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J-GLOBAL ID：202102230151965963   整理番号：21A0825874

神経芽腫細胞株における環状RNAの包括的特性化【JST・京大機械翻訳】

Comprehensive Characterization of Circular RNAs in Neuroblastoma Cell Lines

著者 (15件)： Zhang Li (Big Data and Engineering Research Center, Beijing Children’s Hospital, Capital Medical University, National Center for Children’s Health, Beijing, China) ,  Zhang Li (Beijing Advanced Innovation Center for Big Data-Based Precision Medicine, Beihang University & Capital Medical University, Beijing, China) ,  Zhang Li (Key Laboratory of Advanced Theory and Application in Statistics and Data Science-MOE, School of Statistics, East China Normal University, Shanghai, China) ,  Zhang Li (The authors contributed equally to this paper.) ,  Zhou Hangyu (Department of Clinical Laboratory, Dongzhimen Hospital Beijing University of Chinese Medicine, Beijing, China) ,  Zhou Hangyu (The authors contributed equally to this paper.) ,  Li Jing (Department of Neurosurgery, Huai’an Second People’s Hospital, the Affiliated Huai’an Hospital of Xuzhou Medical University, Huai’an, China) ,  Li Jing (The authors contributed equally to this paper.) ,  Wang Xinyu (Big Data and Engineering Research Center, Beijing Children’s Hospital, Capital Medical University, National Center for Children’s Health, Beijing, China) ,  Wang Xinyu (Beijing Advanced Innovation Center for Big Data-Based Precision Medicine, Beihang University & Capital Medical University, Beijing, China) ,  Zhang Xin (Big Data and Engineering Research Center, Beijing Children’s Hospital, Capital Medical University, National Center for Children’s Health, Beijing, China) ,  Zhang Xin (Beijing Advanced Innovation Center for Big Data-Based Precision Medicine, Beihang University & Capital Medical University, Beijing, China) ,  Shi Tieliu (Center for Bioinformatics and Computational Biology, and the Institute of Biomedical Sciences, School of Life Sciences, East China Normal University, Shanghai, China) ,  Feng Guoshuang (Big Data and Engineering Research Center, Beijing Children’s Hospital, Capital Medical University, National Center for Children’s Health, Beijing, China) ,  Feng Guoshuang (Beijing Advanced Innovation Center for Big Data-Based Precision Medicine, Beihang University & Capital Medical University, Beijing, China)
資料名： Technology in Cancer Research & Treatment  (Technology in Cancer Research & Treatment)
巻： 19  ページ： 1533033820957622  発行年： 2020年 
JST資料番号： W5400A  ISSN： 1533-0346  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 神経芽細胞腫(NB)はまれな型の癌であるが,小児でしばしば発生する。しかし,円形RNA(circRNA)がNB腫瘍形成または進行において重要な役割を果たすかどうかはまだ不明である。本研究では,39の神経芽細胞腫と2つの正常細胞株を横断して39,022のcircRNAを同定した。遺伝子とcircRNA発現データで,NB細胞株を分類し,3NBクラスにおける機能的サーコRNAを同定した。特に,29のサーコRNAはNBクラスで調節不全であることを見出した。特に,MYCN増幅領域内に位置する7つのcircRNAは,MYC標的とMYCN増幅の高い活性を持つ細胞株でアップレギュレートされ,それらの親遺伝子,NBASの発現と高度に相関した。続いて,機能的circRNAに対するceRNAネットワークを構築した。特に,hsa_circ0005379は,複雑な競合内因性RNA(ceRNA)ネットワークを形成する13の遺伝子を標的とすることにより,ceRNAネットワークにおける重要な調節因子として同定された。さらに,hsa_circ_0002343は,少数の遺伝子と結合し,RAC1を介してPI3K/Akt/mTORシグナル伝達を調節する可能性がある。さらに,上皮間葉移行(EMT)に関与するNOTCH2,SERPINH1,およびLAMC1を含む3つの遺伝子は,hsa_cir_0001361と接続することが観察されたが,このことは,この循環RNAがEMTと密接に関連することを示唆する。その結果,DAD1,PPIA,NOTCH2,PGK1,BUB1,EIF2S1,およびTCF7L2のような7つの遺伝子は,無イベント生存(EFS)と全生存(OS)の両方に密接に関連していることがわかった。結論として,本研究は,機能的circRNAを同定し,神経芽細胞腫細胞株におけるそれらの機能性を予測し,神経芽細胞腫におけるサーコRNAの理解を改善するだけでなく,関連研究者に対する証拠も提供した。Copyright The Author(s) 2020 Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ネットワーク ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  子供 ,  キャラクタリゼーション ,  *神経芽腫 ,  細胞情報伝達 ,  腫瘤形成 ,  ホスファチジルイノシトール3-キナーゼ
準シソーラス用語： *細胞株 ,  MYCN ,  調節因子 ,  上皮間葉転換 ,  機能性 ,  TCF7L2遺伝子 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 神経芽細胞腫(NB) ,  環状RNA ,  細胞株 ,  競合する内因性RNAネットワーク ,  上皮間葉転換(EMT)

分類 (2件)： 神経系の腫よう  (GN04000V) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

タイトルに関連する用語 (4件)： 神経芽腫 ,  細胞株 ,  環状RNA ,  特性化