn含量と有意な相関を示した。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *カルシウム ,  *マンガン ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  *インゲンマメ ,  染色体 ,  系統樹 ,  *ゲノム ,  クラスタ ,  半数体
準シソーラス用語： DArT ,  SNPマーカー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： インゲンマメ ,  カルシウム ,  マンガン ,  関連マッピング ,  SNP ,  DArT

分類 (1件)： 野菜とその加工品  (FJ11020O)

タイトルに関連する用語 (7件)： インゲンマメ ,  Phaseolus ,  種子 ,  Ca ,  Mn ,  ゲノム ,  研究