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J-GLOBAL ID：202102222395303510   整理番号：21A0280638

Mycogone perniciosaにおけるキチナーゼGH18遺伝子ファミリーのゲノムワイド同定と解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-Wide Identification and Analysis of Chitinase GH18 Gene Family in Mycogone perniciosa

著者 (16件)： Yang Yang (Engineering Research Center of Chinese Ministry of Education for Edible and Medicinal Fungi, Jilin Agricultural University, Changchun, China) ,  Yang Yang (Guizhou Key Laboratory of Edible Fungi Breeding, Guizhou Academy of Agricultural Sciences, Guiyang, China) ,  Yang Yang (College of Plant Protection, Jilin Agricultural University, Changchun, China) ,  Sossah Frederick Leo (Engineering Research Center of Chinese Ministry of Education for Edible and Medicinal Fungi, Jilin Agricultural University, Changchun, China) ,  Sossah Frederick Leo (College of Plant Protection, Jilin Agricultural University, Changchun, China) ,  Li Zhuang (Shandong Provincial Key Laboratory for Biology of Vegetable Diseases and Insect Pests, College of Plant Protection, Shandong Agricultural University, Tai’ an, China) ,  Hyde Kevin D. (Center of Excellence in Fungal Research, Mae Fah Luang University, Chiang Rai, Thailand) ,  Li Dan (Engineering Research Center of Chinese Ministry of Education for Edible and Medicinal Fungi, Jilin Agricultural University, Changchun, China) ,  Li Dan (Guizhou Key Laboratory of Edible Fungi Breeding, Guizhou Academy of Agricultural Sciences, Guiyang, China) ,  Li Dan (College of Plant Protection, Jilin Agricultural University, Changchun, China) ,  Xiao Shijun (Engineering Research Center of Chinese Ministry of Education for Edible and Medicinal Fungi, Jilin Agricultural University, Changchun, China) ,  Fu Yongping (Engineering Research Center of Chinese Ministry of Education for Edible and Medicinal Fungi, Jilin Agricultural University, Changchun, China) ,  Fu Yongping (College of Plant Protection, Jilin Agricultural University, Changchun, China) ,  Yuan Xiaohui (Engineering Research Center of Chinese Ministry of Education for Edible and Medicinal Fungi, Jilin Agricultural University, Changchun, China) ,  Li Yu (Engineering Research Center of Chinese Ministry of Education for Edible and Medicinal Fungi, Jilin Agricultural University, Changchun, China) ,  Li Yu (College of Plant Protection, Jilin Agricultural University, Changchun, China)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 11  ページ： 596719  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Mycogone perniciosaは,Agaricus bisporusおよび種々のAgaricomycetes種における湿潤気泡病を引き起こす。以前の研究において,M.perniciosa Hp10のゲノムにおける41のGH18キチナーゼ遺伝子および他の病原性関連遺伝子を同定した。キチナーゼはキチンを分解する酵素であり,それらは栄養,形態形成および病因において多様な機能を持つ。しかしながら,M.perniciosaにおけるこれらの重要な遺伝子は,完全には特性化されておらず,それらの機能は不明のままである。ここでは,M.perniciosa GH18遺伝子のゲノムワイド分析を行い,A.bisporusの感染の時間経過中のM.perniciosaのトランスクリプトームプロファイルとGH18発現パターンを分析した。15の他の種のそれらによる41のGH18遺伝子の系統解析は,遺伝子がそれらの保存ドメインに基づいて3つのグループと8つのサブグループにクラスタ化されたことを示した。同じグループにクラスタ化されたGH18遺伝子は,異なる遺伝子構造を共有したが,同じ蛋白質モチーフを持っていた。すべてのGH18遺伝子は,異なるオルガネラに局在し,11のコンティグに不均等に分布し,他の13の種にオルソログがあった。12の重複事象を同定し,これらは陽性および精製選択の両方を受けた。トランスクリプトーム分析は,輸送体,細胞壁分解酵素(CWDE),チトクロームP450,病原性関連遺伝子,二次代謝産物および転写因子を含む多数の遺伝子が,A.bisporusのM.perniciosa Hp10感染の異なる段階で有意にアップレギュレートされたことを明らかにした。41のGH18遺伝子のうち23は差次的に発現した。23のGH18遺伝子の発現パターンは異なり,A.bisporusにおけるM.perniciosa Hp10の接種後3日目から有意に発現した。5つの差次的に発現したGH18遺伝子をRT-PCRと遺伝子クローニングのために選択し,RNA-seqデータ精度を検証した。結果は,これらの遺伝子が異なる感染段階で連続的に発現し,以前の配列決定結果と一致することを示した。本研究は,A.bisporusのM.perniciosa mycopparasitismに対する病原性関連およびGH18キチナーゼ遺伝子の影響の総合的解析を提供した。著者らの知見は,M.perniciosaのマイコ寄生菌のさらなる研究の基盤として役立つ可能性があり,結果はA.bisporusにおける耐性を改善し,湿潤気泡疾患を緩和するための効率的な疾病管理戦略を開発する潜在的価値を有する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  湿潤 ,  系統発生 ,  クラスタ化 ,  *ゲノム ,  キチン ,  病原性 ,  形態形成 ,  オルガネラ ,  *キチナーゼ ,  遺伝子クローニング ,  転写因子 ,  病因 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： オルソログ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Mycogone perniciosa ,  キチナーゼグリコシドヒドロラーゼ18遺伝子ファミリー ,  系統発生 ,  トランスクリプトーム ,  発現パターン

分類 (3件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  酵素一般  (EB09010D)

引用文献 (109件)：

• AdamsD. J. (2004). Fungal cell wall chitinases and glucanases. Microbiology 150(Pt 7), 2029-2035. doi: 10.1099/mic.0.26980-0 15256547
• AdrangiS.FaramarziM. A. (2013). From bacteria to human: a journey into the world of chitinases. Biotechnol. Adv. 31 1786-1795. doi: 10.1016/j.biotechadv.2013.09.012 24095741
• AndersS.HuberW. (2010). Differential expression analysis for sequence count data. Genome Biol. 11:R106. doi: 10.1186/gb-2010-11-10-r106 20979621
• AshburnerM.BallC. A.BlakeJ. A.BotsteinD.ButlerH.CherryJ. M. (2000). Gene ontology: tool for the unification of biology. The Gene Ontology Consortium. Nat. Genet. 25 25-29. doi: 10.1038/75556 10802651
• BaileyT. L.WilliamsN.MislehC.LiW. W. (2006). MEME: discovering and analyzing DNA and protein sequence motifs. Nucleic Acids Res. 34 W369-W373. doi: 10.1093/nar/gkl198 16845028

タイトルに関連する用語 (5件)： キチナーゼ ,  遺伝子ファミリー ,  ゲノム ,  同定 ,  解析