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J-GLOBAL ID：202102221124920740   整理番号：21A0293806

低密度リポ蛋白質コレステロールレベルの増加とATP感受性カリウムチャネル変異体rs1799858間のクロストーク下での血漿エキソソーム由来マイクロRNA発現プロファイリングとバイオインフォマティクス解析【JST・京大機械翻訳】

Plasma exosome-derived microRNAs expression profiling and bioinformatics analysis under cross-talk between increased low-density lipoprotein cholesterol level and ATP-sensitive potassium channels variant rs1799858

著者 (5件)： Liu Cheng (Department of Cardiology, Guangzhou First People’s Hospital, South China University of Technology, Guangzhou, China) ,  Lai Yanxian (Department of Cardiology, Guangzhou First People’s Hospital, South China University of Technology, Guangzhou, China) ,  Ying Songsong (Department of Gastroenterology, Guangzhou First People’s Hospital, South China University of Technology, Guangzhou, China) ,  Zhan Junfang (Department of Health Management Center, Guangzhou First People’s Hospital, South China University of Technology, Guangzhou, China) ,  Shen Yan (Department of Cardiology, Guangzhou First People’s Hospital, South China University of Technology, Guangzhou, China)
資料名： Journal of Translational Medicine (Web)  (Journal of Translational Medicine (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 1-13  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7330A  ISSN： 1479-5876  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： メッセンジャーとしてのエキソソーム由来マイクロRNA(exo-miRs)は,遺伝的[ATP感受性カリウムチャンネル(KATP)遺伝子変異体rs1799858]と環境[上昇した血清低密度リポ蛋白質コレステロール(LDL-C)レベル]因子の間のクロストークにおいて重要な役割を担っているが,血漿exo-miRs発現プロファイルと遺伝子型から表現型への生物学的過程におけるその役割は不明なままである。”その役割は,その役割は不明のままであり,また,その役割は,遺伝的な[ATP感受性カリウムチャンネル(KATP)遺伝子変異体rs1799858]と,環境[上昇した血清低密度リポ蛋白質コレステロール(LDL-C)レベル]因子の間のクロストークにおいて重要な役割を担っているが,血漿exo-miRs発現プロファイルと,遺伝子型から表現型への生物学的プロセスにおけるその役割は,不明のままである。LDL-C血清レベル増加(≧1.8mmol/L)を有する合計14人の被験者を本研究に登録した。KATP rs1799858は,Sequenom MassARRAYシステムによって遺伝子型を決定した。血漿exo-miRs発現プロファイルを次世代配列決定により同定した。64のexo-miRsは,CC遺伝子型を有するそれらと比較して,rs1799858のT対立遺伝子(TT+CT)を有する被験者で上方制御され,20のexo-miRsが下方制御された。トップ20の上方制御されたDE-exo-miRsはmiR-378ファミリー,miR-320ファミリー,miR-208ファミリー,miR-483-5p,miR-22-3p,miR-490-3p,miR-6515-5p,miR-31-5p,miR-210-3p,miR-17-3p,miR-6807-5p,miR-497-5p,miR-33a-5p,miR-3611およびmiR-126-5pであった。トップ20の下方制御されたDE-exo-miRは,let-7ファミリー,miR-221/222ファミリー,miR-619-5p,miR-6780a-5p,miR-641,miR-200a-5p,miR-581,miR-605-3p,miR-548ar-3p,miR-135a-3p,miR-451b,miR-509-3-5p,miR-4664-3pおよびmiR-224-5pであった。遺伝子オントロジー(GO)および遺伝子およびゲノム(KEGG)分析の京都エンシクロペディアを,その後,トップ10DE-exo-miRs関連特異的標的遺伝子およびシグナル伝達経路を同定するために実行した。5つのDE-exo-miRsだけがqRT-PCRによって検証された。miR-31-5p,miR-378d,miR-619-5p,miR-320a-3pおよびlet-7a-5p(すべてP<0.05)であった。これらの結果は,最初に,遺伝子型(KATP rs1799858)と表現型(より高いLDL-C血清レベル)の間のリンクを架橋する血漿exo-miRs発現プロファイルを示し,これらの5つのDE-exo-miRsは,分子介入点のための潜在的標的中間体である可能性がある。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *血漿 ,  遺伝 ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  血清 ,  表現型 ,  血清中濃度 ,  対立遺伝子 ,  ダウンレギュレーション ,  アップレギュレーション ,  *クロストーク ,  遺伝子変異
準シソーラス用語： *マイクロRNA ,  *エキソソーム ,  遺伝子プロファイル , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： エキソソーム由来マイクロRNA ,  低密度リポ蛋白質コレステロール ,  ATP感受性カリウムチャネル ,  多形 ,  バイオインフォマティクス解析

分類 (3件)： 脂質の代謝と栄養  (EJ02034Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  代謝異常・栄養性疾患一般  (GD05010J)

引用文献 (50件)：

• J Am Heart Assoc; Cholesterol and atherosclerotic cardiovascular disease: a lifelong problem; SS Gidding, NB Allen; 8; 2019; e012924; 10.1161/JAHA.119.012924; citation_id=CR1
• Eur J Epidemiol.; Lifestyle factors, cardiovascular disease and all-cause mortality in middle-aged and elderly women: a systematic review and meta-analysis; V Colpani, CP Baena, L Jaspers, GM Dijk, Z Farajzadegan, K Dhana, MJ Tielemans, T Voortman, R Freak-Poli, GGV Veloso; 33; 2018; 831-845; 10.1007/s10654-018-0374-z; citation_id=CR2
• Circulation; Genetic predisposition to high blood pressure and lifestyle factors: associations with midlife blood pressure levels and cardiovascular events; R Pazoki, A Dehghan, E Evangelou, H Warren, H Gao, M Caulfield, P Elliott, I Tzoulaki; 137; 2018; 653-661; 10.1161/CIRCULATIONAHA.117.030898; citation_id=CR3
• Lipids Health Dis; ATP-sensitive potassium channels gene polymorphism rs1799858 affects the risk of macro-/micro-vascular arteriosclerotic event in patients with increased low-density lipoprotein cholesterol levels; C Liu, T Guan, Y Lai, J Zhu, J Kuang, Y Shen; 19; 2020; 147; 10.1186/s12944-020-01315-6; citation_id=CR4
• Eur Heart J; 2019 ESC/EAS Guidelines for the management of dyslipidaemias: lipid modification to reduce cardiovascular risk; F Mach, C Baigent, AL Catapano, KC Koskinas, M Casula, L Badimon, MJ Chapman, GG Backer, V Delgado, BA Ference; 41; 2020; 111-188; 10.1093/eurheartj/ehz455; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (10件)： 低密度リポ蛋白質コレステロール ,  ATP感受性カリウムチャネル ,  変異体 ,  クロストーク ,  血漿 ,  エキソソーム ,  マイクロRNA ,  発現 ,  プロファイリング ,  バイオインフォマティクス解析