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J-GLOBAL ID：202102225459907628   整理番号：21A0110768

2つの地域の3つのブタ非定型ウイルスの流行と遺伝進化分析【JST・京大機械翻訳】

Genetic variation and evolution of three atypical porcine pestivirus strains from Guangxi and Guangdong

著者 (2件)： Wang Xiaoru (華南理工大学食品科学与工程学院,广東 广州 510641) ,  Yan He (華南理工大学食品科学与工程学院,广東 广州 510641)
資料名： Zhongguo Yufang Shouyixuebao  (Zhongguo Yufang Shouyixuebao)
巻： 42  号： 9  ページ： 955-958,965  発行年： 2020年 
JST資料番号： C3099A  ISSN： 1008-0589  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 我が国の2つの地区の豚の非典型的な疫病ウイルス(APPV)の流行と変異状況を把握するため、本研究は2017年2018年にこの地区の2つの規模化養殖場から10例の先天性振戦子豚の各組織病のサンプルを採集し、RT-PCRによるAPPV検査を行った。このウイルスのオープンリーディングフレーム(ORF)遺伝子配列のRT-PCR増幅とシークエンシングを行い、ORF遺伝子、この遺伝子に含まれるE2とP7遺伝子に対してヌクレオチドとアミノ酸配列の相同性分析及びこれらの3種類の遺伝子の遺伝進化分析を行った。結果は,10のサンプルがAPPV陽性であり,3つのAPPVのORF遺伝子の完全長配列がRT-PCRによって増幅されたことを示した。ORF遺伝子配列分析により、3株のAPPV間のヌクレオチド相同性は81.6%99.8%であり、41株の中国株との相同性は80.8%99.3%であり、19株の国外参考株との相同性は81.3%91.1%であった。E2とP7遺伝子の相同性分析の結果はORF遺伝子との相同性分析結果と一致した。ORF、E2とP7遺伝子の遺伝進化ツリーは、広西豚場で分離されたGX-GL1株とGX-GL67株が遺伝子1型に属し、広東豚場で分離されたGD-CT4株は遺伝子3型に属することを示した。上記結果により、3株のAPPVと中国株との親縁関係がより近く、両広地区のAPPV遺伝子型は地域差異性を呈し、本研究はAPPVの中国の流行状況を理解するのに役立つことが分かった。Data from Wanfang. Translated by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アミノ酸配列 ,  *遺伝 ,  遺伝子 ,  振戦 ,  ヌクレオチド ,  異性体 ,  養殖場 ,  地域差 ,  疫病 ,  相同性 ,  RT-PCR法
準シソーラス用語： 配列解析 ,  オープンリーディングフレーム ,  遺伝子配列 ,  子豚 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 感染症・寄生虫症一般  (GD01010H) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (7件)： 地域 ,  ブタ ,  ウイルス ,  流行 ,  遺伝 ,  進化 ,  分析