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J-GLOBAL ID：202102231515105979   整理番号：21A0721899

構造研究最適化のためのKir3.1-KirBac1.3キメラのCodonペルメアーゼ【JST・京大機械翻訳】

Codon Harmonization of a Kir3.1-KirBac1.3 Chimera for Structural Study Optimization

著者 (5件)： Aalst Evan Van (Department of Chemistry and Biochemistry, Texas Tech University, Lubbock, TX 79423, USA) ,  Yekefallah Maryam (Department of Chemistry and Biochemistry, Texas Tech University, Lubbock, TX 79423, USA) ,  Mehta Anil K. (National High Magnetic Field Laboratory and McKnight Brain Institute, University of Florida, Box 10015, Gainesville, FL 32610, USA) ,  Eason Isaac (Department of Chemistry and Biochemistry, Texas Tech University, Lubbock, TX 79423, USA) ,  Wylie Benjamin (Department of Chemistry and Biochemistry, Texas Tech University, Lubbock, TX 79423, USA)
資料名： Biomolecules (Web)  (Biomolecules (Web))
巻： 10  号： 3  ページ： 430  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7148A  ISSN： 2218-273X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 機能的,折りたたみ,および同位体的に濃縮した膜蛋白質の発現は,核磁気共鳴(NMR)研究に対するボトルネックである。実際,歴史的に,蛋白質収率最適化は,多くの複雑な真核生物膜蛋白質のNMR分析を可能にするのに不十分であった。しかしながら,最近の研究は,プラスミドコドンの操作が,成功したNMR-フレンドリーな蛋白質産生のオッズを改善することを見出した。過去10年間,多数の研究は,組換え遺伝子配列におけるコドン利用パターンを,天然配列におけるそれらと整合するのは,蛋白質収量の増加と正に相関していることを示している。この現象,dubbedコドン調和は,構造研究のための困難な膜蛋白質の組換え発現の最適化における強力なツールである可能性がある。ここでは,この技術を内向き整流K+チャネル(Kir)3.1-KirBac1.3キメラに適用した。Kir3.1はG蛋白質共役内向き整流K+(GIRK)チャンネルファミリー内にあり,従ってNMR研究はそのG蛋白質,脂質および小分子リガンドの存在および非存在下でGIRKゲーティング作用の nuさに情報を与える。著者らの手で,調和したプラスミドは,従来の完全コドン最適化構築物と比較して,蛋白質収量をほぼ2倍増加させた。次に,蛍光に基づく機能アッセイと固体NMR相関分光法を用いて,最終蛋白質産物が折畳まれ,機能的であることを示した。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： NMR【磁気共鳴】 ,  蛍光 ,  *最適化 ,  共役 ,  コドン ,  脂質 ,  タンパク質 ,  タンパク質合成 ,  *キメラ ,  プラスミド ,  機能分析 ,  真核生物 ,  *パーミアーゼ ,  小分子
準シソーラス用語： リガンド , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： コドンの調和 ,  核磁気共鳴(NMR) ,  コドンバイアス ,  蛋白質折畳み ,  蛋白質発現 ,  K+チャネル

分類 (1件)： 遺伝子操作  (EC02050B)

引用文献 (75件)：

• Liu, J.; Liu, C.; Fan, Y.; Munro, R.A.; Ladizhansky, V.; Brown, L.S.; Wang, S. Sparse (13)C labelling for solid-state NMR studies of P. pastoris expressed eukaryotic seven-transmembrane proteins. J. Biomol. NMR 2016, 65, 7-13.
• Fan, Y.; Emami, S.; Munro, R.; Ladizhansky, V.; Brown, L.S. Isotope labeling of eukaryotic membrane proteins in yeast for solid-state NMR. Methods Enzymol. 2015, 565, 193-212.
• Ali, R.; Clark, L.D.; Zahm, J.A.; Lemoff, A.; Ramesh, K.; Rosenbaum, D.M.; Rosen, M.K. Improved strategy for isoleucine (1)H/(13)C methyl labeling in Pichia pastoris. J. Biomol. NMR 2019, 73, 687-697.
• Clark, L.; Dikiy, I.; Rosenbaum, D.M.; Gardner, K.H. On the use of Pichia pastoris for isotopic labeling of human GPCRs for NMR studies. J. Biomol. NMR 2018, 71, 203-211.
• Tuller, T.; Carmi, A.; Vestsigian, K.; Navon, S.; Dorfan, Y.; Zaborske, J.; Pan, T.; Dahan, O.; Furman, I.; Pilpel, Y. An evolutionarily conserved mechanism for controlling the efficiency of protein translation. Cell 2010, 141, 344-354.

タイトルに関連する用語 (4件)： 研究 ,  最適化 ,  キメラ ,  ペルメアーゼ