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J-GLOBAL ID：202102228878279128   整理番号：21A0099494

健常者におけるエピゲノムワイド関連研究はDNAメチル化とPBMC抽出物VEGF-A濃度との重要な関連性を同定する【JST・京大機械翻訳】

Epigenome-wide association study in healthy individuals identifies significant associations with DNA methylation and PBMC extract VEGF-A concentration

著者 (13件)： Gorenjak Vesna (IGE-PCV, Inserm, Universite de Lorraine, Nancy, France) ,  Vance Dwaine R. (Randox Laboratories Limited, Crumlin, Co. Antrim, UK) ,  Dade Sebastien (IGE-PCV, Inserm, Universite de Lorraine, Nancy, France) ,  Stathopoulou Maria G. (IGE-PCV, Inserm, Universite de Lorraine, Nancy, France) ,  Doherty Lauren (Randox Laboratories Limited, Crumlin, Co. Antrim, UK) ,  Xie Ting (IGE-PCV, Inserm, Universite de Lorraine, Nancy, France) ,  Murray Helena (Randox Laboratories Limited, Crumlin, Co. Antrim, UK) ,  Masson Christine (IGE-PCV, Inserm, Universite de Lorraine, Nancy, France) ,  Lamont John (Randox Laboratories Limited, Crumlin, Co. Antrim, UK) ,  Fitzgerald Peter (Randox Laboratories Limited, Crumlin, Co. Antrim, UK) ,  Visvikis-Siest Sophie (IGE-PCV, Inserm, Universite de Lorraine, Nancy, France) ,  Visvikis-Siest Sophie (Department of Internal Medicine and Geriatrics, CHU Technopole Nancy-Brabois, Nancy, France) ,  Visvikis-Siest Sophie (INSERM UMR U1122, IGE-PCV, Faculte de Pharmacie-Universite de Lorraine, Nancy, France)
資料名： Clinical Epigenetics (Web)  (Clinical Epigenetics (Web))
巻： 12  号： 1  ページ： 1-11  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7316A  ISSN： 1868-7083  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 血管内皮成長因子A(VEGF-A)は血管内皮細胞の増殖と移動を誘導するケモカインであり,生理学的および病理学的血管新生の両方に必須である。それは,その高い遺伝率(>60%)と最も一般的な疾患への関与が知られており,潜在的に興味深いバイオマーカーとなっている。大規模GWAS研究は既にVEGF-Aに関連する多型を評価した。しかし,以前の研究は,VEGF-Aの調節におけるエピゲノムワイド洞察を提供しなかった。STANISLAS家族研究(n=201)からの健康参加者のVEGF-A濃度を,DNAメチル化との関連について包括的に評価した。全ゲノムDNAメチル化プロファイルを450K Infinium BeadChipアレイ(Illumina)を用いて全血DNAで測定した。PBMC抽出物中のVEGF-A濃度を高感度多重サイトカインアレイ(Randox Laboratories,UK)を用いて検出した。エピゲノムワイド関連解析により,PBMC抽出物由来のVEGF-A濃度と有意に関連する41のメチル化部位を同定した。13の染色体内の20のCpG部位がHolm-Bonferroni有意性に達した。有意な値はP=1.08×10-7からP=5.64×1015の範囲であった。本研究はDNAメチル化をVEGF-A濃度に連結する20の重要なCpG部位を曝露させた。TPX2とHAS-1のようなプロモーター領域で検出されたメチル化は,VEGFA遺伝子との以前に報告された関連を説明することができた。メチル化は,検出されたCpG部位近傍に位置する他の遺伝子の調節機構の理解にも役立つ。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *メチル化 ,  *DNA【核酸】 ,  *ゲノム ,  プロモーター領域 ,  血管新生 ,  バイオマーカー ,  *VEGF ,  ケモカイン ,  血管内皮細胞 ,  ゲノムワイド関連解析
準シソーラス用語： *VEGFA ,  *DNAメチル化 ,  関連解析 ,  CpG ,  全血 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： EWAS ,  VEGF ,  メチル化 ,  エピジェネティクス

分類 (5件)： 生物学的機能  (EB03040U) ,  基礎腫よう学一般  (GE02010R) ,  細胞分裂・増殖  (EF02020D) ,  腫ようの薬物療法  (GE03032C) ,  消化器の腫よう  (GH04000D)

引用文献 (53件)：

• Cell.; Epigenetics: a landscape takes shape; AD Goldberg, CD Allis, E Bernstein; 128; 4; 2007; 635-638; 10.1016/j.cell.2007.02.006; citation_id=CR1
• Nat Rev Genet; Functions of DNA methylation: islands, start sites, gene bodies and beyond; PA Jones; 13; 7; 2012; 484-492; 10.1038/nrg3230; citation_id=CR2
• Circulation.; Epigenetic modifications: basic mechanisms and role in cardiovascular disease; DE Handy, R Castro, J Loscalzo; 123; 19; 2011; 2145-2156; 10.1161/CIRCULATIONAHA.110.956839; citation_id=CR3
• Esteller M. Epigenetic gene silencing in cancer: the DNA hypermethylome. Hum Mol Genet. 2007;16 Spec No 1:R50-9.
• Nat Biotechnol; Epigenetic modifications and human disease; A Portela, M Esteller; 28; 10; 2010; 1057-1068; 10.1038/nbt.1685; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (9件)： 健常者 ,  エピゲノム ,  研究 ,  DNAメチル化 ,  PBMC ,  抽出物 ,  VEGF-A ,  関連性 ,  同定