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J-GLOBAL ID：202102220902071294   整理番号：21A0004788

HBaseにおける大量XMLベース生物学的データ管理の実現【JST・京大機械翻訳】

Enabling Massive XML-Based Biological Data Management in HBase

著者 (5件)： Liu Jian (School of Computer Science and Technology, Harbin Institute of Technology, Harbin, Heilongjiang, China) ,  Liu Qiuru (School of Computer Science and Technology, Harbin Institute of Technology, Harbin, Heilongjiang, China) ,  Zhang Lei (Zhejiang University of Science and Technology, Hangzhou, Zhejiang, China) ,  Su Shuhui (School of Computer Science and Technology, Harbin Institute of Technology, Harbin, Heilongjiang, China) ,  Liu Yongzhuang (School of Computer Science and Technology, Harbin Institute of Technology, Harbin, Heilongjiang, China)
資料名： IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics  (IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics)
巻： 17  号： 6  ページ： 1994-2004  発行年： 2020年 
JST資料番号： W1409A  ISSN： 1545-5963  CODEN： ITCBCY  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： XMLフォーマットにおける生物学データの公表は,拡張可能および機械可読形式において,それらのバイオインフォマティクス資源を提供するような組織にとって魅力的である。大きいデータの時代において,大規模なXMLベースの生物学的データ管理は,困難な課題として出現している。XMLベースの生物学的データセットの連続的成長によって,それは,通常,処理速度とスケールに関して効率的質問能力を提供するために,従来の宣言的質問言語を使用することが,通常,信頼する。本研究では,大規模XMLベースの生物学的データ収集を記憶し,質問するための新しいプラットフォームを報告する。XMLベースの生物学的データ収集からHBaseテーブルを構築するためのプロトタイプツールを最初に開発し,次に,XMLクエリモデルをMapReduceクエリモデルに変換する形式的手法を提案した。最後に,既存のXMLベースの生物学的データベースに関する提案方法の質問性能の評価を提示して,提案した解法の性能優位性を示した。大規模XMLベースの生物学的データ管理プラットフォームのソースコードは,https://github.com/lyotvincent/X2Hで自由に利用可能である。Copyright 2021 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *データ管理 ,  データベース ,  データ収集 ,  問い合わせ言語 ,  プロトタイプ
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  ソースコード ,  処理速度 ,  MapReduce , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： パターン認識  (JE07000S) ,  生体計測  (EL03020C) ,  音声処理  (JE05000E)

タイトルに関連する用語 (3件)： XML ,  生物学 ,  データ管理