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J-GLOBAL ID：202102220368775313   整理番号：21A2844990

ジャンボファージ:コア機能の比較ゲノム概要と生物学的葛藤に対する適応【JST・京大機械翻訳】

Jumbo Phages: A Comparative Genomic Overview of Core Functions and Adaptions for Biological Conflicts

著者 (5件)： Iyer Lakshminarayan M. (National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institutes of Health, Bethesda, MD 20894, USA) ,  Anantharaman Vivek (National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institutes of Health, Bethesda, MD 20894, USA) ,  Krishnan Arunkumar (Department of Biological Sciences, Indian Institute of Science Education and Research (IISER) Berhampur, Odisha 760010, India) ,  Burroughs A. Maxwell (National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institutes of Health, Bethesda, MD 20894, USA) ,  Aravind L. (National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, National Institutes of Health, Bethesda, MD 20894, USA)
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 13  号： 1  ページ： 63  発行年： 2021年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Jumboファージは,それらの異常なゲノムサイズと生物学の珍しい側面により多くの注目を集めている。224 jumboファージの比較ゲノム解析を行うことにより,ゲノムサイズ分布に基づく客観的包含基準を示唆し,主要な生物系にわたるそれらの多様体適応の合成概要を示した。保存遺伝子の系統パターンのクラスタ化と主成分分析により,全ての既知jumboファージは3つの高次グループに分類され,これはミオウイルスとsiphovirus形態の両方を含み,これはより小さな先行者から複数の独立した起源を示す。本研究では,DNA複製,組換え,転写およびビリオン成熟系のいくつかの過小評価または未報告の側面を明らかにした。感受性配列分析方法の悪化により,宿主-機械を隠すのに役立つ新しい蛋白質修飾酵素を同定した。宿主ウイルスコンフリクトに焦点を合わせて,著者らは,環状ヌクレオチドおよびNAD+依存性エフェクター活性化のような細菌免疫系の異なる翼を計数するために使用される戦略,および偽性生殖の間の超感染の予防を検出する。RNA標的化宿主エフェクターの結果に対抗するjumboファージのRNA修復系を再構成した。これらの知見はまた,いくつかのjumboファージ蛋白質が,細胞生活の最後の普遍的な祖先に先行する古代レプリコンに見られる系のスナップショットを提供することを示唆する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 多様体 ,  細菌 ,  RNA【核酸】 ,  生殖 ,  タンパク質 ,  *バクテリオファージ ,  クラスタ化 ,  環状ヌクレオチド ,  レプリコン ,  DNA複製 ,  主成分分析 ,  ビリオン ,  ターゲティング ,  ゲノムサイズ ,  *比較ゲノミクス ,  *微生物 ,  改変

著者キーワード (9件)： DNAウイルス ,  アンチファージシステム ,  ニコチンアミドジヌクレオチド ,  DNAポリメラーゼ ,  DNAポリメラーゼIII ,  RNAポリメラーゼ ,  転写 ,  ヌクレオチド ,  ウイルス進化

分類 (2件)： ウイルスの生化学  (EG04030F) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (232件)：

• Iyer, L.M.; Aravind, L.; Koonin, E.V. Common origin of four diverse families of large eukaryotic DNA viruses. J. Virol. 2001, 75, 11720-11734.
• Iyer, L.M.; Balaji, S.; Koonin, E.V.; Aravind, L. Evolutionary genomics of nucleo-cytoplasmic large DNA viruses. Virus Res. 2006, 117, 156-184.
• Koonin, E.V.; Yutin, N. Evolution of the large Nucleocytoplasmic DNA viruses of Eukaryotes and convergent origins of viral gigantism. Adv. Virus Res. 2019, 103, 167-202.
• Donelli, G.; Guglielmi, F.; Paoletti, L. Structure and physico-chemical properties of bacteriophage G. I. Arrangement of protein subunits and contraction process of tail sheath. J. Mol. Biol. 1972, 71, 113-125.
• González, B.; Monroe, L.; Li, K.; Yan, R.; Wright, E.; Walter, T.; Kihara, D.; Weintraub, S.T.; Thomas, J.A.; Serwer, P.; et al. Phage G structure at 6.1AA resolution, condensed DNA, and host identity revision to a lysinibacillus. J. Mol. Biol. 2020, 432, 4139-4153.

タイトルに関連する用語 (8件)： ジャンボ ,  ファージ ,  コア ,  比較ゲノム ,  概要 ,  生物学 ,  葛藤 ,  適応