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J-GLOBAL ID：202102220577568928   整理番号：21A0021277

TMTに基づく定量的プロテオミクス戦略を用いた心筋虚血-再潅流のラットモデルにおける心臓プロテオームの包括的解析【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive analysis of the cardiac proteome in a rat model of myocardial ischemia-reperfusion using a TMT-based quantitative proteomic strategy

著者 (4件)： Lim Sun Ha (Department of Biochemistry, School of Medicine, Catholic University of Daegu, Daegu, Republic of Korea) ,  Lee Jongwon (Department of Biochemistry, School of Medicine, Catholic University of Daegu, Daegu, Republic of Korea) ,  Han Mee-Jung (Department of Biomolecular and Chemical Engineering, Dongyang University, Yeongju, Republic of Korea) ,  Han Mee-Jung (Department of Nursing, Dongyang University, Yeongju, Republic of Korea)
資料名： Proteome Science (Web)  (Proteome Science (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 1-14  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7393A  ISSN： 1477-5956  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 心臓プロテオームの伝統的研究は,二次元ゲル電気泳動(2-DE)による動物モデルで主に研究されている。しかし,結果は,基礎となる機構の理解のための満足な品質ではなかった。最近の定量的プロテオミクス法は,これらの限界を克服するために改善された。虚血-再潅流(IR)のラットモデルにおける心臓プロテオームを包括的に研究するために,タンデム質量タグ(TMT)に基づく定量的プロテオミクス戦略を開発した。さらに,この戦略を用いて,代表的な食物繊維粒であるTriticum aestivum L.抽出物(TALE)の摂取による心筋梗塞の予防の基礎となる分子機構を調べた。心臓プロテオームをゲルベースアプローチとして2-DE,及び非ゲルベース定量的アプローチとして二次元液体クロマトグラフィー(2D-LC)及びタンデム質量分析(MS/MS)と組み合わせたTMT標識により分析した。さらに,遺伝子オントロジーアノテーションをPANTHERデータベースにより行った。興味あるいくつかの蛋白質を,ウェスタンブロット分析により確認した。2D-LC MS/MSを用いて,2つの独立したMSデータセットから合計641の蛋白質を同定した。これらの中で,著者らは,62の上方制御された蛋白質と89の下方制御された蛋白質から成る,見せかけの手術群とIR群の間で差次的に発現した151のIR関連蛋白質を同定した。大部分の還元蛋白質は代謝過程に関与した。さらに,IR関連蛋白質の57はTALE摂取により影響を受け,25の上方制御された蛋白質および32の下方制御された蛋白質を示した。特に,TALE摂取は代謝のスイッチをもたらし,高エネルギーリン酸塩の損失と有害な異化産物(特に活性酸素種(ROS))の蓄積を減少させ,細胞骨格バランスを維持し,心臓IR損傷の減少をもたらす。本研究はIR関連蛋白質と潜在的標的蛋白質の包括的プロテオームマップを提供し,ラットIRモデルにおけるTALE摂取による心筋梗塞の予防に関与する機構を同定した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *心臓 ,  ゲル ,  コムギ ,  タンパク質 ,  *ラット ,  二次元 ,  タンデム質量分析 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  *再潅流 ,  ウェスタンブロット法 ,  アノテーション ,  *プロテオーム
準シソーラス用語： *虚血再潅流 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： 心臓プロテオーム ,  TMTラベリング ,  定量的プロテオミクス ,  虚血 ,  心筋梗塞 ,  Triticum aestivum ,  食物繊維

分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  有機化合物の各種分析  (CC08034J)

引用文献 (46件)：

• J Cardiol; Myocardial ischemia: current concepts and future perspectives; H Shimokawa, S Yasuda; 52; 2008; 67-78; 10.1016/j.jjcc.2008.07.016; citation_id=CR1
• Lancet; Global and regional burden of disease and risk factors, 2001: systematic analysis of population health data; AD Lopez, CD Mathers, M Ezzati, DT Jamison, CJ Murray; 367; 2006; 1747-1757; 10.1016/S0140-6736(06)68770-9; citation_id=CR2
• J Cardiol; Simvastatin reduces myocardial infarct size via increased nitric oxide production in normocholesterolemic rabbits; N Bao, H Ushikoshi, H Kobayashi, S Yasuda, I Kawamura, M Iwasa; 53; 2009; 102-107; 10.1016/j.jjcc.2008.09.012; citation_id=CR3
• J Cardiol; Intravenous administration of adenosine triphosphate disodium during primary percutaneous coronary intervention attenuates the transient rapid improvement of myocardial wall motion, not myocardial stunning, shortly after recanalization in acute anterior myocardial infarction; T Tokuyama, T Sakuma, C Motoda, T Kawase, R Takeda, S Mito; 54; 2009; 289-296; 10.1016/j.jjcc.2009.06.002; citation_id=CR4
• Cardiovasc Res; Postconditioning: reduction of reperfusion-induced injury; ZQ Zhao, J Vinten-Johansen; 70; 2006; 200-211; 10.1016/j.cardiores.2006.01.024; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (10件)： TMT ,  定量的プロテオミクス ,  戦略 ,  心筋 ,  虚血-再潅流 ,  ラット ,  モデル ,  心臓 ,  プロテオーム ,  解析