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J-GLOBAL ID：202102226790302617   整理番号：21A0211648

癌におけるlet-7とmiR-10遺伝子ファミリーからのmiRNAイソ型(isomiRs)間の再ワイヤ機能調節ネットワーク【JST・京大機械翻訳】

Rewired functional regulatory networks among miRNA isoforms (isomiRs) from let-7 and miR-10 gene families in cancer

著者 (3件)： Liang Tingming (Jiangsu Key Laboratory for Molecular and Medical Biotechnology, School of Life Science, Nanjing Normal University, Nanjing 210023, China) ,  Han Leng (Department of Biochemistry and Molecular Biology, The University of Texas Health Science Center at Houston McGovern Medical School, Houston, TX 77030, USA) ,  Guo Li (Department of Bioinformatics, Smart Health Big Data Analysis and Location Services Engineering Lab of Jiangsu Province, School of Geographic and Biologic Information, Nanjing University of Posts and Telecommunications, Nanjing, China)
資料名： Computational and Structural Biotechnology Journal  (Computational and Structural Biotechnology Journal)
巻： 18  ページ： 1238-1248  発行年： 2020年 
JST資料番号： W3522A  ISSN： 2001-0370  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 古典的マイクロRNA(miRNA)はこれまで単一配列として信じられてきたが,種々の配列と発現パターンを持つ複数のmiRNAイソ型(isomiR)を含む。これらの多様なイソmiRが潜在的関係を有し,それらがmiRNA:mRNA相互作用に寄与するかどうかは明らかではない。ここでは,染色体上でクラスタ化する傾向があるlet-7およびmiR-10遺伝子ファミリーに基づく複数のイソmiRの潜在的進化および機能的関係を明らかにすることを目的にした。遺伝子ファミリー内の複数のイソmiRは,それらの正準miRNAと同様の機能を示し,優勢な配列の選択を示した。新規種子領域を含むIsomiRsは,それらの注釈付け種子より,それらが,より多くの/より少ない特異的標的mRNAを持つかどうかに依存して,増加した/減少した生物学的機能を示した。遺伝子オントロジー(GO)用語および遺伝子およびゲノム(KEGG)経路の京都エンシクロペディアは,注釈付き種子および新規種子の標的遺伝子間で共有された。新規種子領域を有する種々のlet-7イソmiRは,それらが同じmiRNA遺伝子座から発生し,高度に類似した配列を持つという事実にもかかわらず,反対の薬物応答を引き起こすかもしれない。IsomiRs,特にシフトした種子を持つ優勢なイソmiRは,コード非コードRNA調節ネットワークを乱す可能性がある。これらの知見は,癌の病因における遺伝子発現の複数のイソmiRとイソmiR媒介制御への洞察を提供する。Copyright 2021 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  *ネットワーク ,  mRNA ,  *遺伝子 ,  クラスタ化 ,  遺伝子発現 ,  病因 ,  アノテーション
準シソーラス用語： *マイクロRNA ,  非翻訳RNA ,  標的遺伝子 ,  *遺伝子調節ネットワーク ,  遺伝子オントロジー ,  *遺伝子ファミリー ,  遺伝子発現パターン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： マイクロRNA(miRNA) ,  IsomiR ,  Let-7 ,  miR-10 ,  ネットワーク ,  機能

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： 癌 ,  let-7 ,  遺伝子ファミリー ,  miRNA ,  イソ型 ,  ワイヤ ,  調節ネットワーク