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J-GLOBAL ID：202102225343661237   整理番号：21A0721387

RNA配列転移に対するUVA誘導変化の特性化【JST・京大機械翻訳】

Characterization of UVA-Induced Alterations to Transfer RNA Sequences

著者 (3件)： Sun Congliang ,  Limbach Patrick A. ,  Addepalli Balasubrahmanyam
資料名： Biomolecules (Web)  (Biomolecules (Web))
巻： 10  号： 11  ページ： 1527  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7148A  ISSN： 2218-273X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 紫外線照射(UVR)はDNA,RNAおよびそれらのヌクレオシド修飾の完全性に悪影響を与える。液体クロマトグラフィータンデム質量分析(LCMS/MS)に基づくRNA修飾マッピングアプローチを採用することにより,光酸化に最も脆弱である移動RNA(tRNA)領域を同定した。アンチコドンおよび可変ループ領域への光酸化損傷を,UVA(370nm)曝露でのtRNAの修飾および非修飾配列の両方で一貫して観察した。しかし,酸化グアノシンに関して測定した酸化損傷の程度は,修飾版と比較して未修飾RNAで高く,ヌクレオシド修飾の補助的役割を示唆した。アンチコドンステムループ領域で形成された酸化生成物のタイプは,修飾型,状態,およびtRNAが曝露中の細胞の内側または外側で変化した。UVA曝露後のtRNAのオリゴヌクレオチドに基づく特性化も,ヌクレオシド分析だけで観察されなかった新しい光生成物と安定な中間体の存在を明らかにした。この手法は配列特異的情報を提供し,tRNAにおけるUVA誘導損傷の潜在的ホットスポットを明らかにした。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 酸化 ,  液体クロマトグラフィー ,  光酸化 ,  紫外線照射 ,  DNA【核酸】 ,  *RNA【核酸】 ,  tRNA ,  アンチコドン ,  ヌクレオシド ,  オリゴヌクレオチド ,  ホットスポット ,  タンデム質量分析 ,  中間体 ,  プリンヌクレオシド ,  リボヌクレオシド
準シソーラス用語： RNA修飾 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： UVR ,  光酸化 ,  tRNA ,  転写後ヌクレオシド修飾 ,  カスチビン ,  RNA修飾マッピング ,  RNA酸化

分類 (1件)： 核酸一般  (EB04010U)

物質索引 (1件)： グアノシン

引用文献 (81件)：

• Ibba, M.; Soll, D. Aminoacyl-tRNA synthesis. Annu. Rev. Biochem. 2000, 69, 617-650.
• Quigley, G.; Rich, A. Structural domains of transfer RNA molecules. Science 1976, 194, 796-806.
• Schmeing, T.M.; Voorhees, R.M.; Kelley, A.C.; Gao, Y.-G.; Murphy, F.V.; Weir, J.R.; Ramakrishnan, V. The Crystal Structure of the ribosome bound to EF-Tu and aminoacyl-tRNA. Science 2009, 326, 688-694.
• Zhang, J.; Ferre-D’Amare, A.R. The tRNA Elbow in structure, recognition, and evolution. Life 2016, 6, 3.
• Shepherd, J.; Ibba, M. Bacterial transfer RNAs. FEMS Microbiol. Rev. 2015, 39, 280-300.

タイトルに関連する用語 (4件)： RNA ,  UVA ,  誘導 ,  特性化