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J-GLOBAL ID：202102222137353918   整理番号：21A2845167

肝細胞癌ゲノムで同定されたB型肝炎ウイルス統合の特性化【JST・京大機械翻訳】

Characterization of Hepatitis B Virus Integrations Identified in Hepatocellular Carcinoma Genomes

著者 (7件)： Mathkar Pranav P. (Department of Microbiology and Molecular Genetics, University of Vermont, Burlington, VT 05405, USA) ,  Chen Xun (Department of Microbiology and Molecular Genetics, University of Vermont, Burlington, VT 05405, USA) ,  Chen Xun (Institute for the Advanced Study of Human Biology, Kyoto University, Kyoto 606-8501, Japan) ,  Sulovari Arvis (Department of Microbiology and Molecular Genetics, University of Vermont, Burlington, VT 05405, USA) ,  Sulovari Arvis (Cajal Neuroscience Inc., Seattle, WA 98102, USA) ,  Li Dawei (Department of Microbiology and Molecular Genetics, University of Vermont, Burlington, VT 05405, USA) ,  Li Dawei (Department of Biomedical Science, Charles E. Schmidt College of Medicine, Florida Atlantic University, Boca Raton, FL 33431, USA)
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 13  号： 2  ページ： 245  発行年： 2021年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 肝細胞癌(HCC)は癌関連死亡率の主な原因である。HCC症例のほとんど半分はB型肝炎ウイルス(HBV)感染と関連し,しばしばヒトゲノムにおけるHBV配列統合につながる。単一ヌクレオチド分解能でのHBV統合部位の正確な同定は,癌ゲノム景観および疾患自体のより良い理解の開発に重要である。ここでは,再発性または既知のHCC遺伝子(TERT,MLL4,およびCCNE1)ならびに非再発癌関連遺伝子(CSMD2,NKD2,およびRHOUのような)における最近報告されたVIcallerプラットフォームによって同定されたHBV統合のさらなる分析および特性化を行った。この経路濃縮分析は,レチノール,チロシンおよび脂肪酸の代謝経路のようなアルコールデヒドロゲナーゼ4遺伝子を含む複数の経路を明らかにした。HBV統合部位の更なる分析は,腫瘍と正常組織の間の統合上部ブレークポイント,統合ゲノム長,および統合対立遺伝子画分を含む異なるパターンを明らかにした。本分析はまた,VIcaller法が癌関連遺伝子における新規クローン統合の発見を通して診断能を持つことを意味する。結論として,VIcallerは仮説のないvirome-ワイドアプローチであるが,特異的候補ウイルスとそれらの統合対立遺伝子画分のゲノムワイド統合事象を正確に同定するために適用することができる。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 脂肪酸 ,  アルコールデヒドロゲナーゼ ,  遺伝子 ,  ヌクレオチド ,  *ゲノム ,  代謝経路 ,  対立遺伝子 ,  *B型肝炎ウイルス ,  クローン ,  *肝細胞癌 ,  テロメラーゼ ,  *肝細胞 ,  ヒトゲノム ,  *微生物 ,  *肝炎ウイルス ,  *ヘパドナウイルス科 ,  脂環式化合物 ,  ビタミンA ,  ポリエン ,  不飽和アルコール ,  アミノ酸 ,  フェノール類 ,  第一アミン

著者キーワード (6件)： ウイルス統合 ,  ビロームワイド検出 ,  ビカラー ,  集積対立遺伝子分画 ,  肝細胞癌(HCC) ,  B型肝炎ウイルス(HBV)

分類 (1件)： 消化器の腫よう  (GH04000D)

物質索引 (2件)： レチノール ,  チロシン

引用文献 (106件)：

• Jiang, D.; Deng, J.; Dong, C.; Ma, X.; Xiao, Q.; Zhou, B.; Yang, C.; Wei, L.; Conran, C.; Zheng, S.L.; et al. Knowledge-based analyses reveal new candidate genes associated with risk of hepatitis B virus related hepatocellular carcinoma. BMC Cancer 2020, 20, 403.
• Liu, Z.; Chalasani, N.; Lin, J.; Gawrieh, S.; He, Y.; Tseng, Y.J.; Liu, W. Integrative omics analysis identifies macrophage migration inhibitory factor signaling pathways underlying human hepatic fibrogenesis and fibrosis. J. Bio-X Res. 2019, 2, 16-24.
• Plentz, R.R.; Malek, N.P. Early Detection of Hepatocellular Carcinoma: How to Screen and Follow up Patients with Liver Cirrhosis According to the GERMAN S3 Guideline? Diagnostics (Basel) 2015, 5, 497-503.
• Xie, Y. Hepatitis B Virus-Associated Hepatocellular Carcinoma. Adv. Exp. Med. Biol. 2017, 1018, 11-21.
• Zhang, X.; Wang, L.; Yan, Y. Identification of potential key genes and pathways in hepatitis B virus-associated hepatocellular carcinoma by bioinformatics analyses. Oncol. Lett. 2020, 19, 3477-3486.

タイトルに関連する用語 (6件)： 肝細胞癌 ,  ゲノム ,  同定 ,  B型肝炎ウイルス ,  統合 ,  特性化