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J-GLOBAL ID：202102225099614153   整理番号：21A2535299

肺塞栓患者の差次的メチル化部位と領域分析【JST・京大機械翻訳】

Analysis of Differentially Methylated Sites and Regions in Patients with Pulmonary Embolism

著者 (7件)： Cao Guolei (新疆医科大学附属腫瘤医院呼吸与神経内科,烏魯木斉 830011) ,  He Lili (新疆医科大学附属腫瘤医院呼吸与神経内科,烏魯木斉 830011) ,  Ma Ronghui (新疆医科大学附属腫瘤医院呼吸与神経内科,烏魯木斉 830011) ,  Tang Le (新疆医科大学附属腫瘤医院呼吸与神経内科,烏魯木斉 830011) ,  Cao Jiarui (新疆医科大学附属腫瘤医院呼吸与神経内科,烏魯木斉 830011) ,  Niu Haiwen (新疆医科大学附属腫瘤医院呼吸与神経内科,烏魯木斉 830011) ,  Luo Qin (新疆医科大学附属腫瘤医院呼吸与神経内科,烏魯木斉 830011)
資料名： Huazhong Keji Daxue Xuebao Yixueban  (Huazhong Keji Daxue Xuebao Yixueban)
巻： 50  号： 3  ページ： 292-296  発行年： 2021年 
JST資料番号： C2694A  ISSN： 1672-0741  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】肺塞栓症患者におけるメチル化CpG部位,メチル化領域,および対応する標的遺伝子を調査し,肺塞栓形成におけるDNAメチル化の役割を調査する。【方法】2019年1月から2019年12月まで,新疆医科大学付属腫瘍病院で診断された単純肺塞栓患者と正常対照の末梢血サンプル10例を収集し,DNAを抽出した。IlluminaInfiniumMethylationEPICBeadChipチップ(850Kチップ)のメチル化検出プラットフォームを用い、全ゲノムレベルで肺塞栓グループと正常対照グループのメチル化部位を測定した。RパッケージLimmaを用いて、2群間の差異メチル化部位の分析を行い、Bumphunterの方法を用い、2群間の差次的メチル化領域を探った。【結果】1肺塞栓症群と対照群の間で,95286の有意差があるCpG部位(P<0.05)、そのうち37983個は高メチル化、57303個は低メチル化であった。28273の目的遺伝子のうち,13785は高メチル化,14488は低メチル化であった。CpG島におけるCpG島の分布状況は,CpG島29%(27483),Shore18%(16700),Shelf6%(6011),Opensea47%(45092)であった。2.Bumphunterの方法を用い、差次的メチル化領域を探し、2群間の差次的メチル化領域DMR-1、DMR-2を選別した。3番染色体(195489708-195490309)と6番染色体(49681178-49681774)(すべてP<0.05)。DMR-1の幅は601bpであり,DMR-2の幅は596bpであり,DMR-1は8つのCpG部位(cg23170091,cg18918831,cg16034541など)を含み,8つのCpG部位を含んでいた。DMR-2は11のCpG部位(cg01706515、cg14997592、cg26715042など)を含み、その所属するクラスターは11のCpG部位を含む。肺塞栓群のDMR-1とDMR-2のすべてのCpG部位のメチル化レベルは正常群より高かった。DMR-1標的遺伝子はMUC4であり,DMR-2標的遺伝子はCRISP2であった。【結語】DNAの高メチル化は,おそらく肺塞栓症の発生に関与し,cg06417478,cg18105134,およびHOOK2,PROZ,DMR-1,およびDMR-1の過剰発現に関与する。DMR-2に含まれる差異CpG部位及びその目的遺伝子MUC4、CRISP2の異常メチル化は、おそらく肺塞栓の発生において重要な役割を果たしている。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *メチル化 ,  DNA【核酸】 ,  染色体 ,  腫瘍 ,  クラスタ ,  肺塞栓症 ,  末梢血
準シソーラス用語： DNAメチル化 ,  CpGアイランド ,  異常メチル化 ,  CpG ,  標的遺伝子 ,  過剰発現 ,  低メチル化 ,  Rパッケージ , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (1件)： 呼吸器の腫よう  (GI04000G)

タイトルに関連する用語 (5件)： 肺 ,  塞栓 ,  患者 ,  メチル化 ,  分析