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J-GLOBAL ID：202102220178680392   整理番号：21A0384620

Gemmatimonas groenlandica sp.nov.は,Phylum Gemmatimonadetesにおける好気性無酸素性光合成体である【JST・京大機械翻訳】

Gemmatimonas groenlandica sp. nov. Is an Aerobic Anoxygenic Phototroph in the Phylum Gemmatimonadetes

著者 (8件)： Zeng Yonghui (Department of Environmental Science, Aarhus University, Roskilde, Denmark) ,  Zeng Yonghui (Aarhus Institute of Advanced Studies, Aarhus University, Aarhus, Denmark) ,  Nupur (Centre Algatech, Institute of Microbiology CAS, Trebon, Czechia) ,  Wu Naicheng (Department of Geography and Spatial Information Techniques, Center for Land and Marine Spatial Utilization and Governance Research, Ningbo University, Ningbo, China) ,  Madsen Anne Mette (The National Research Centre for the Working Environment, Copenhagen, Denmark) ,  Chen Xihan (Department of Engineering, Aarhus University, Aarhus, Denmark) ,  Gardiner Alastair T. (Centre Algatech, Institute of Microbiology CAS, Trebon, Czechia) ,  Koblizek Michal (Centre Algatech, Institute of Microbiology CAS, Trebon, Czechia)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 11  ページ： 606612  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 細菌門Gemmatimonadetesは,バクテリオクロロフィルベースの光栄養(クロロ光栄養)を遂行できるメンバーを含む。しかし,クロロ光合成Gemmatimonadetes細菌(CGB)の1つの菌株だけが今日まで分離され,CGBにおける光従属栄養生活様式と光栄養の進化のさらなる理解を妨げている。高北極グリーンランドのZackenberg Valleyの河川の表面水からCGB,Gemmatimonas(G.)groenlandica sp.nov.の新しいメンバーの単離を報告する。微好気性G.phototropha株AP64Tとは異なって,G.groenlandica株TET16Tは厳密に好気的な無酸素性光合成栄養であり,酸化ストレスとの対処に拡張されたアルセナールを有する。また,その色素組成と赤外吸収特性はG.phototrophaと異なっており,異なる光化学系装置を有することを示す。G.groenlandicaの完全なゲノム配列は,CGBの光合成遺伝子クラスターにおけるユニークで保存された特徴を明らかにした。さらに,北東グリーンランドの土壌と氷河メタゲノムから得たCGBのメタゲノム集合ゲノムを分析し,調査した河川水を超えるCGBの広い分布パターンを明らかにした。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 細菌 ,  河川 ,  *光合成 ,  色素 ,  従属栄養 ,  バクテリオクロロフィル ,  氷河 ,  ライフスタイル ,  ゲノム ,  光化学系 ,  *好気性 ,  酸化ストレス
準シソーラス用語： ゲノム配列 ,  遺伝子クラスタ ,  メタゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： MALDI-TOF MS ,  細菌分離 ,  光栄養 ,  Gemmatimonadetes ,  貧栄養環境

分類 (1件)： 微生物形態学・分類学  (EG03030Y)

引用文献 (49件)：

• AsnicarF.ThomasA. M.BeghiniF.MengoniC.ManaraS.ManghiP. (2020). Precise phylogenetic analysis of microbial isolates and genomes from metagenomes using PhyloPhlAn 3.0. Nat. Commun. 11:2500.
• AzizR. K.BartelsD.BestA. A.DeJonghM.DiszT.EdwardsR. A. (2008). The RAST server: rapid annotations using subsystems technology. BMC Genom. 9:75. doi: 10.1186/1471-2164-9-75 18261238
• BattistuzziF. U.FeijaoA.HedgesS. B. (2004). A genomic timescale of prokaryote evolution: insights into the origin of methanogenesis, phototrophy, and the colonization of land. BMC Evol. Biol. 4:44. doi: 10.1186/1471-2148-4-44 15535883
• Boldareva-NuianzinaE. N.BláhováZ.SobotkaR.KoblížekM. (2013). Distribution and origin of oxygen-dependent and oxygen-independent forms of Mg-protoporphyrin monomethylester cyclase among phototrophic proteobacteria. Appl. Environ. Microbiol. 79 2596-2604. doi: 10.1128/aem.00104-13 23396335
• Cabello-YevesP. J.ZemskayaT. I.RosselliR.CoutinhoF. H.ZakharenkoA. S.BlinovV. V. (2018). Genomes of novel microbial lineages assembled from the sub-ice waters of Lake Baikal. Appl. Environ. Microbiol. 84:e02132-17.

タイトルに関連する用語 (3件)： Gemmatimonadetes ,  好気性 ,  光合成