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J-GLOBAL ID：202102225364031217   整理番号：21A2713493

蛋白質の分子進化における遺伝コードの表現型発現における非対称性の重要性について【JST・京大機械翻訳】

On the Importance of Asymmetry in the Phenotypic Expression of the Genetic Code upon the Molecular Evolution of Proteins

著者 (2件)： Jose Marco V. ,  Zamudio Gabriel S.
資料名： Symmetry (Web)  (Symmetry (Web))
巻： 12  号： 6  ページ： 997  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7282A  ISSN： 2073-8994  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 標準遺伝子コード(SGC)は,4つのRNAヌクレオチド(C,A,U,G)の64の可能性のある配列間のマッピングであり,そこでは61のコドンが特異的アミノ酸に割り当てられ,他の3つは蛋白質合成を停止させるための停止コドンである。アミノアシル-tRNAシンテターゼ(aaRSs)は,その同族移動RNA(tRNA)のみを特異的にアミノアシル化することによりSGCを実装することに関与し,それによってアミノ酸を対応するアンチコドン三重項と結合させる。tRNA分子は各コドンとアンチコドンと結合する。SGCの対称/非対称特性の意味を理解するために,著者らは既知の対称性を有する合成遺伝コードとSGCの同じ縮退を設計した。蛋白質進化の中性モデルの下で各アミノ酸に対する置換率に及ぼすそれらの影響を決定した。ヌクレオチドの全ての可能な配列に対するコドンとアンチコドンに対するSGCの表現型グラフは非対称であり,アミノ酸は軌道を形成しないことを証明した。対称合成コードにおいて,アミノ酸はコドン性に従ってグループ分けされ,これは与えられたアミノ酸をコードする三重項の数である。SGCと対称合成コードの両方は,それらの縮退に比例したアミノ酸の発生確率を示した。SGCと異なり,合成コードはそれらのコドン性に従ってアミノ酸の発生の一定の確率を示した。SGCのコドンとアンチコドンの表現型グラフの非対称性は,蛋白質の進化過程に重要な意味合いを持つ。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *対称性 ,  アミノ酸 ,  RNA【核酸】 ,  tRNA ,  アンチコドン ,  遺伝子 ,  コドン ,  *タンパク質 ,  タンパク質合成 ,  ヌクレオチド ,  アミノアシルtRNA ,  *分子進化 ,  終止コドン ,  アミノアシル化 ,  合成酵素

著者キーワード (6件)： 標準遺伝コード ,  対称性 ,  非対称性 ,  アンチコドンコード ,  表現型グラフ ,  蛋白質進化

分類 (3件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  酵素一般  (EB09010D)

引用文献 (36件)：

• Nirenberg, M.W.; Matthaei, J.H. The dependence of cell-free protein synthesis in E. coli upon naturally occurring or synthetic polyribonucleotides. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1961, 47, 1588-1602.
• Nirenberg, M.W.; Jones, O.W.; Leder, P.; Clark, B.F.C.; Sly, W.S.; Pestka, S. On the Coding of Genetic Information. Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol. 1963, 28, 549-557.
• Gamow, G. Possible Relation between Deoxyribonucleic Acid and Protein Structures. Nature 1954, 173, 318.
• Crick, F.H.C.; Griffith, J.S.; Orgel, L.E. Codes Without Commas. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1957, 43, 416-421.
• Hornos, J.E.M.; Hornos, Y.M.M. Algebraic model for the evolution of the genetic code. Phys. Rev. Lett. 1993, 71, 4401-4404.

タイトルに関連する用語 (6件)： 蛋白質 ,  分子進化 ,  遺伝 ,  表現型発現 ,  非対称性 ,  重要性