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J-GLOBAL ID：202102219917051601   整理番号：21A0015791

商業シチメンチョウ農場における落葉細菌群集の包括的調査【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive Survey of the Litter Bacterial Communities in Commercial Turkey Farms

著者 (6件)： Adhikari Bishnu (Department of Poultry Science, University of Arkansas, Fayetteville, AR, United States) ,  Tellez-Isaias Guillermo (Department of Poultry Science, University of Arkansas, Fayetteville, AR, United States) ,  Jiang Tieshan (Department of Poultry Science, University of Arkansas, Fayetteville, AR, United States) ,  Wooming Brian (Cargill, Inc., Minneapolis, MN, United States) ,  Kwon Young Min (Department of Poultry Science, University of Arkansas, Fayetteville, AR, United States) ,  Kwon Young Min (Cell and Molecular Biology Program, University of Arkansas, Fayetteville, AR, United States)
資料名： Frontiers in Veterinary Science (Web)  (Frontiers in Veterinary Science (Web))
巻： 7  ページ： 596933  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7103A  ISSN： 2297-1769  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 農場動物の健康と病気における微生物叢の重要性は,多様な動物種のために十分に実証されてきた。しかし,七面鳥および七面鳥農場における微生物叢に関する研究は,他の農場動物種と比較して比較的限られている。本研究では,セルラ炎(R農場)の陽性発生率を有する1つの農場を含む,北西アルカンサス(H,M,V,K,およびR農場)における5つの市販七面鳥農場におけるリター微生物叢の包括的調査を行った。細菌群落の16S rRNA遺伝子プロファイリングのために,全部で246のボートスワブを用いた。門レベルで,11の主要細菌門(≧0.01%)が回収された。属レベルで,13の主要細菌属を発見し,その相対豊度は≧2%であった。門と属レベルでの微生物組成ならびにそれらの多様性は,異なる農場で変化し,それは,同じ農場内の異なる群れと七面鳥の年齢によってさらに影響を受けた。一般的に,Firmicutesは,より若い鳥の群れでより高かったが,ActinobacteriaとBacteroidetesは,より高齢の鳥の群れで高かった。ProteobacteriaはK農場住宅56日齢シチメンチョウ(K-56)で高濃縮(47.97%)であったが,BacteroidetesはM農場住宅63日齢シチメンチョウ(M-C-63;22.38%)の群Cで最も高く,K-84群(17.26%)が続いた。4つのコア細菌属(Staphylococcus,Brevibacterium,Brachybacterium,およびLactobacillus)を,R農場からのそれらを除くすべてのサンプルにおいて同定した。対照的に,24のコア細菌属は,Corynebacterium属,Bacillaceae科の未知の属,Clostridium sensu stricto 1(C.septicumとの>97%の類似性),および他者間のIgnatzschineriaを含むすべての細胞炎関連試料(R農場)に基づき見出され,シチメンチョウにおける細胞炎のエトポパス形成におけるこれらの役割を示唆した。本研究の全体的な結果は,シチメンチョウの健康と病気における微生物叢の役割に焦点を当てた将来の研究のための貴重な基礎を提供するかもしれない。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 微生物 ,  *細菌 ,  rRNA ,  *シチメンチョウ ,  乳酸桿菌属 ,  ぶどう球菌属 ,  Brevibacterium ,  Clostridium ,  Corynebacterium ,  *農場 ,  ミクロフローラ
準シソーラス用語： バクテロイデス門 ,  プロテオバクテリア ,  16S rRNA ,  Firmicutes , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： シチメンチョウ ,  商業農場 ,  リター微生物相 ,  16S rRNA遺伝子配列決定 ,  Clostridium septicum

分類 (1件)： 家禽一般  (FD03010U)

引用文献 (34件)：

• MuirPLiSLouSWangDSpakowiczDJSalichosL. The real cost of sequencing: scaling computation to keep pace with data generation. Genome Biol. (2016) 17:1-9. doi: 10.1186/s13059-016-0961-9
• JovelJPattersonJWangWHotteNO'KeefeSMitchelT. Characterization of the gut microbiome using 16S or shotgun metagenomics. Front Microbiol. (2016) 7:459. doi: 10.3389/fmicb.2016.00459
• ScuphamAJ. Succession in the intestinal microbiota of preadolescent turkeys. FEMS Microbiol Ecol. (2007) 60:136-47. doi: 10.1111/j.1574-6941.2006.00245.x17284250
• ScuphamAJ. Campylobacter colonization of the turkey intestine in the context of microbial community development. Appl Environ Microbiol. (2009) 75:3564-71. doi: 10.1128/AEM.01409-0819346343
• ScuphamAJPattonTGBentEBaylesDO. Comparison of the cecal microbiota of domestic and wild turkeys. Microbial Ecol. (2008) 56:322-31. doi: 10.1007/s00248-007-9349-418183454

タイトルに関連する用語 (6件)： 商業 ,  シチメンチョウ ,  農場 ,  落葉 ,  細菌群集 ,  調査