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J-GLOBAL ID：202102223519684275   整理番号：21A0461927

生化学ネットワークのフラックスバランス解析に対する洞察【JST・京大機械翻訳】

An insight to flux-balance analysis for biochemical networks

著者 (3件)： Anand Shreya (Department of Bio-Engineering, Birla Institute of Technology, Ranchi, JH, India) ,  Mukherjee Koel (Department of Bio-Engineering, Birla Institute of Technology, Ranchi, JH, India) ,  Padmanabhan Padmini (Department of Bio-Engineering, Birla Institute of Technology, Ranchi, JH, India)
資料名： Biotechnology and Genetic Engineering Reviews  (Biotechnology and Genetic Engineering Reviews)
巻： 36  号： 1  ページ： 32-55  発行年： 2020年 
JST資料番号： W5796A  ISSN： 0264-8725  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ABSTRACT:システム生物学は,生物学的システムを研究するための統合方法の1つであり,以前に使用されたアプローチより好ましい。それは代謝経路解析,モデリングおよび調節ならびに細胞挙動への洞察を得るためのシグナル伝達を含む。モデリングの種々の技術の中で,シミュレーション,ネットワークと経路の解析,フラックスベース解析(FBA)は,その拡張性と単純性のために認識されてきた。正確な速度データに依存する機構的シミュレーションのように,広く受け入れられている。ネットワークを通るフラックスの研究は有益であり,速度データがない場合でも洞察を与えることができる。FBAは,生化学ネットワークを研究し,反応化学量論,成長要求,生物系の特異的測定パラメータ,特にゲノム規模に対する代謝ネットワークの再構成,特に既に以前に構築されている代謝ネットワークの再構成のために必要なツールの1つである。それは,特定の遺伝子セットで可能かつ達成可能なフラックス分布の境界を定義する。このレビュー論文はFBAへの洞察を与え,フラックスバランスの数学的表現への拡張から,フラックスバランス解析問題の定式化について議論し,FASIMA,COBRAツールボックス,およびOptFluxのようなFBAで使用できる経路とツールの化学量論の制約を定義した。また,FBAによってカバーできるアプリケーションと,FBAを通して対処できるクエリーに関して,より広い領域を含む。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： シミュレーション ,  生体系 ,  *ネットワーク ,  遺伝子 ,  化学量論 ,  ゲノム ,  代謝経路 ,  応用プログラム ,  定式化 ,  細胞情報伝達
準シソーラス用語： システム生物学 ,  ツールキット ,  クエリー ,  代謝ネットワーク ,  *生化学ネットワーク , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： フラックスバランス解析(FBA) ,  代謝経路 ,  システム生物学 ,  細胞代謝

分類 (1件)： 代謝と栄養  (EG03054K)

タイトルに関連する用語 (3件)： 生化学ネットワーク ,  解析 ,  洞察