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J-GLOBAL ID：202102225754545335   整理番号：21A2347377

Prunus campanulata Maximのトランスクリプトームと花の遺伝子分析【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome and flower genes analysis of Prunus campanulata Maxim

著者 (5件)： Huang Kuan-Feng (School of Forestry and Resource Conservation, National Taiwan University, Taipei, Taiwan) ,  Wen Chi-Hsiang (School of Forestry and Resource Conservation, National Taiwan University, Taipei, Taiwan) ,  Wang Chieh-Ting (Experimental Forest, National Taiwan University, Taipei, Taiwan) ,  Chu Fang-Hua (School of Forestry and Resource Conservation, National Taiwan University, Taipei, Taiwan) ,  Chu Fang-Hua (Experimental Forest, National Taiwan University, Taipei, Taiwan)
資料名： Journal of Horticultural Science & Biotechnology  (Journal of Horticultural Science & Biotechnology)
巻： 95  号： 1  ページ： 44-52  発行年： 2020年 
JST資料番号： W1995A  ISSN： 1462-0316  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Prunus campanulata Maxim.(syn.Cerasus campanulataまたはPrunus cerasoides var.campanulata)は台湾固有の野生チェリーの種である。Cerasu属におけるほとんどの種とは異なり,熱帯気候に対する亜熱帯は自然であり,しばしば都市における観賞または路側樹木として植えられている。花はP.campanulataの最も魅力的な部分であるが,この種における開花に関与する遺伝子は未知である。P.campanulata花序と葉のトランスクリプトームを,不調質技術によって配列決定した。合計36,315のコンティグを得て,そのうち22,531を遺伝子として予測した。花関連遺伝子では,24の遺伝子はMIKCグループに属し,1つのFT様遺伝子(PcFTL)はPEBP遺伝子ファミリーに属する。PcFTL配列の解析は,それが花活性化剤であることを示唆する。花発生経路上の遺伝子の発現も調べ,結果はABCモデルに属する遺伝子が花序で高度に発現し,P.campanulataトランスクリプトームデータベースが信頼できることを示した。本研究では,P.campanulata花序と葉のトランスクリプトームの概要を示し,P.campanulataの花関連遺伝子を調べた。これらの知見は,P.campanulataにおける開花の遺伝子調節の理解を改善する。AGL-AGAMOUS LIKE;AP3:APETALA3;BLAST-Basic局所アラインメント検索ツール;CO-CONSTANTS;EMBL-欧州分子生物学研究所;EMF-Embryonic花;FD-低下Locus D;FLC-FLOWERING LOCUS C;FPKM-フラグメントは,1百万あたりの転写産物のキロ塩基あたり;FRI-FRIGIDA;FT-低下Locus T;FTL-低下Locus T様;gDNA-ゲノムDNA;GI-GIGANTEA;GO-遺伝子オントロジー;LFY-LEAFY;MFT-MOTHER OF FTとTFL1;バイオテクノロジー情報のためのNCBI-National Center;NGS-次世代配列決定;ORF-Open Reading Frame;PEBP-ホスファチジルエタノールアミン結合蛋白質;PI-PISTILLATA;QTL-定量的形質遺伝子座;SOC-SUPPRESSOR OF OVEREXPRESSTION OF CONSTANS 1;SSEP-SEPALLATA;SVP-SHORT VEGETATIVE PHASE;TAIR-Arabidopsis情報資源;TFL-TERMNAL FLOWER1様様であった。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アラインメント ,  *遺伝子 ,  桜桃 ,  亜熱帯 ,  分子生物学 ,  遺伝的調節 ,  *サクラ属 ,  花序 ,  遺伝子発現 ,  Arabidopsis ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *遺伝子解析 ,  コンティグ ,  転写産物 ,  遺伝子オントロジー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Prunus campanulata ,  Cerasus campanulata ,  Prunus cerasoides var.campanulata ,  花の遺伝子発現 ,  トランスクリプトーム ,  次世代シークエンシング

分類 (2件)： 野菜  (FC03043X) ,  果樹  (FC03042G)

タイトルに関連する用語 (4件)： Prunus ,  トランスクリプトーム ,  花 ,  遺伝子分析