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J-GLOBAL ID：202102222841750469   整理番号：21A2823370

ゲノム不安定性の体細胞突然変異由来LncRNAシグネチャーは肝癌患者の予後を予測する【JST・京大機械翻訳】

A Somatic Mutation-Derived LncRNA Signature of Genomic Instability Predicts Prognosis for Patients With Liver Cancer

著者 (10件)： Guo Cheng (Department of Gastroenterology, Tongji Hospital, Tongji University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Zhou Jie (Department of Gastroenterology, Tongji Hospital, Tongji University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Ma Boyu (Department of Gastroenterology, Tongji Hospital, Tongji University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Wang Rui (Department of Gastroenterology, Tongji Hospital, Tongji University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Ge Yanli (Department of Gastroenterology, Tongji Hospital, Tongji University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Wang Zhe (Department of Gastroenterology, Tongji Hospital, Tongji University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Ji Bing (Department of Gastroenterology, Tongji Hospital, Tongji University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Wang Wei (Department of Gastroenterology, Tongji Hospital, Tongji University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Zhang Junjie (Department of Gastroenterology, Tongji Hospital, Tongji University School of Medicine, Shanghai, China) ,  Wang Zhirong (Department of Gastroenterology, Tongji Hospital, Tongji University School of Medicine, Shanghai, China)
資料名： Frontiers in Surgery (Web)  (Frontiers in Surgery (Web))
巻： 8  ページ： 724792  発行年： 2021年 
JST資料番号： U7100A  ISSN： 2296-875X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:ゲノム不安定性は,肝細胞癌(HCC)の特徴の1つと考えられ,臨床治療への大きな挑戦を生じる。新たな証拠はゲノム不安定性の維持における長い非コードRNA(lncRNA)の役割を明らかにした。この研究は,HCCの予後および免疫療法に対する患者の適合性を決定するためのゲノム不安定性と関係したlncRNAシグネチャを開発することを目的にした。方法:本研究では,HCC患者のトランスクリプトームプロファイリング,臨床的特徴および体細胞変異に関連するデータを,癌ゲノムアトラス(TCGA)からダウンロードした。バイオインフォマティクス分析を行い,体細胞変異由来ゲノム不安定性関連lncRNAシグネチャ(GILncSig)を同定し,構築した。単一試料遺伝子セット濃縮分析(ssGSEA)を適用して,免疫細胞浸潤のレベルを推定した。ノモグラムを構築し,キャリブレーションを行ってモデルの有効性を評価した。結果:本研究では,7つのゲノム不安定性関連lncRNAを同定し,予後シグネチャを定義するために使用した。HCC患者を,訓練群におけるリスクスコアの最適カットオフ値(リスクスコア=1.010)に基づいて,生存(生存期間中央値=1.489,1.748年;p=0.006)において有意差を有する高および低リスク群に分類した。さらに,GILncSigは,臨床パラメータ(p<0.001)と比較して,HCC患者の独立危険因子であることが示された。受信者動作特性(ROC)曲線,ノモグラム,および較正プロットに従って,署名は,第1,第3,および第5年のHCC患者の生存率を予測することができた。さらに,ssGSEAは,臨床治療を投与するためのガイド決定における署名の可能性を明らかにした。結論:本研究では,体細胞変異由来lncRNAに基づく新規予後モデルを開発し,内部データセットを用いてそれを検証した。GILncSigの独立性を単変量および追跡調査多変量解析を用いて推定した。免疫学的解析を用いてHCC進行に関与する複合因子を評価した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ノモグラム ,  多変量解析 ,  浸潤 ,  遺伝子 ,  生存率 ,  免疫療法 ,  *予後 ,  肝細胞癌 ,  危険因子 ,  トランスクリプトーム ,  細胞浸潤
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  リスクスコア ,  生存期間中央値 ,  臨床的特徴 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 肝細胞癌 ,  長鎖非コードRNA ,  免疫浸潤 ,  予後 ,  ゲノム不安定性

分類 (3件)： 消化器の腫よう  (GH04000D) ,  腫ようの診断  (GE03020J) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (42件)：

• Longo DL, Villanueva A. Hepatocellular carcinoma. N Engl J Med. (2019) 380:1450-62. doi: 10.1056/NEJMra1713263
• Pugh RN. Sorafenib in advanced hepatocellular carcinoma. N Engl J Med. (2008) 359:2497-8. doi: 10.1056/NEJMc081780
• Sonbol B, Riaz IB, Naqvi SAA, Almquist DR, Bekaii-Saab T. Systemic therapy and sequencing options in advanced hepatocellular carcinoma: a systematic review and network meta-analysis. JAMA Oncol. (2020) 6:e204930. doi: 10.1001/jamaoncol.2020.4930
• Allaire M, Nault JC. Advances in management of hepatocellular carcinoma. Curr Opin Oncol. (2017) 29:288-95. doi: 10.1097/CCO.0000000000000378
• Kamarajah SK, Frankel TL, Sonnenday C, Cho CS, Nathan H. Critical evaluation of the American Joint Commission on Cancer (AJCC) 8th edition staging system for patients with Hepatocellular Carcinoma (HCC): A Surveillance, Epidemiology, End Results (SEER) analysis. J Surg Oncol. (2017) 117:644-50. doi: 10.1002/jso.24908

タイトルに関連する用語 (7件)： ゲノム不安定性 ,  体細胞突然変異 ,  lncRNA ,  シグネチャー ,  肝癌 ,  患者の予後 ,  予測