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J-GLOBAL ID：202102223093770667   整理番号：21A2844114

共通刺胞動物LabモデルNematostella vectensisの初期Virome特性化【JST・京大機械翻訳】

Initial Virome Characterization of the Common Cnidarian Lab Model Nematostella vectensis

著者 (3件)： Lewandowska Magda ,  Hazan Yael ,  Moran Yehu
資料名： Viruses (Web)  (Viruses (Web))
巻： 12  号： 2  ページ： 218  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7293A  ISSN： 1999-4915  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 安定なホロビオントの形成におけるウイルスの役割は近年の広範な研究の主題である。しかし,多くの新生モデル生物は,関連するウイルス群集の組成に関するデータをまだ欠いている。ここでは,最も一般的に使用されるAnthozoan laborモデルであり,ウイルス配列を探索する,星形海のNematostella vectensisの7つの公的に利用可能なトランスクリプトームデータセットを再分析した。de novo集合の簡単だが強力なアプローチ,次いで相同性に基づくウイルス同定と多段階,徹底的な分類学的検証を適用した。N.vectensisの異なる研究室個体群の比較は,すべての成体データセットに存在する21のウイルス配列から成るコアビロームの存在を明らかにした。意外なことに,著者らは初期発生段階からのサンプルにおけるウイルスのほとんど完全な欠如を観察し,それは実験室における食物の主要源と共有するウイルスの同定と共に,塩水エビArtemia salinaはN.vectensisにおけるウイルス種取得の過程に新しい光を投げた。本研究は,N.vectensis viromeに対する初期ではあるが包括的な洞察を提供し,この研究室モデル動物におけるウイルスと抗ウイルス系の機能研究のための最初の基礎をセットする。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 食品 ,  塩水 ,  海洋 ,  *成体 ,  個体群 ,  キャラクタリゼーション ,  相同性 ,  トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *Nematostella ,  *刺胞動物 ,  動物モデル ,  Artemia salina ,  分類学 ,  *Nematostella vectensis , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Nematostella vectensis ,  ウイルス ,  刺胞動物 ,  RNA-seq

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  発生と分化  (EJ16020W)

引用文献 (67件)：

• Breitbart, M.; Rohwer, F. Here a virus, there a virus, everywhere the same virus? Trends Microbiol. 2005, 13, 278-284.
• Edwards, R.A.; Rohwer, F. Viral metagenomics. Nat. Rev. Microbiol. 2005, 3, 504-510.
• Grasis, J.A.; Lachnit, T.; Anton-Erxleben, F.; Lim, Y.W.; Schmieder, R.; Fraune, S.; Franzenburg, S.; Insua, S.; Machado, G.; Haynes, M.; et al. Species-specific viromes in the ancestral holobiont Hydra. PLoS ONE 2014, 9, e109952.
• Shi, M.; Lin, X.D.; Tian, J.H.; Chen, L.J.; Chen, X.; Li, C.X.; Qin, X.C.; Li, J.; Cao, J.P.; Eden, J.S.; et al. Redefining the invertebrate RNA virosphere. Nature 2016, 540, 539-543.
• Liu, L.; Gong, T.; Tao, W.; Lin, B.; Li, C.; Zheng, X.; Zhu, S.; Jiang, W.; Zhou, R. Commensal viruses maintain intestinal intraepithelial lymphocytes via noncanonical RIG-I signaling. Nat. Immunol. 2019, 20, 1681-1691.

タイトルに関連する用語 (4件)： 刺胞動物 ,  モデル ,  初期 ,  特性化