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J-GLOBAL ID：202102223395381748   整理番号：21A0293234

ガーナの2つの異なる生態学的地域におけるPlasmodium falciparumのサーカムスポロゾイト蛋白質の集団遺伝学的解析【JST・京大機械翻訳】

Population genetic analysis of the Plasmodium falciparum circumsporozoite protein in two distinct ecological regions in Ghana

著者 (7件)： Amegashie Elikplim A. (Department of Biochemistry, Jomo Kenyatta University of Agriculture and Technology, Juja, Kenya) ,  Amenga-Etego Lucas (Department of Biochemistry, Cell and Molecular Biology, West African Centre for Cell Biology of Infectious Pathogens, University of Ghana, Legon, Ghana) ,  Adobor Courage (Parasitology Department, Noguchi Memorial Institute of Medical Research, University of Ghana, , Legon, Ghana) ,  Ogoti Peter (Department of Biochemistry, Jomo Kenyatta University of Agriculture and Technology, Juja, Kenya) ,  Mbogo Kevin (Department of Biochemistry, Jomo Kenyatta University of Agriculture and Technology, Juja, Kenya) ,  Amambua-Ngwa Alfred (Disease Control and Elimination, Medical Research Council Unit, The Gambia Unit, Bakau, The Gambia) ,  Ghansah Anita (Parasitology Department, Noguchi Memorial Institute of Medical Research, University of Ghana, , Legon, Ghana)
資料名： Malaria Journal (Web)  (Malaria Journal (Web))
巻： 19  号： 1  ページ： 1-14  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7332A  ISSN： 1475-2875  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Plasmodium falciparum cirsporozoite蛋白質(PfCSP)における広範な遺伝的多様性は,RTS,S/AS01ワクチンの中程度の有効性に対する主要な寄与因子である。個体群内および間の組換えの伝達強度および率は,その遺伝的多様性の程度に影響する。異なる伝達設定におけるPfCSP遺伝的多様性の程度と動力学の理解は,ガーナのようなマラリア流行地域における個体群内および集団間で行われた現在のRTS,S有効性およびフェーズIV実施試験の結果を解釈するのに役立つであろう。Pfcsp配列は,ガーナにおいて,それぞれ,Cape Coast(沿岸帯)およびNavrongo(Guinea salinah地域)における健康施設で臨床マラリアを示す6~59か月齢の子供からの101および131マラリア試料のIllumina生成対末端短読配列から検索した。配列を3D7参照株ゲノム上にマッピングし,高品質ゲノムワイドコーディング配列データを得た。欠測データを除去するデータフィルタリングと品質チェックの後,220の配列を保持し,対立遺伝子頻度スペクトル,宿主内の遺伝的多様性,および選択の個体群とシグネチャの両方を分析した。個体群遺伝学ツールを用いて,ガーナの2つの地理的に異なる場所からP.falciparumにおけるPfcsp多様性の程度と動態を決定した。Pfcspは2つのサイトで広範な多様性を示し,より高い伝達部位,Navrongo,より高い宿主内と個体群レベルの多様性を示した。Pfcspのワクチン株C末端エピトープは,NavrongoとCape Coast配列のそれぞれ5.9%と45.7%に見出された。PfCSPのTH2RとTH3Rエピトープ領域において,1と6のアミノ酸変異が観察された。TajimaのDは,特にCape Coastからの個体群に対して,予期された歴史的個体群拡大を与えられた。対照的に,Navrongo P.falciparum個体群では正のTajima Dが観察され,免疫優性TH2RとTH3Rワクチンエピトープに作用するバランス選択と一致した。分析した個体群におけるPfcspワクチンハプロタイプの低周波数は,RTS,S応用を目標とする固有個体群におけるより広い時間的および地理的サンプリングによる付加的分子および免疫疫学研究の必要性を示す。これらの結果は,ガーナにおけるワクチンの有効性に意味があり,将来の多価またはキメラワクチンに含まれる対立遺伝子の選択を知らせるであろう。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *タンパク質 ,  マラリア ,  ワクチン ,  沿岸帯 ,  スペクトル ,  ゲノム ,  キメラ ,  *マラリア原虫 ,  子供 ,  対立遺伝子 ,  *生態学 ,  個体群 ,  *Plasmodium falciparum ,  遺伝子頻度 ,  エピトープ

著者キーワード (4件)： Plasmodium falciparumのサーカムスポロゾイト蛋白質 ,  遺伝的多様性 ,  選択 ,  宿主内多様性

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (58件)：

• World malaria report; 2019; CR1; citation_publisher=World Health Organization
• Lancet; Efficacy and safety of RTS, S/AS01 malaria vaccine with or without a booster dose in infants and children in Africa: final results of a phase 3, individually randomised, controlled trial; ; 386; 2015; 31-45; 10.1016/S0140-6736(15)60721-8; citation_id=CR2
• Pharm J; First malaria vaccine receives positive scientific opinion from EMA; ; 44; 2015; 30-32; citation_id=CR3
• Malaria Vaccine Implementation Programme (MVIP): proposed framework for policy decision on RTS, S/AS01 malaria vaccine; 2019; CR4; citation_publisher=World Health Organization
• N Engl J Med; A preliminary evaluation of a recombinant circumsporozoite protein vaccine against Plasmodium falciparum malaria; JA Stoute, M Slaoui, DG Heppner, P Momin, KE Kester, P Desmons; 336; 1997; 86-91; 10.1056/NEJM199701093360202; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (7件)： ガーナ ,  生態 ,  地域 ,  Plasmodium ,  サーカムスポロゾイト蛋白質 ,  集団遺伝学 ,  解析