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J-GLOBAL ID：202102230311119850   整理番号：21A0828470

Drosophila細胞における核小体の全ゲノム接触の動力学は全体的なエピジェネティック調節におけるrDNA遺伝子の役割を示唆する【JST・京大機械翻訳】

Dynamics of Whole-Genome Contacts of Nucleoli in Drosophila Cells Suggests a Role for rDNA Genes in Global Epigenetic Regulation

著者 (8件)： Tchurikov Nickolai A. ,  Klushevskaya Elena S. ,  Fedoseeva Daria M. ,  Alembekov Ildar R. ,  Kravatskaya Galina I. ,  Chechetkin Vladimir R. ,  Kravatsky Yuri V. ,  Kretova Olga V.
資料名： Cells (Web)  (Cells (Web))
巻： 9  号： 12  ページ： 2587  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7155A  ISSN： 2073-4409  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 染色体は遺伝子発現と分化の調節に重要な3D構造に組織化される。染色体間接触の形成における重要な役割は,核小体を構成するrDNAクラスターを果たす。分化の過程で,マウス細胞におけるrDNA単位のヘテロクロマチン化は,異なる遺伝子の抑制または活性化と共役する。さらに,ヒト細胞の核小体は分化と癌に関与する遺伝子との直接接触を形成する。ここでは,rDNAクラスターが頻繁に接触する領域に位置する遺伝子を同定し,分類した。4Cアプローチを用いて,ショウジョウバエS2細胞において,rDNAクラスターが染色体組織化と分化に関与する遺伝子との接触を形成することを示した。熱ショック処理は,形態形成を制御する核小体と数百の遺伝子間の接触の変化を誘導する。核小体は活性または抑制性ヒストンマークを豊富にし,小さな非コードRNAをマッピングする領域と接触することを示した。これらのデータは,rDNAの接触が遺伝子発現の抑制と活性化に関与し,rDNAクラスターが分化に関与するショウジョウバエ遺伝子の大きなグループを調整することを示す。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  クロマチン ,  染色体 ,  ヒト ,  分化 ,  クラスタ ,  形態形成 ,  熱刺激 ,  *ショウジョウバエ ,  三次元 ,  ヘテロクロマチン ,  遺伝子発現 ,  *エピジェネティクス
準シソーラス用語： *リボソームDNA ,  非翻訳RNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (8件)： rDNAクラスター ,  4C ,  遺伝子オントロジー ,  クロマチンマーク ,  エピジェネティクス ,  開発 ,  分化 ,  熱ショック

分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (49件)：

• Dixon, J.R.; Selvaraj, S.; Yue, F.; Kim, A.; Li, Y.; Shen, Y.; Hu, M.; Liu, J.S.; Ren, B. Topological domains in mammalian genomes identified by analysis of chromatin interactions. Nature 2012, 485, 376-380.
• Rao, S.S.P.; Huntley, M.H.; Durand, N.C.; Stamenova, E.K.; Bochkov, I.D.; Robinson, J.T.; Adrian, L.; Sanborn, A.L.; Machol, I.; Omer, A.D.; et al. A 3D map of the human genome at kilobase resolution reveals principles of chromatin looping. Cell 2014, 159, 1665-1680.
• Paulsen, J.; Ali, T.M.L.; Nekrasov, M.; Delbarre, E.; Baudement, M.-O.; Kurscheid, S.; Tremethick, D.; Collas, P. Long-range interactions between topologically associating domains shape the four-dimensional genome during differentiation. Nat. Genet. 2019, 51, 835-843.
• Sarnataro, S.; Chiariello, A.M.; Esposito, A.; Prisco, A.A.; Nicodemi, M. Structure of the human chromosome interaction network. PLoS ONE 2017, 12, e0188201.
• Ananiev, E.V.; Barsky, V.E.; Ilyin, Y.V.; Churikov, N.A. Localization of nucleoli in Drosophila melanogaster polytene chromosomes. Chromosoma 1981, 81, 619-628.

タイトルに関連する用語 (10件)： Drosophila ,  細胞 ,  核小体 ,  ゲノム ,  動力学 ,  エピジェネティック ,  調節 ,  rDNA ,  遺伝子 ,  役割