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J-GLOBAL ID：202102220185393448   整理番号：21A0064307

深層学習に基づく転写因子結合部位予測に関するレビュー【JST・京大機械翻訳】

A Review About Transcription Factor Binding Sites Prediction Based on Deep Learning

著者 (5件)： Zeng Yuanqi (School of Computer Science, Chengdu University of Information Technology, Chengdu, China) ,  Gong Meiqin (West China Second University Hospital, Sichuan University, Chengdu, China) ,  Lin Meng (School of Computer Science, Chengdu University of Information Technology, Chengdu, China) ,  Gao Dongrui (School of Computer Science, Chengdu University of Information Technology, Chengdu, China) ,  Zhang Yongqing (School of Computer Science, Chengdu University of Information Technology, Chengdu, China)
資料名： IEEE Access  (IEEE Access)
巻： 8  ページ： 219256-219274  発行年： 2020年 
JST資料番号： W2422A  ISSN： 2169-3536  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 転写因子(TF)は特異的DNA配列を認識し,結合し,クロマチン構造を変化させ転写を調節する。TFは,複雑な調節下で遺伝子の発現を促進するガイドゲノムの形成を助ける。遺伝子発現のTF調節を仲介する基礎となる機構を理解することは,現在のゲノム研究における一般的な話題である。しかし,正確なTF結合部位(TFBS)を同定し,転写調節におけるTFの特異的役割は挑戦的である。本稿では,TFBSの予測に関する研究状況を要約した。最初に,TFBSを同定する実験方法を,関連データベースにアクセスすることによってまとめた。第二に,TFBS,特に深層学習を予測するための機械学習法を要約した。最後に,本研究は,TFBS予測で直面する主な課題について詳述した。この論文の目的は,TFBSの予測を包括的に理解し,この分野における更なる発展を促進するために研究者を提供することである。Copyright 2021 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  遺伝子 ,  ゲノム ,  *結合部位 ,  遺伝子発現 ,  *転写因子 ,  機械学習
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  DNA配列 ,  転写調節 ,  クロマチン構造 ,  *転写因子結合部位 ,  *深層学習 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： パターン認識  (JE07000S)

タイトルに関連する用語 (4件)： 深層学習 ,  転写因子結合部位 ,  予測 ,  レビュー