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J-GLOBAL ID：202102226635904975   整理番号：21A0522523

ザクロ(Punica granatum L.)におけるTALE遺伝子ファミリーのゲノムワイド同定と発現解析【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide Identification and Expression Analysis of TALE Gene Family in Pomegranate (Punica granatum L.)

著者 (12件)： Wang Yuying (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Wang Yuying (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Zhao Yujie (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Zhao Yujie (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Yan Ming (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Yan Ming (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Zhao Honglian (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Zhao Honglian (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Zhang Xinhui (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Zhang Xinhui (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Yuan Zhaohe (Co-Innovation Center for Sustainable Forestry in Southern China, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China) ,  Yuan Zhaohe (College of Forestry, Nanjing Forestry University, Nanjing 210037, China)
資料名： Agronomy (Web)  (Agronomy (Web))
巻： 10  号： 6  ページ： 829  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7129A  ISSN： 2073-4395  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 3アミノ酸ループ伸長(TALE)遺伝子ファミリーは,花器官の発達,花分裂組織形成,器官形態形成および果実発育を調節する重要な転写因子である。ザクロTALEファミリーの全部で17の遺伝子を同定し,バイオインフォマティクス法によりザクロで分析し,それはザクロTALEファミリー遺伝子の機能研究と利用の理論的基礎を提供した。結果は,PgTALEファミリー遺伝子が8つの亜科(KNOX-I,KNOX-III,BELL-IV,BELL-V)に分割されたことを示した。”PgTALEファミリー遺伝子”は,8つのサブファミリー(KNOX-I,KNOX-III,BELL-IV,およびBELL-V)に分けられた。すべてのPgTALEはKNOXドメインまたはBELLドメインを有し,それらの構造は保存的であった。1500bpプロモーター配列はホルモン(オーキシン,ジベレリン)および非生物的ストレスに応答して複数のシスエレメントを持ち,PgTALEの大部分はザクロおよびストレスの成長および発達に関与することを示した。機能予測および蛋白質-蛋白質ネットワーク分析は,PgTALEが頂端分裂組織,花,カープスおよび胚珠の発生の調節に関与することを示した。遺伝子発現パターンの解析は,ザクロTALE遺伝子ファミリーが特定の組織発現特異性を有することを示した。結論として,ザクロで得られたTALE遺伝子の知識は,他の果実にも適用可能である。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  オーキシン ,  タンパク質 ,  ホルモン ,  形態形成 ,  プロモーター領域 ,  分裂組織 ,  果実【器官】 ,  転写因子
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  ドメイン構造 ,  胚珠 ,  シスエレメント ,  非生物的ストレス ,  *遺伝子ファミリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： ザクロ ,  TALE遺伝子ファミリー ,  生物情報学 ,  発現解析

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (69件)：

• Di Giacomo, E.; Iannelli, M.A.; Frugis, G. TALE and shape: How to make a leaf different. Plants 2013, 2, 317-342.
• Billeter, M.; Qian, Y.Q.; Otting, G.; Müller, M.; Gehring, W.; Wüthrich, K. Determination of the nuclear magnetic resonance solution structure of an Antennapedia homeodomain-DNA complex. J. Mol. Biol. 1993, 234, 1084-1097.
• Bharathan, G.; Janssen, B.J.; Kellogg, E.A. Did homeodomain proteins duplicate before the origin of angiosperms, fungi, and metazoa? Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1997, 94, 13749-13753.
• Mukherjee, K.; Brocchieri, L.; Bürglin, T.R. A Comprehensive classification and evolutionary analysis of plant homeobox genes. Mol. Biol. Evol. 2009, 26, 2775-2794.
• Bürglin, T.R.; Affolter, M. Homeodomain proteins: An update. Chromosoma 2016, 125, 497-521.

タイトルに関連する用語 (6件)： ザクロ ,  Punica ,  遺伝子ファミリー ,  ゲノム ,  同定 ,  発現解析