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J-GLOBAL ID：202102222881020244   整理番号：21A2112855

剛直な不動性Holliday接合と階層的DNAナノ構造の蛋白質支援室温集合【JST・京大機械翻訳】

Protein-Assisted Room-Temperature Assembly of Rigid, Immobile Holliday Junctions and Hierarchical DNA Nanostructures

著者 (9件)： Ramakrishnan Saminathan (Technical and Macromolecular Chemistry, Paderborn University, Warburger Str. 100, 33098 Paderborn, Germany) ,  Ramakrishnan Saminathan (Structural Biophysics Laboratory, Center for Cancer Research, National Cancer Institute, Frederick, MD 21702, USA) ,  Subramaniam Sivaraman (Biotechnology Center, Department of Genomics, Technische Universitaet Dresden, Tatzberg 47-51, 01307 Dresden, Germany) ,  Subramaniam Sivaraman (Cluster of Excellence Physics of Life, Technische Universitaet Dresden, 01062 Dresden, Germany) ,  Kielar Charlotte (Technical and Macromolecular Chemistry, Paderborn University, Warburger Str. 100, 33098 Paderborn, Germany) ,  Grundmeier Guido (Technical and Macromolecular Chemistry, Paderborn University, Warburger Str. 100, 33098 Paderborn, Germany) ,  Stewart A. Francis (Biotechnology Center, Department of Genomics, Technische Universitaet Dresden, Tatzberg 47-51, 01307 Dresden, Germany) ,  Stewart A. Francis (Cluster of Excellence Physics of Life, Technische Universitaet Dresden, 01062 Dresden, Germany) ,  Keller Adrian (Technical and Macromolecular Chemistry, Paderborn University, Warburger Str. 100, 33098 Paderborn, Germany)
資料名： Molecules (Web)  (Molecules (Web))
巻： 25  号： 21  ページ： 5099  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7014A  ISSN： 1420-3049  CODEN： MOLEFW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 移動性Holliday接合は構造DNAナノテクノロジーの最も基本的なビルディングブロックであるだけでなく,遺伝子組換とエピジェネティックのin vitro研究にとっても非常に重要である。ここでは,一本鎖アニーリング蛋白質レッドの助けと不動ホリド接合の室温アセンブリに関する詳細な研究を示した。個々のDNA単一鎖は,最初に蛋白質単量体で被覆され,続いてハイブリッド化され,剛直な鈍い末端4腕接合部を形成する。異なるDNA/蛋白質比及び異なるDNA配列長に対するこの方法の効率を調べた。さらに,著者らは,階層的集合への粘着性末端修正Holliday接合をアニールするRedの可能性も評価した。著者らは,Holliday接合二量体,多量体,およびサイズ数ミクロンのネットワーク拡張のレッド媒介アニーリングを実証した。これらのハイブリッドDNA蛋白質ナノ構造はDNA蛋白質複合体の結晶化における応用を見出すかもしれないが,著者らの研究は温和な反応条件下で機能的DNAナノ構造の合成を助けるRedの大きな可能性を示す。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 結晶化 ,  焼なまし ,  ネットワーク ,  *DNA【核酸】 ,  *タンパク質 ,  単量体 ,  多量体 ,  タンパク質複合体 ,  原子間力顕微鏡 ,  *ナノ構造 ,  in vitro実験 ,  エピジェネティクス
準シソーラス用語： DNA配列 ,  ビルディングブロック ,  DNAナノテクノロジー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： DNAナノテクノロジー ,  Hollidayジャンクション ,  原子間力顕微鏡 ,  一本鎖アニーリング蛋白質 ,  Redβ

分類 (1件)： 生薬の薬理の基礎研究  (GX06020J)

引用文献 (45件)：

• Brázda, V.; Laister, R.C.; Jagelská, E.B.; Arrowsmith, C. Cruciform structures are a common DNA feature important for regulating biological processes. BMC Mol. Biol. 2011, 12, 33.
• Eichman, B.F.; Ortiz-Lombardı́a, M.; Aymamı́, J.; Coll, M.; Ho, P.S. The Inherent Properties of DNA Four-way Junctions: Comparing the Crystal Structures of Holliday Junctions. J. Mol. Biol. 2002, 320, 1037-1051.
• Yan, J.; Hong, S.; Guan, Z.; He, W.; Zhang, D.; Yin, P. Structural insights into sequence-dependent Holliday junction resolution by the chloroplast resolvase MOC1. Nat. Commun. 2020, 11, 1417.
• Mount, A.R.; Mountford, C.P.; Evans, S.A.G.; Su, T.-J.; Buck, A.H.; Dickinson, P.; Campbell, C.J.; Keane, L.M.; Terry, J.G.; Beattie, J.S.; et al. The stability and characteristics of a DNA Holliday junction switch. Biophys. Chem. 2006, 124, 214-221.
• Panyutin, I.G.; Biswas, I.; Hsieh, P. A pivotal role for the structure of the Holliday junction in DNA branch migration. EMBO J. 1995, 14, 1819-1826.

タイトルに関連する用語 (7件)： 動性 ,  DNA ,  ナノ構造 ,  蛋白質 ,  支援 ,  室温 ,  集合