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J-GLOBAL ID：202102221919834473   整理番号：21A0722232

疎水性コアの構造は単一突然変異蛋白質による3D蛋白質構造検証を決定する【JST・京大機械翻訳】

Structure of the Hydrophobic Core Determines the 3D Protein Structure-Verification by Single Mutation Proteins

著者 (5件)： Banach Mateusz (Department of Bioinformatics and Telemedicine, Medical College, Jagiellonian University, Lazarza 16, 31-533 Krakow, Poland) ,  Fabian Piotr (Institute of Computer Science, Silesian University of Technology, Akademicka 16, 44-100 Gliwice, Poland) ,  Stapor Katarzyna (Institute of Computer Science, Silesian University of Technology, Akademicka 16, 44-100 Gliwice, Poland) ,  Konieczny Leszek (Chair of Medical Biochemistry, Medical College, Jagiellonian University, Kopernika 7, 31-034 Krakow, Poland) ,  Roterman and Irena (Department of Bioinformatics and Telemedicine, Medical College, Jagiellonian University, Lazarza 16, 31-533 Krakow, Poland)
資料名： Biomolecules (Web)  (Biomolecules (Web))
巻： 10  号： 5  ページ： 767  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7148A  ISSN： 2218-273X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 56アミノ酸の鎖長を有する単一変異位置が異なる4つのde novo蛋白質は,多様な3D構造:単量体3と4+折畳みを示す。この多様性の理由を,ポリペプチド鎖が全体として関与している系の生成をもたらす相乗効果の結果として,疎水性コアの異なる構造において見られる。疎水性コアの構造が3Dガウス分布の形で疎水性分布関数によって表現されるファジィ油滴モデルに基づいて,これらの2つの構造形態における疎水性コアの組成が異なることを示した。加えて,折畳み過程における初期中間体の構造を決定するモデルの使用は,ポリペプチド鎖構造の違いを示し,特異的相乗作用の影響として共通の疎水性核の構築と組み合わせ,ポリペプチド鎖の折畳み過程の多様性の理由を示す。結果は,水環境から生じる外力場の存在を考慮し,三次構造の安定化への関与が基本的である疎水性コアの形成へのその活性影響を考慮する必要性を示した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 分布関数 ,  正規分布 ,  *疎水性 ,  ポリペプチド ,  相乗作用 ,  *タンパク質 ,  単量体 ,  折畳み ,  三次構造 ,  二次構造 ,  *三次元 ,  中間体
準シソーラス用語： 油滴 ,  鎖長 ,  *蛋白質構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 疎水性 ,  疎水性コア ,  二次構造 ,  超二次構造 ,  相乗作用

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

引用文献 (58件)：

• Devlin, T.M. Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations, 7th ed.; Wiley: New York, NY, USA, 2011.
• Berman, H.; Westbrook, J.; Feng, Z.; Gilliland, G.; Bhat, T.N.; Weissig, H.; Shindyalov, I.N.; Bourne, P.E. The Protein Data Bank. Nucleic Acids Res. 2000, 28, 235-242.
• Dill, K.A.; MacCallum, J.L. The Protein-Folding Problem, 50 Years On. Science 2012, 338, 1042-1046.
• Sternberg, M.J.E. Protein Structure Prediction-Principles and Approaches. In Protein Structure Prediction; Sternberg Oxford University Press Inc.: New York, NY, USA, 1996; pp. 1-30.
• Moult, J.; Fidelis, K.; Kryshtafovych, A.; Tramontano, A. Critical assessment of methods of protein structure prediction (CASP)-round IX. Proteins Struct. Funct. Bioinform. 2011, 79, 1-5.

タイトルに関連する用語 (6件)： 疎水性 ,  コア ,  突然変異蛋白質 ,  3D ,  蛋白質構造 ,  検証