文献

J-GLOBAL ID：202102229000226638   整理番号：21A0092202

異質四倍体カエルXenopus laevisにおける倍数体化および偽遺伝子化は高等脊椎動物におけるアクアポリンファミリーの進化を促進する【JST・京大機械翻訳】

Polyploidization and pseudogenization in allotetraploid frog Xenopus laevis promote the evolution of aquaporin family in higher vertebrates

著者 (2件)： Jia Yanglei (Fishery College of Zhejiang Ocean University, Key Laboratory of Marine Fishery Equipment and Technology of Zhejiang, Zhoushan, China) ,  Liu Xiao (Fishery College of Zhejiang Ocean University, Key Laboratory of Marine Fishery Equipment and Technology of Zhejiang, Zhoushan, China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 21  号： 1  ページ： 1-20  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 主要な内因性蛋白質(MIP)スーパーファミリーのメンバーとしてのアクアポリン(AQP)は,水および他の溶質の透過を促進し,複数の生物学的過程に関与する。AQPファミリーはほとんど全ての生物に存在し,ゲノムワイド重複による分類と機能の両方で脊椎動物で高度に多様化している。一方,いくつかのAQPオーソログは進化を通してより高い脊椎動物で失われた。ゲノムアセンブリに基づく同種異数体カエルXenopus laevis(Xla)と二倍体カエルXenopus tropicalis(Xtr)間のAQPファミリーのゲノムワイド比較分析は,XlaゲノムにおけるAQPの数がXtr(32対19)でほぼ2倍になったことを明らかにした。シンテニー分析はXlaサブゲノム(Xla.Lにおける17,Xlaゲノムのより長いホメオログおよびXla.Sにおける15,Xlaゲノムのより短いホメオログ)における保持AQPの分布はXtrゲノムにおけるそれと比較して高度に対称性であることを示した。注目すべきことに,Xlaの2つのメンバー。XlaのLと4つのメンバー。Sは進化を通して失われた。ブラスト分析は,Xlaにおける失われたAQPが,いくつかのエキソンの欠失またはいくつかの単一ヌクレオチド挿入または読み取り枠シフトをもたらす欠失のどちらかを介して偽造されることを明らかにした。さらに,比較ゲノム解析は,Xlaに1コピーがないAQPのオーソログも,より高い脊椎動物で失われる傾向があることを示唆した。本研究は,Xlaゲノムにおける倍数体化とその後の偽遺伝子化および欠失が,より高い脊椎動物におけるAQPファミリーの進化を促進することを明らかにした。さらに,著者らの結果はAQPファミリーの進化の理解に寄与するであろう。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 対称性 ,  *脊椎動物 ,  タンパク質 ,  ヌクレオチド ,  ゲノム ,  溶質 ,  *アフリカツメガエル ,  *四倍体 ,  二倍体 ,  *偽遺伝子 ,  異数体 ,  *水チャンネル
準シソーラス用語： シンテニー ,  オルソログ ,  *倍数体化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： アクアポリン ,  両生類 ,  アフリカツメガエル ,  倍数体化 ,  遺伝子重複 ,  偽造 ,  進化

分類 (1件)： 細胞膜の輸送  (EF04020R)

引用文献 (53件)：

• Am J Physiol Regul Integr Comp Physiol; The evolutionary aspects of aquaporin family; K Ishibashi, S Kondo, S Hara, Y Morishita; 300; 3; 2011; R566-R576; citation_id=CR1
• Angew Chem Int Ed; Aquaporin water channels (Nobel lecture); P Agre; 43; 33; 2004; 4278-4290; citation_id=CR2
• J Biol Chem; Molecular structure of the water channel through aquaporin CHIP: the hourglass model; JS Jung, GM Preston, BL Smith, WB Guggino, P Agre; 269; 20; 1994; 14648-14654; citation_id=CR3
• J Clin Investig; Aquaporin water channels: atomic structure and molecular dynamics meet clinical medicine; D Kozono, M Yasui, LS King, P Agre; 109; 11; 2002; 1395; citation_id=CR4
• Science; Water permeation across biological membranes: mechanism and dynamics of aquaporin-1 and GlpF; BLD Groot, H Grubmüller; 294; 5550; 2001; 2353-2357; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (9件)： カエル ,  Xenopus ,  倍数体化 ,  偽遺伝子 ,  脊椎動物 ,  アクアポリン ,  ファミリー ,  進化 ,  促進