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J-GLOBAL ID：202102226046817121   整理番号：21A2823228

骨肉腫生存の予測バイオマーカーとしてのオートファジー関連遺伝子と長鎖非コードRNAシグネチャー【JST・京大機械翻訳】

Autophagy-Related Genes and Long Noncoding RNAs Signatures as Predictive Biomarkers for Osteosarcoma Survival

著者 (9件)： Zhang Jian (Department of Orthopedics, The Second Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China) ,  Zhang Jian (Institute of Orthopedics of Jiangxi Province, Nanchang, China) ,  Ding Rui (Department of Orthopedics, The Second Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China) ,  Wu Tianlong (Department of Orthopedics, The Second Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China) ,  Wu Tianlong (Institute of Minimally Invasive Orthopedics, Nanchang University, Nanchang, China) ,  Jia Jingyu (Department of Orthopedics, The Second Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China) ,  Cheng Xigao (Department of Orthopedics, The Second Affiliated Hospital of Nanchang University, Nanchang, China) ,  Cheng Xigao (Institute of Orthopedics of Jiangxi Province, Nanchang, China) ,  Cheng Xigao (Institute of Minimally Invasive Orthopedics, Nanchang University, Nanchang, China)
資料名： Frontiers in Cell and Developmental Biology (Web)  (Frontiers in Cell and Developmental Biology (Web))
巻： 9  ページ： 705291  発行年： 2021年 
JST資料番号： U7062A  ISSN： 2296-634X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 骨肉腫は,十代と子供の生命を深刻に脅かす一般的な悪性腫瘍である。オートファジーはオートファジー関連遺伝子(ARG)により媒介される細胞内代謝過程であり,骨肉腫の進行および薬剤耐性と関連することが知られている。本研究では,TARGETと遺伝子型組織発現(GTEx)データベースからのRNA配列データを分析した。骨肉腫患者の臨床転帰を正確に予測した6つのオートファジー関連長非コードRNA(ARLs)シグネチャを同定し,免疫応答とARLs予後シグネチャの間の関係を調べた。加えて,骨肉腫組織と健康な組織の間で差次的に発現した30のARGsを得て,それらの上で機能的濃縮分析を行った。予後関連ARGのスクリーニングのため,単変量およびLASSO Cox回帰分析を連続して適用した。次に,多変量回帰分析を用いて,ARGsの予後署名を完成させた。リスクスコアに基づき,リスクスコアを計算し,患者を分類した。生存分析は,高リスク患者が予後不良で進化することを示した。そして,GSE21257コホートにおける予後モデルを検証した。最後に,qRT-PCRとウェスタンブロットによって検証を行い,遺伝子の発現を測定した。結果は,オートファジー関連マーカーモデルが骨肉腫に対する新しい治療および診断標的を提供することを示す。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 回帰分析 ,  データベース ,  *RNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  免疫反応 ,  薬物耐性 ,  子供 ,  *骨肉腫 ,  予後 ,  母集団 ,  *バイオマーカー ,  *オートファジー
準シソーラス用語： 悪性腫瘍 ,  予後不良 ,  リスクスコア , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 骨肉腫 ,  オートファジー ,  lncRNA ,  予後シグネチャ ,  バイオマーカー

分類 (2件)： 抗腫よう薬の基礎研究  (GW16010A) ,  細胞生理一般  (EF02010S)

引用文献 (51件)：

• An H.-K., Chung K. M., Park H., Hong J., Gim J.-E., Choi H., et al (2020). CASP9 (caspase 9) is essential for autophagosome maturation through regulation of mitochondrial homeostasis. Autophagy 16 1598-1617. doi: 10.1080/15548627.2019.1695398
• Ballatori S. E., Hinds P. W. (2016). Osteosarcoma: prognosis plateau warrants retinoblastoma pathway targeted therapy. Signal Trans. Target. Therapy 1:16001. doi: 10.1038/sigtrans.2016.1
• Bartonicek N., Maag J. L. V., Dinger M. E. (2016). Long noncoding RNAs in cancer: mechanisms of action and technological advancements. Mol. Cancer 15:43. doi: 10.1186/s12943-016-0530-6
• Boya P., Reggiori F., Codogno P. (2013). Emerging regulation and functions of autophagy. Nat. Cell Biol. 15 713-720. doi: 10.1038/ncb2788
• Brown H. K., Tellez-Gabriel M., Heymann D. (2017). Cancer stem cells in osteosarcoma. Cancer Lett. 386 189-195. doi: 10.1016/j.canlet.2016.11.019

タイトルに関連する用語 (7件)： 骨肉腫 ,  生存 ,  予測 ,  バイオマーカー ,  オートファジー関連遺伝子 ,  長鎖非コードRNA ,  シグネチャー