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J-GLOBAL ID：202102222273540119   整理番号：21A0167044

定性的および定量的トップダウンプロテオミクスのための自動化キャピラリー等電点分画タンデム質量分析【JST・京大機械翻訳】

Automated Capillary Isoelectric Focusing-Tandem Mass Spectrometry for Qualitative and Quantitative Top-Down Proteomics

著者 (7件)： Xu Tian (Department of Chemistry, Michigan State University, Michigan, United States) ,  Shen Xiaojing (Department of Chemistry, Michigan State University, Michigan, United States) ,  Yang Zhichang (Department of Chemistry, Michigan State University, Michigan, United States) ,  Chen Daoyang (Department of Chemistry, Michigan State University, Michigan, United States) ,  Lubeckyj Rachele A. (Department of Chemistry, Michigan State University, Michigan, United States) ,  McCool Elijah N. (Department of Chemistry, Michigan State University, Michigan, United States) ,  Sun Liangliang (Department of Chemistry, Michigan State University, Michigan, United States)
資料名： Analytical Chemistry  (Analytical Chemistry)
巻： 92  号： 24  ページ： 15890-15898  発行年： 2020年 
JST資料番号： A0395A  ISSN： 0003-2700  CODEN： ANCHAM  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： トップダウンプロテオミクス(TDP)はプロテオフォーム特異的様式でプロテオームを描写することを目指し,それは細胞過程における蛋白質機能を正確に理解するのに不可欠である。それは,質量分析(MS)とタンデムMS(MS/MS)の前にプロテオフォームの高容量分離を必要とする。cIEFはプロテオフォームの高分解能分離が可能なので,キャピラリー等電点電気泳動(cIEF)-MSは1990年代のTDPのための有用なツールとして認識されてきた。以前のcIEF-MS研究は,MS/MSのない蛋白質質量の測定に集中し,複雑な試料での信頼できるプロテオフォーム同定とプロテオフォーム上の翻訳後修飾の正確な局在化を妨げる。ここでは,初めて,複雑なプロテオームにおけるプロテオフォームの大規模描写のための自動化cIEF-MS/MSに基づくTDPを提示する。単一ショットcIEF-MS/MSは,蛋白質のナノグラムのみを消費する()プロテオームから711のプロテオフォームを同定した。ESI-MS/MSへの二次元サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)-cIEFの結合は,プロテオームからほぼ2000のプロテオフォームの同定を可能にした。SEC-cIEF-MS/MSを用いたゼブラフィッシュ雄および雌脳の無標識定量的TDPは,数千のプロテオフォームを定量し,脳における性依存性プロテオフォームプロファイルを明らかにした。特に,潜在的内因性ホルモンプロテオフォームとして雄ゼブラフィッシュ脳において有意に高い豊度を有するプロオピオメラノコルチンとプロダイノルフィンのいくつかの蛋白質分解プロテオフォームを発見した。脳の多レベル定量的プロテオミクス(TDPとボトムアッププロテオミクス)は,性別間の豊度に統計的に有意な差を持つ大部分のプロテオフォームが蛋白質グループレベルで豊度差を示さないことを明らかにした。本研究は脳の性的二形性の最初のマルチレベル定量的プロテオミクス研究を示す。Copyright 2021 American Chemical Society All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *質量分析 ,  *自動化 ,  タンパク質 ,  *直列接続 ,  二次元 ,  タンパク質分解 ,  高分解能 ,  サイズ排除クロマトグラフィー ,  *タンデム質量分析 ,  プロオピオメラノコルチン ,  ゼブラフィッシュ ,  翻訳後修飾 ,  プロテオーム
準シソーラス用語： 内因性 ,  ESI-MS/MS , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  質量分析  (CC03013N)

タイトルに関連する用語 (6件)： 定量 ,  トップダウン ,  プロテオミクス ,  自動化 ,  キャピラリー等電点分画 ,  タンデム質量分析